253 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_1152 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013552  DhcVS_1152  NADPH-dependent FMN reductase  100 
 
 		 190 aa  395  1e-109  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000059068  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1371  NADPH-dependent FMN reductase  94.74 
 
 		 190 aa  380  1e-105  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000814349  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1182  NADPH-dependent FMN reductase  93.16 
 
 		 190 aa  374  1e-103  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.00000000238882  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1392  NADPH-dependent FMN reductase  40.11 
 
 		 201 aa  148  5e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.656565 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0158  NADPH-dependent FMN reductase  37.43 
 
 		 206 aa  140  9.999999999999999e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2817  NADPH-dependent FMN reductase  36.51 
 
 		 194 aa  139  1.9999999999999998e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000358047  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0076  NADPH-dependent FMN reductase  37.04 
 
 		 202 aa  137  1e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.399945  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0309  NADPH-dependent FMN reductase  36.9 
 
 		 212 aa  131  6.999999999999999e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.677573  normal  0.46628 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2732  NADPH-dependent FMN reductase  35.87 
 
 		 209 aa  127  7.000000000000001e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2120  NADPH-dependent FMN reductase  31.94 
 
 		 208 aa  123  1e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0276138  normal  0.10387 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0120  hypothetical protein  33.16 
 
 		 200 aa  120  9.999999999999999e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0077  NADPH-dependent FMN reductase  36.32 
 
 		 208 aa  117  9.999999999999999e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1676  hypothetical protein  31.58 
 
 		 200 aa  117  9.999999999999999e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.225095  hitchhiker  0.000000298375 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0080  NADPH-dependent FMN reductase  34.38 
 
 		 201 aa  115  3e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0303  NADPH-dependent FMN reductase  32.45 
 
 		 199 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.444506 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2849  NADPH-dependent FMN reductase  35.11 
 
 		 192 aa  113  2.0000000000000002e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0133  NADPH-dependent FMN reductase  33.85 
 
 		 191 aa  112  4.0000000000000004e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000492716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0159  NADPH-dependent FMN reductase  33.69 
 
 		 203 aa  109  3e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0166  NADPH-dependent FMN reductase  31.77 
 
 		 196 aa  109  3e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2738  NADPH-dependent FMN reductase  31.89 
 
 		 199 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2733  NADPH-dependent FMN reductase  33.85 
 
 		 204 aa  106  2e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1988  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  32.32 
 
 		 321 aa  106  2e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0292793  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0158  NADPH-dependent FMN reductase  46.85 
 
 		 193 aa  106  2e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0621741 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1677  EIF-4a family ATP-dependent RNA helicase  30 
 
 		 195 aa  104  7e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.42151  hitchhiker  0.000000240044 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0718  NADPH-dependent FMN reductase  45.95 
 
 		 193 aa  104  9e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1744  NADPH-dependent FMN reductase  44.25 
 
 		 193 aa  102  2e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0255848  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0308  NADPH-dependent FMN reductase  32.8 
 
 		 204 aa  102  4e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.471384 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1713  NADPH-dependent FMN reductase  28.8 
 
 		 186 aa  100  1e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0010  NADPH-dependent FMN reductase  41.59 
 
 		 194 aa  99.4  3e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.21951  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0078  NADPH-dependent FMN reductase  44.25 
 
 		 193 aa  97.1  1e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.45768  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0275  NADPH-dependent FMN reductase  32.09 
 
 		 178 aa  93.6  1e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1351  NADPH-dependent FMN reductase  36.92 
 
 		 187 aa  92.8  3e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1378  iron-sulfur flavoprotein  33.63 
 
 		 185 aa  92  5e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1498  NADPH-dependent FMN reductase  40.4 
 
 		 185 aa  91.7  6e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0452  NADPH-dependent FMN reductase  37.86 
 
 		 211 aa  90.9  9e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1822  iron-sulfur flavoprotein  30.85 
 
 		 193 aa  90.9  1e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000643052  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1132  hypothetical protein  40.4 
 
 		 212 aa  90.9  1e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2272  NADPH-dependent FMN reductase  30.77 
 
 		 197 aa  90.5  1e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0374  NADPH-dependent FMN reductase  27.66 
 
 		 188 aa  88.6  5e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.598912  normal  0.4772 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0784  NADPH-dependent FMN reductase  29.03 
 
 		 179 aa  88.2  7e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0163  NADPH-dependent FMN reductase  31.79 
 
 		 195 aa  87.4  1e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1184  NADPH-dependent FMN reductase  36 
 
 		 223 aa  86.3  2e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.44131  normal  0.152042 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18210  NADPH-dependent FMN reductase  28.34 
 
 		 177 aa  85.1  5e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3857  NADPH-dependent FMN reductase  34.62 
 
 		 220 aa  84  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00910864 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1139  NADPH-dependent FMN reductase  26.63 
 
 		 182 aa  84  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.628109  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3773  NADPH-dependent FMN reductase  33.65 
 
 		 220 aa  82.8  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.65168  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0785  iron-sulfur flavoprotein, putative  27.84 
 
 		 207 aa  83.6  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0958732  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0988  NADPH-dependent FMN reductase  28.24 
 
 		 294 aa  82.8  0.000000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.327411  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2997  NADPH-dependent FMN reductase  25.53 
 
 		 184 aa  82.8  0.000000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0315889  normal  0.693807 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1584  NADPH-dependent FMN reductase  39.6 
 
 		 220 aa  82.4  0.000000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0486  NADPH-dependent FMN reductase  31.9 
 
