More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_2210 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_2210  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 291 aa  608  1e-173  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1922  transcriptional regulator, AraC family  83.51 
 
 		 291 aa  525  1e-148  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.890213  normal  0.89853 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2759  AraC family transcriptional regulator  56.75 
 
 		 292 aa  365  1e-100  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4566  AraC family transcriptional regulator  53.29 
 
 		 290 aa  337  9.999999999999999e-92  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.017881  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4582  AraC family transcriptional regulator  52.6 
 
 		 290 aa  337  9.999999999999999e-92  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.763033  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4957  transcriptional regulator, AraC family  52.6 
 
 		 290 aa  335  5e-91  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0278  transcriptional regulator, AraC family  51.56 
 
 		 290 aa  335  7e-91  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4947  transcriptional regulator, AraC family  52.6 
 
 		 290 aa  334  1e-90  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4986  AraC family transcriptional regulator  52.25 
 
 		 290 aa  333  2e-90  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4724  AraC family transcriptional regulator  52.6 
 
 		 290 aa  333  2e-90  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.440387  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5086  AraC family transcriptional regulator  52.6 
 
 		 290 aa  333  2e-90  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4973  transcriptional regulator, AraC family  52.25 
 
 		 290 aa  333  2e-90  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4672  AraC family transcriptional regulator  51.9 
 
 		 290 aa  330  2e-89  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1802  transcriptional regulator, AraC family  44.06 
 
 		 286 aa  259  4e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2780  transcriptional regulator, AraC family  41.61 
 
 		 285 aa  242  5e-63  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0531003  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3174  AraC family transcriptional regulator  41.87 
 
 		 280 aa  238  5.999999999999999e-62  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.626893  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1266  AraC family transcriptional regulator  42.61 
 
 		 300 aa  235  6e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.23796  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1127  transcriptional regulator, AraC family  39.52 
 
 		 288 aa  229  4e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0329  transcription activator effector binding protein  37.15 
 
 		 288 aa  212  4.9999999999999996e-54  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0236652  normal  0.0105288 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2127  transcription activator effector binding protein  39.93 
 
 		 290 aa  211  2e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3846  transcriptional regulator, AraC family  36.3 
 
 		 287 aa  207  2e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2251  transcriptional regulator, AraC family  38.62 
 
 		 287 aa  205  9e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3181  AraC family transcriptional regulator  36.39 
 
 		 292 aa  197  2.0000000000000003e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0137  AraC family transcriptional regulator  44.55 
 
 		 315 aa  191  1e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.10009 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3564  transcriptional regulator, AraC family  34.47 
 
 		 285 aa  191  1e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2678  transcriptional regulator, AraC family  37.41 
 
 		 284 aa  187  2e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2323  transcriptional regulator, AraC family  35.53 
 
 		 289 aa  186  4e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.614848  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5265  transcriptional regulator, AraC family  37.07 
 
 		 281 aa  185  8e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0205  transcriptional activator, AraC family  37.11 
 
 		 281 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000524418 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0223  transcriptional activator, AraC family  36.77 
 
 		 281 aa  183  3e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000178737 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0990  AraC family transcriptional regulator  36.43 
 
 		 281 aa  183  3e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3264  transcriptional regulator, AraC family  31.19 
 
 		 287 aa  180  2.9999999999999997e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2107  AraC family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 313 aa  179  2.9999999999999997e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.342925  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3344  helix-turn-helix domain-containing protein  40.84 
 
 		 232 aa  179  5.999999999999999e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.388455  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2556  AraC family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 290 aa  174  9.999999999999999e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000235949  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3138  AraC family transcriptional regulator  34.36 
 
 		 281 aa  171  1e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0011  transcriptional regulator, AraC family  34.12 
 
 		 285 aa  169  7e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000871788  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3142  AraC family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 301 aa  167  1e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1784  AraC family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 280 aa  143  3e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000275244  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1013  AraC family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 300 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.126228  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1271  transcriptional regulator, AraC family  30.23 
 
 		 300 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.121916  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1036  AraC family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 300 aa  140  3e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.139629  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1790  transcriptional regulator, AraC family  29.53 
 
 		 282 aa  140  3e-32  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.191731  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1114  AraC family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 300 aa  140  3e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1170  transcriptional regulator, AraC family  29.9 
 
 		 300 aa  140  3e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00906983  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4171  transcriptional regulator, AraC family  30.23 
 
 		 300 aa  140  3e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1194  transcriptional regulator, AraC family  30.56 
 
 		 300 aa  140  3e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.926126 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1014  AraC family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 300 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.210728  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1021  AraC family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 300 aa  139  7e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0424  transcriptional regulator, AraC family  29.62 
 
