More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_1799 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_1799  malate dehydrogenase, NAD-dependent  100 
 
 
320 aa  650    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4723  malate dehydrogenase  60.2 
 
 
312 aa  388  1e-107  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4486  malate dehydrogenase  60.2 
 
 
312 aa  388  1e-107  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4321  malate dehydrogenase  60.2 
 
 
312 aa  388  1e-107  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0783  malate dehydrogenase  60.54 
 
 
312 aa  389  1e-107  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4837  malate dehydrogenase  60.2 
 
 
312 aa  388  1e-107  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0536  malate dehydrogenase  60.2 
 
 
312 aa  388  1e-107  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00988703 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4707  malate dehydrogenase  60.2 
 
 
312 aa  388  1e-107  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000597561 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4702  malate dehydrogenase  60.2 
 
 
312 aa  388  1e-107  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.842149  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4718  malate dehydrogenase  60.2 
 
 
312 aa  388  1e-107  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4333  malate dehydrogenase  60.2 
 
 
312 aa  387  1e-106  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4422  malate dehydrogenase  59.87 
 
 
312 aa  386  1e-106  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2677  malate dehydrogenase  59.87 
 
 
312 aa  386  1e-106  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3276  malate dehydrogenase  59.2 
 
 
312 aa  380  1e-104  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2347  malate dehydrogenase, NAD-dependent  64 
 
 
311 aa  364  1e-99  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1867  malate dehydrogenase  54.64 
 
 
308 aa  336  3.9999999999999995e-91  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00765461  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0347  malate dehydrogenase  52.01 
 
 
313 aa  327  2.0000000000000001e-88  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.536254  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1121  malate dehydrogenase  50.33 
 
 
309 aa  326  4.0000000000000003e-88  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1951  malate dehydrogenase (NAD)  52 
 
 
308 aa  321  9.000000000000001e-87  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.800681 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2374  malate dehydrogenase, NAD-dependent  51.49 
 
 
311 aa  310  2e-83  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0253  malate dehydrogenase  47.21 
 
 
309 aa  305  5.0000000000000004e-82  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.041825  normal  0.0135962 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1900  malate dehydrogenase  51.16 
 
 
310 aa  305  9.000000000000001e-82  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1510  malate dehydrogenase  49.35 
 
 
310 aa  303  3.0000000000000004e-81  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0354026  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0283  malate dehydrogenase  46.69 
 
 
309 aa  303  3.0000000000000004e-81  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4206  malate dehydrogenase  47.54 
 
 
314 aa  301  9e-81  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1121  malate dehydrogenase  47.7 
 
 
316 aa  299  5e-80  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0832  malate dehydrogenase  47.34 
 
 
310 aa  295  5e-79  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.328831  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2185  malate dehydrogenase  48.68 
 
 
312 aa  292  4e-78  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2178  malate dehydrogenase, NAD-dependent  45.13 
 
 
326 aa  291  1e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00838959 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3395  malate dehydrogenase  47.7 
 
 
321 aa  291  1e-77  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1029  malate dehydrogenase  48.15 
 
 
310 aa  290  2e-77  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00758057  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2290  malate dehydrogenase  49.51 
 
 
309 aa  286  2.9999999999999996e-76  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.974079 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1587  malate dehydrogenase, NAD-dependent  44.97 
 
 
320 aa  284  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.295644  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0912  malate dehydrogenase, NAD-dependent  49.36 
 
 
312 aa  284  1.0000000000000001e-75  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0881394  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1626  malate dehydrogenase  48.03 
 
 
312 aa  284  1.0000000000000001e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1140  malate dehydrogenase, NAD-dependent  44.41 
 
 
307 aa  284  1.0000000000000001e-75  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.208998  normal  0.907929 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1360  malate dehydrogenase  47.13 
 
 
317 aa  283  2.0000000000000002e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000756192  hitchhiker  0.0000000000000730576 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0862  malate dehydrogenase  47.12 
 
 
310 aa  283  3.0000000000000004e-75  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0390301  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1466  malate dehydrogenase  45.54 
 
 
317 aa  281  1e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0862702  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1273  malate dehydrogenase  45.25 
 
 
324 aa  281  1e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.570878  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4129  malate dehydrogenase  46.53 
 
 
320 aa  280  2e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0187  malate dehydrogenase  45.31 
 
 
322 aa  279  4e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.433088  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1856  malate dehydrogenase  46.2 
 
 
320 aa  278  6e-74  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2876  malate dehydrogenase  43.95 
 
 
320 aa  279  6e-74  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0398  malate dehydrogenase  43.93 
 
 
313 aa  278  9e-74  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2900  malate dehydrogenase  45.31 
 
 
317 aa  278  9e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000048511  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0919  malate dehydrogenase, NAD-dependent  47.25 
 
 
320 aa  278  1e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0994344 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2829  malate dehydrogenase (NAD)  45.07 
 
 
320 aa  278  1e-73  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1325  malate dehydrogenase  45.63 
 
 
317 aa  277  2e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000410815 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0930  malate dehydrogenase  46.2 
 
 
320 aa  276  4e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1927  malate dehydrogenase  45.87 
 