 		 197 aa  82  0.000000000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.260904  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1815  NAD(P)H dehydrogenase (quinone):NADPH-dependent FMN reductase  36.54 
 
 		 224 aa  81.6  0.000000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1320  NADPH-dependent FMN reductase  37.14 
 
 		 179 aa  81.6  0.000000000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.654727  normal  0.0975932 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2330  NADPH-dependent FMN reductase  27.92 
 
 		 224 aa  81.3  0.000000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.490521  normal  0.0193614 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1063  NADPH-dependent FMN reductase  34.48 
 
 		 186 aa  81.3  0.000000000000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0671  NADPH-dependent FMN reductase  29.06 
 
 		 239 aa  80.5  0.00000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.610211 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1035  NADPH-dependent FMN reductase  35.34 
 
 		 186 aa  80.5  0.00000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2261  NADPH-dependent FMN reductase  39.6 
 
 		 222 aa  80.9  0.00000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.224265  normal  0.127615 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0542  iron-sulfur flavoprotein, putative  25.93 
 
 		 204 aa  80.9  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.423785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1131  hypothetical protein  27.72 
 
 		 179 aa  80.5  0.00000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1251  NADPH-dependent FMN reductase  35.34 
 
 		 186 aa  80.1  0.00000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3468  multimeric flavodoxin WrbA family protein  31.18 
 
 		 183 aa  80.1  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.177131  decreased coverage  0.000563166 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0893  NADPH-dependent FMN reductase  29.03 
 
 		 200 aa  80.1  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2856  NADPH-dependent FMN reductase  27.17 
 
 		 210 aa  79.7  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1619  NADPH-dependent FMN reductase  37.37 
 
 		 179 aa  79.3  0.00000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.188909 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0748  iron-sulfur flavoprotein  26.52 
 
 		 195 aa  79  0.00000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.203042 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0130  NADPH-dependent FMN reductase  24.74 
 
 		 224 aa  79  0.00000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1561  NADPH-dependent FMN reductase  36.36 
 
 		 206 aa  78.6  0.00000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000524537 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0455  NADPH-dependent FMN reductase  33.59 
 
 		 204 aa  78.6  0.00000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0622155  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1851  NADPH-dependent FMN reductase  39.64 
 
 		 204 aa  78.2  0.00000000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0492811  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1486  NADPH-dependent FMN reductase  42.42 
 
 		 200 aa  78.2  0.00000000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.756124 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0441  iron-sulfur flavoprotein  26.29 
 
 		 194 aa  78.2  0.00000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2463  hypothetical protein  30.06 
 
 		 202 aa  77.4  0.0000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000389494  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0414  NADPH-dependent FMN reductase  31.72 
 
 		 197 aa  76.6  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2475  NADPH-dependent FMN reductase  34.62 
 
 		 217 aa  76.3  0.0000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.736358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1785  NADPH-dependent FMN reductase  31.31 
 
 		 210 aa  75.9  0.0000000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000137448 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1381  NADPH-dependent FMN reductase  29.71 
 
 		 216 aa  75.5  0.0000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.196943  normal  0.574702 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2991  NADPH-dependent FMN reductase  40.19 
 
 		 185 aa  75.5  0.0000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3414  NADPH-dependent FMN reductase  29.88 
 
 		 186 aa  75.1  0.0000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2580  iron-sulfur flavoprotein  32.69 
 
 		 222 aa  74.7  0.0000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29861  normal  0.0924411 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1743  NADPH-dependent FMN reductase  32.06 
 
 		 214 aa  74.7  0.0000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0755  NADPH-dependent FMN reductase  32.03 
 
 		 213 aa  74.7  0.0000000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.263848  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0408  NADPH-dependent FMN reductase  36.63 
 
 		 225 aa  74.3  0.0000000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2476  NADPH-dependent FMN reductase  32.69 
 
 		 214 aa  73.9  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000689754  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1149  NADPH-dependent FMN reductase  31.31 
 
 		 208 aa  74.3  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.285301  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1505  NADPH-dependent FMN reductase  31.18 
 
 		 197 aa  74.3  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2158  NADPH-dependent FMN reductase  34.31 
 
 		 205 aa  73.9  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3305  iron-sulfur flavoprotein  35.09 
 
 		 222 aa  73.6  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.328284  normal  0.134625 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1442  NADPH-dependent FMN reductase  33.65 
 
 		 217 aa  73.2  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0727  NADPH-dependent FMN reductase  34.62 
 
 		 204 aa  73.6  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2482  NADPH-dependent FMN reductase  35.64 
 
 		 222 aa  73.2  0.000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.801364  normal  0.288925 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0421  NADPH-dependent FMN reductase  30.65 
 
 		 197 aa  73.2  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0321  NADPH-dependent FMN reductase  33.33 
 
 		 197 aa  72.8  0.000000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.378386  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1285  NADPH-dependent FMN reductase  26.42 
 
 		 197 aa  72.8  0.000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.497649  normal  0.389555 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00930  NADPH-dependent FMN reductase  30.53 
 
 		 173 aa  72.8  0.000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.407777  normal  0.42644 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0018  NADPH-dependent FMN reductase  34.31 
 
 		 228 aa  72.8  0.000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1125  NADPH-dependent FMN reductase  32.69 
 
 		 217 aa  72.8  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000715162  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3523  NADPH-dependent FMN reductase  35.58 
 
 		 218 aa  72.8  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2279  NADPH-dependent FMN reductase  36 
 
 		 221 aa  72  0.000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1105  NADPH-dependent FMN reductase  33.65 
 
 		 217 aa  72.4  0.000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00128897  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>