34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1919 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_1919  amidohydrolase 2  100 
 
 		 292 aa  596  1e-169  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.414859  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1795  amidohydrolase 2  37.89 
 
 		 294 aa  207  1e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.000138778  normal  0.838674 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3079  metal-dependent hydrolase of the TIM-barrel fold- like protein  34.21 
 
 		 278 aa  66.6  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.160711  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1073  amidohydrolase 2  31.06 
 
 		 275 aa  59.3  0.00000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.270435  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43770  predicted protein  26.06 
 
 		 327 aa  55.8  0.0000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.02958  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5107  amidohydrolase 2  32.08 
 
 		 258 aa  55.8  0.0000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.433963  normal  0.583494 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2759  amidohydrolase 2  26.85 
 
 		 245 aa  50.1  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.457931  normal  0.0590433 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0337  amidohydrolase 2  24.5 
 
 		 288 aa  49.7  0.00006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0339  amidohydrolase 2  26.24 
 
 		 324 aa  49.3  0.00007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0925  putative transducer (chemotactic transducer pcta)  23.37 
 
 		 263 aa  49.3  0.00008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00204533  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3428  amidohydrolase 2  23.03 
 
 		 309 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1655  putative amidohydrolase  37.37 
 
 		 294 aa  47.8  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4678  amidohydrolase 2  36 
 
 		 289 aa  47.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1397  amidohydrolase 2  36 
 
 		 289 aa  47  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.70619  normal  0.985512 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1417  amidohydrolase 2  36 
 
 		 289 aa  47  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1607  amidohydrolase 2  28.57 
 
 		 332 aa  46.2  0.0006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1611  amidohydrolase 2  26.61 
 
 		 299 aa  46.2  0.0007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0275  amidohydrolase 2  24.86 
 
 		 287 aa  45.8  0.0009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.0000138051  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1256  amidohydrolase 2  31.03 
 
 		 283 aa  45.1  0.001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00133666  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4140  amidohydrolase 2  26.2 
 
 		 261 aa  45.4  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0995  amidohydrolase 2  24.63 
 
 		 287 aa  44.7  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4198  amidohydrolase 2  26.82 
 
 		 293 aa  44.7  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.200057  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0364  amidohydrolase 2  22.22 
 
 		 312 aa  43.9  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0855  amidohydrolase 2  25.19 
 
 		 280 aa  43.9  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000589459  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0606  amidohydrolase 2  37.14 
 
 		 291 aa  43.9  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.47355 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4417  amidohydrolase 2  24.74 
 
 		 286 aa  43.9  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4401  amidohydrolase 2  37.14 
 
 		 288 aa  43.9  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.400198  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0638  amidohydrolase 2  24.24 
 
 		 300 aa  43.5  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2871  amidohydrolase 2  25.35 
 
 		 289 aa  43.1  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3997  amidohydrolase 2  23.64 
 
 		 308 aa  42.7  0.008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.169426  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2151  amidohydrolase 2  25.08 
 
 		 267 aa  42.4  0.009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4537  amidohydrolase 2  37.5 
 
 		 295 aa  42.4  0.009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.136824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2763  amidohydrolase 2  28.49 
 
 		 244 aa  42.4  0.01  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.165032  normal  0.0238203 
 
 
-
 
NC_002936  DET1455  hypothetical protein  32.56 
 
 		 282 aa  42.4  0.01  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00169486  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>