 
320 aa  276  4e-73  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1625  malate dehydrogenase  46.08 
 
 
321 aa  275  5e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000635356  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2161  malate dehydrogenase, NAD-dependent  46.37 
 
 
320 aa  275  8e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.515147 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1748  malate dehydrogenase  45.07 
 
 
307 aa  274  1.0000000000000001e-72  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.747056 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0022  malate dehydrogenase  44.74 
 
 
321 aa  273  2.0000000000000002e-72  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1088  malate dehydrogenase, NAD-dependent  46.33 
 
 
316 aa  273  2.0000000000000002e-72  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00100592  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0522  malate dehydrogenase, NAD-dependent  43.65 
 
 
320 aa  273  2.0000000000000002e-72  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0539  malate dehydrogenase, NAD-dependent  43.65 
 
 
320 aa  273  2.0000000000000002e-72  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0818  malate dehydrogenase  43.69 
 
 
320 aa  273  4.0000000000000004e-72  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.68973 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2322  malate dehydrogenase  48.03 
 
 
312 aa  272  5.000000000000001e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0749738  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1589  malate dehydrogenase  45.93 
 
 
316 aa  272  5.000000000000001e-72  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0268739 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2234  malate dehydrogenase  48.03 
 
 
312 aa  272  5.000000000000001e-72  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1713  malate dehydrogenase  47.06 
 
 
310 aa  272  6e-72  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.905202  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1450  malate dehydrogenase, NAD-dependent  43.37 
 
 
333 aa  271  1e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1649  malate dehydrogenase  44.81 
 
 
316 aa  270  2e-71  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2226  malate dehydrogenase  44.81 
 
 
316 aa  270  2e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.773058  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1123  malate dehydrogenase, NAD-dependent  46.37 
 
 
320 aa  270  2e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.117995  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1925  malate dehydrogenase, NAD-dependent  45.48 
 
 
320 aa  270  2e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.282591  normal  0.451174 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1643  malate dehydrogenase, NAD-dependent  45.48 
 
 
320 aa  270  2e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.160131  normal  0.329919 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1603  malate dehydrogenase  47.81 
 
 
310 aa  270  2.9999999999999997e-71  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0561  malate dehydrogenase  43.22 
 
 
320 aa  269  4e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.394685  normal  0.500877 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2501  malate dehydrogenase, NAD-dependent  46.45 
 
 
321 aa  268  7e-71  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.448823 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3517  malate dehydrogenase  44.01 
 
 
320 aa  268  8e-71  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.734695  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0419  malate dehydrogenase  45.63 
 
 
322 aa  268  1e-70  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.425489  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1722  malate dehydrogenase  44.48 
 
 
316 aa  268  1e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0535  malate dehydrogenase  45.95 
 
 
322 aa  268  1e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0545  malate dehydrogenase  44.98 
 
 
322 aa  267  1e-70  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.557349  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1300  malate dehydrogenase  44.48 
 
 
320 aa  268  1e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0281  malate dehydrogenase  45.31 
 
 
322 aa  267  2e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0622527 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1048  malate dehydrogenase  45.48 
 
 
319 aa  266  5e-70  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.466907  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0080  malate dehydrogenase  42.49 
 
 
320 aa  264  1e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0624  malate dehydrogenase  42.41 
 
 
332 aa  264  1e-69  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000517637  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3974  malate dehydrogenase  47.85 
 
 
320 aa  264  1e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.342256  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2628  malate dehydrogenase  41.96 
 
 
320 aa  264  1e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0153  malate dehydrogenase  46.15 
 
 
321 aa  265  1e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3685  malate dehydrogenase  47.85 
 
 
320 aa  264  1e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2193  malate dehydrogenase  43.17 
 
 
318 aa  265  1e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000748395  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0968  malate dehydrogenase  41.96 
 
 
338 aa  264  2e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3020  malate dehydrogenase (NAD)  45.48 
 
 
312 aa  263  3e-69  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0641  malate dehydrogenase  43.61 
 
 
313 aa  262  4.999999999999999e-69  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3604  malate dehydrogenase, NAD-dependent  45.95 
 
 
320 aa  262  6e-69  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.321555  normal  0.254256 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0194  malate dehydrogenase  44.34 
 
 
322 aa  262  6.999999999999999e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2230  malate dehydrogenase  42.39 
 
 
320 aa  262  6.999999999999999e-69  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2327  malate dehydrogenase  43.31 
 
 
317 aa  261  8e-69  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000213554  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0392  malate dehydrogenase  45.31 
 
 
322 aa  261  2e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.293299  normal  0.208989 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2255  malate dehydrogenase  43.18 
 
 
311 aa  259  5.0000000000000005e-68  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2944  malate dehydrogenase  46.2 
 
 
320 aa  259  5.0000000000000005e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.533999  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5004  malate dehydrogenase  43.28 
 
 
320 aa  258  1e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1656  malate dehydrogenase, NAD-dependent  44.59 
 
 
312 aa  257  2e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1182  malate dehydrogenase  42.27 
 
 
320 aa  256  5e-67  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.333007  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>