More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0137 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_0137  ATP-grasp domain-containing protein  100 
 
 
253 aa  509  1e-143  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000107315  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3834  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  46.15 
 
 
696 aa  186  3e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000102381 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1246  CoA-binding domain-containing protein  46.67 
 
 
753 aa  176  3e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000185124  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0206  CoA-binding domain-containing protein  40.54 
 
 
698 aa  175  7e-43  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0076  acetyl coenzyme A synthetase subunit alpha  40.52 
 
 
698 aa  168  6e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000310794 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4534  CoA-binding domain-containing protein  40.34 
 
 
698 aa  166  2e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3063  CoA-binding domain-containing protein  36 
 
 
711 aa  161  8.000000000000001e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0980469  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3750  acetyl coenzyme A synthetase subunit alpha  37.11 
 
 
697 aa  160  2e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0320  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  39.91 
 
 
711 aa  159  3e-38  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0602  CoA-binding domain-containing protein  36.36 
 
 
704 aa  159  3e-38  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5203  CoA-binding  43.06 
 
 
711 aa  158  7e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.136653  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4272  CoA-binding domain protein  37.45 
 
 
921 aa  157  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2544  CoA-binding protein  37.55 
 
 
911 aa  157  2e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.163603  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1784  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  40.85 
 
 
929 aa  155  6e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2466  CoA-binding domain-containing protein  40.64 
 
 
669 aa  154  9e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2081  CoA-binding domain-containing protein  39.04 
 
 
701 aa  153  2e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1407  CoA-binding domain protein  43.13 
 
 
699 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1966  CoA-binding domain-containing protein  33.91 
 
 
712 aa  152  4e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1309  CoA-binding domain-containing protein  35.96 
 
 
705 aa  152  5e-36  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000175905 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3916  putative acetyl-CoA synthetase  44.19 
 
 
703 aa  150  2e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.991862 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5497  CoA-binding domain protein  43.66 
 
 
710 aa  149  5e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.05856  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4556  CoA-binding  42.45 
 
 
715 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.732874  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0380  CoA-binding  39.64 
 
 
707 aa  147  2.0000000000000003e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5094  acyl-CoA synthetase domain-containing protein  42.67 
 
 
718 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.504195 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4362  hypothetical protein  37.93 
 
 
709 aa  146  3e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.138782  normal  0.0457098 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1969  CoA-binding domain-containing protein  36.64 
 
 
893 aa  146  4.0000000000000006e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0683536  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4664  GCN5-related N-acetyltransferase  36.4 
 
 
918 aa  145  7.0000000000000006e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1092  GCN5-related N-acetyltransferase  40.26 
 
 
893 aa  145  7.0000000000000006e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.20314  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5003  CoA-binding domain protein  36.44 
 
 
920 aa  145  7.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2024  long-chain fatty-acid-CoA ligase  36.44 
 
 
892 aa  145  8.000000000000001e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1098  CoA-binding domain-containing protein  38.25 
 
 
706 aa  145  8.000000000000001e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2759  CoA-binding domain-containing protein  39.64 
 
 
729 aa  144  9e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2718  GCN5-related N-acetyltransferase:CoA-binding  34.47 
 
 
905 aa  143  2e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0140591 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1092  hypothetical protein  34.65 
 
 
233 aa  143  2e-33  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4084  CoA-binding domain protein  38.29 
 
 
750 aa  144  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.030706  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1805  hypothetical protein  39.38 
 
 
233 aa  144  2e-33  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.657277  normal  0.0992095 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1525  CoA-binding domain-containing protein  37.14 
 
 
722 aa  142  5e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.193132  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3006  CoA-binding protein  36.29 
 
 
912 aa  141  9e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000257819 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3448  CoA-binding domain-containing protein  35.66 
 
 
898 aa  141  9.999999999999999e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.401225  normal  0.714388 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3178  CoA-binding domain-containing protein  36.43 
 
 
718 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2291  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  35.74 
 
 
699 aa  140  1.9999999999999998e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.494487  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0056  GCN5-related N-acetyltransferase  34.2 
 
 
896 aa  140  1.9999999999999998e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.145927 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2352  GCN5-related N-acetyltransferase  34.2 
 
 
892 aa  139  3e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0485  hypothetical protein  35.4 
 
 
232 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.62536  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0317  CoA-binding domain protein  38.25 
 
 
704 aa  138  8.999999999999999e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.11394 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8714  CoA-binding domain protein  36.52 
 
 
722 aa  137  1e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1347  Acyl-CoA synthetase  34.84 
 
 
696 aa  137  2e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2278  CoA-binding domain protein  37 
 
 
698 aa  136  2e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.244685  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3063  acetyltransferase  36.52 
 
 
897 aa  137  2e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4246  GCN5-related N-acetyltransferase  31.6 
 
 
904 aa  136  3.0000000000000003e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3702  CoA-binding  39.19 
 