 		 281 aa  135  8e-31  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1216  AraC family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 300 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0674  AraC family transcriptional regulator  40.41 
 
 		 265 aa  115  8.999999999999998e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06300  methylphosphotriester-DNA alkyltransferase  28.62 
 
 		 302 aa  111  2.0000000000000002e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1798  transcriptional regulator, AraC family  34.73 
 
 		 200 aa  108  1e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1069  AraC family transcriptional regulator  25.43 
 
 		 293 aa  104  2e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.689445  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2158  AraC family transcriptional regulator  26.17 
 
 		 294 aa  97.1  3e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0165  AraC family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 298 aa  95.9  7e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1474  transcriptional regulator, AraC family  27.33 
 
 		 286 aa  95.1  1e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0009  helix-turn-helix domain-containing protein  25.41 
 
 		 306 aa  94.4  2e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000070115 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1594  transcription activator effector binding  24.14 
 
 		 297 aa  94  3e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.630007  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1563  transcription activator, effector binding  24.14 
 
 		 297 aa  94  3e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1224  AraC family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 288 aa  92  1e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0494811  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3983  transcriptional regulator, AraC family  25.5 
 
 		 291 aa  92  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003322  hypothetical protein  25.58 
 
 		 310 aa  91.3  2e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.757084  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0853  transcriptional regulator, AraC family  25.08 
 
 		 284 aa  90.1  4e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3069  transcriptional regulator, AraC family  24.15 
 
 		 296 aa  89.4  7e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6275  AraC family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 279 aa  89  8e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1217  transcription activator, effector binding  26.71 
 
 		 288 aa  89  9e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0771  AraC family transcriptional regulator  24.07 
 
 		 288 aa  88.6  1e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.472166 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0086  transcriptional regulator, AraC family  27.52 
 
 		 313 aa  88.2  1e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.353006  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0028  transcriptional regulator, AraC family  25.75 
 
 		 279 aa  87.8  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2843  AraC family transcriptional regulator  25.42 
 
 		 296 aa  87.4  3e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.538425  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3057  AraC family transcriptional regulator  25.42 
 
 		 296 aa  87.4  3e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.118978  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1353  transcription activator effector binding  31.52 
 
 		 160 aa  87  3e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.266351  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3086  transcriptional regulator, AraC family  24.08 
 
 		 296 aa  86.7  4e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.164604  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1774  AraC family transcriptional regulator  24.16 
 
 		 289 aa  86.7  5e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.524324  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2816  AraC family transcriptional regulator  25.17 
 
 		 296 aa  86.3  6e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3088  AraC family transcriptional regulator  24.15 
 
 		 296 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.530109  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2193  transcriptional regulator, AraC family  24.14 
 
 		 296 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000412725 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3053  transcriptional regulator, AraC family  22.79 
 
 		 296 aa  84  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0034  transcriptional regulator, AraC family  24.66 
 
 		 279 aa  84.7  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.255751 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3715  transcriptional regulator, AraC family  25.45 
 
 		 279 aa  84  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.424878 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3503  transcription activator, effector binding  25.78 
 
 		 294 aa  83.6  0.000000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00111619  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2776  AraC family transcriptional regulator  24.66 
 
 		 296 aa  82.8  0.000000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2797  transcription activator effector binding  25.35 
 
 		 279 aa  82.8  0.000000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.338998 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2836  AraC family transcriptional regulator  23 
 
 		 296 aa  82.4  0.000000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00254989  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4053  AraC family transcriptional regulator  24.56 
 
 		 277 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2173  AraC family transcriptional regulator  23.76 
 
 		 289 aa  80.1  0.00000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.671765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3564  AraC family transcriptional regulator  23.76 
 
 		 279 aa  80.1  0.00000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.236142  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0216  transcriptional regulator, AraC family  36.84 
 
 		 299 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3099  AraC family transcriptional regulator  25.79 
 
 		 326 aa  78.2  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3417  transcriptional regulator, AraC family  24.73 
 
 		 279 aa  77.4  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.27768  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1472  AraC family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 294 aa  78.2  0.0000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.102681  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0192  AraC family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 299 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0179  AraC family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 299 aa  77  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0147136  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0191  AraC family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 299 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0211  transcriptional regulator, AraC family  35.79 
 
 		 299 aa  77  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0971  AraC family transcriptional regulator  39.8 
 
 		 136 aa  77  0.0000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000205729  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2736  AraC family transcriptional regulator  38 
 
 		 154 aa  76.6  0.0000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.66637 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0182  AraC family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 299 aa  76.3  0.0000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>