 
725 aa  136  3.0000000000000003e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2453  GCN5-related N-acetyltransferase  39.05 
 
 
926 aa  136  3.0000000000000003e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000141408  hitchhiker  0.0047804 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2819  GCN5-related N-acetyltransferase  33.09 
 
 
897 aa  135  5e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.869939 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1862  CoA-binding domain protein  35.06 
 
 
900 aa  135  6.0000000000000005e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.167225  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0554  CoA-binding domain-containing protein  37.05 
 
 
689 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.794682  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0890  CoA-binding domain protein  33.04 
 
 
915 aa  135  6.0000000000000005e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0505  CoA-binding domain protein  40.09 
 
 
887 aa  135  9e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3116  hypothetical protein  33.77 
 
 
713 aa  135  9e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0277399  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4367  pimeloyl-CoA synthetase  39.81 
 
 
715 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.589266  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1471  CoA-binding  35.41 
 
 
687 aa  134  9.999999999999999e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1855  ATP-grasp domain-containing protein  38.57 
 
 
232 aa  134  9.999999999999999e-31  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.678757 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0914  CoA-binding domain-containing protein  34.56 
 
 
687 aa  132  5e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.216851  hitchhiker  0.00000000145434 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2023  GCN5-related N-acetyltransferase  31.6 
 
 
908 aa  132  5e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0872701  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1832  GCN5-related N-acetyltransferase  31.6 
 
 
901 aa  132  6e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.52555  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1742  GCN5-related N-acetyltransferase  36.89 
 
 
903 aa  132  6.999999999999999e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0566  CoA-binding  31.34 
 
 
688 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.9879  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2866  CoA-binding domain protein  38.74 
 
 
697 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0540  GCN5-related N-acetyltransferase  29.37 
 
 
895 aa  130  1.0000000000000001e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0645  CoA-binding domain protein  37.02 
 
 
728 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4813  Acyl-CoA synthetase (NDP forming)-like protein  38.05 
 
 
883 aa  130  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.104591  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4791  CoA-binding  43.38 
 
 
741 aa  130  3e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.369027  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51170  pimeloyl-CoA synthetase  38.97 
 
 
715 aa  130  3e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000001397 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1700  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  40.6 
 
 
699 aa  129  4.0000000000000003e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0863  hypothetical protein  34.27 
 
 
707 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0968097 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1634  hypothetical protein  36.44 
 
 
229 aa  128  8.000000000000001e-29  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.155482  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2327  CoA-binding domain-containing protein  34.27 
 
 
707 aa  128  9.000000000000001e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2228  GCN5-related N-acetyltransferase  35.34 
 
 
893 aa  127  1.0000000000000001e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  unclonable  0.00661786  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1718  CoA-binding domain protein  37.93 
 
 
901 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0895  ATP-grasp domain-containing protein  36.05 
 
 
700 aa  127  1.0000000000000001e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1205  CoA-binding  39.15 
 
 
903 aa  127  2.0000000000000002e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.370285  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0842  CoA-binding  38.5 
 
 
700 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.199193 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1703  CoA-binding domain-containing protein  33.18 
 
 
680 aa  126  3e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1676  GCN5-related N-acetyltransferase  33.62 
 
 
889 aa  126  4.0000000000000003e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0109  hypothetical protein  34.65 
 
 
230 aa  126  4.0000000000000003e-28  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2065  hypothetical protein  37.84 
 
 
897 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.354982 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2420  acetyltransferase  31.54 
 
 
892 aa  125  5e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.773408  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2035  CoA-binding domain protein  38.32 
 
 
727 aa  125  6e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1809  CoA-binding domain-containing protein  37.5 
 
 
710 aa  125  6e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1420  CoA-binding domain-containing protein  34.72 
 
 
702 aa  125  8.000000000000001e-28  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.35616  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1256  CoA-binding domain-containing protein  35.19 
 
 
703 aa  125  9e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.924242  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0700  CoA-binding domain-containing protein  34.26 
 
 
702 aa  125  9e-28  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1513  putative acetyl-CoA synthetase  32.47 
 
 
892 aa  124  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.417267  normal  0.191357 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0586  CoA-binding domain-containing protein  37.82 
 
 
705 aa  124  1e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2131  CoA-binding domain protein  35.34 
 
 
904 aa  124  1e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.131154  normal  0.594511 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2041  CoA-binding domain protein  33.48 
 
 
895 aa  124  2e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.171993  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0708  CoA-binding domain-containing protein  38.1 
 
 
682 aa  124  2e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3724  acyl-CoA synthetase, putative  35.2 
 
 
705 aa  123  3e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.79525  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4122  CoA-binding domain protein  38.68 
 
 
719 aa  123  3e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3477  CoA-binding domain-containing protein  39.81 
 
 
707 aa  122  4e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.025154  normal  0.742177 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1266  CoA-binding domain-containing protein  35.94 
 
 
706 aa  122  4e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>