58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_0640 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_0640  ATP-dependent endonuclease of the OLD family-like protein  100 
 
 		 601 aa  1238    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0421  hypothetical protein  79.65 
 
 		 320 aa  467  9.999999999999999e-131  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0516009  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5488  putative nucleoside triphosphate hydrolase domain-containing protein  26.98 
 
 		 598 aa  64.7  0.000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1891  SMC domain protein  20.85 
 
 		 628 aa  61.2  0.00000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3408  hypothetical protein  22.02 
 
 		 594 aa  60.8  0.00000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.043782  normal  0.188523 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0753  ATP-dependent OLD family endonuclease  22.97 
 
 		 594 aa  59.7  0.0000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.362493  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0794  ATP-dependent OLD family endonuclease  27.31 
 
 		 647 aa  59.7  0.0000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0801  SMC domain protein  24.43 
 
 		 564 aa  59.7  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.779455  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6911  ATP-dependent OLD family endonuclease  23.08 
 
 		 669 aa  56.6  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0857845  hitchhiker  0.000559752 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0505  ATP-dependent endonuclease, OLD family protein  23.72 
 
 		 663 aa  55.8  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0949649  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1644  hypothetical protein  24.44 
 
 		 596 aa  55.1  0.000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.595797  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1111  ATP-dependent OLD family endonuclease  22.89 
 
 		 603 aa  54.3  0.000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3567  OLD family ATP-dependent endonuclease-like protein  27 
 
 		 604 aa  53.9  0.000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.274046 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4153  SMC domain-containing protein  24.14 
 
 		 574 aa  53.5  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0910063 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4219  ATP-dependent endonuclease, OLD family  24.12 
 
 		 780 aa  53.5  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2572  hypothetical protein  23.84 
 
 		 650 aa  53.1  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00339016  normal  0.0605496 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1439  hypothetical protein  26.59 
 
 		 744 aa  52.4  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0880018  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1846  ATP-dependent OLD family endonuclease  28.65 
 
 		 589 aa  52  0.00004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000147928 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0004  recombination protein F  43.14 
 
 		 370 aa  51.2  0.00005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.320094  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0004  recombination protein F  43.14 
 
 		 370 aa  51.2  0.00005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.188075  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2561  ATP-dependent endonuclease  24.84 
 
 		 613 aa  51.2  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0763392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0038  hypothetical protein  22.02 
 
 		 594 aa  50.8  0.00007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.19507  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1883  SMC protein-like protein  26.82 
 
 		 688 aa  50.4  0.00008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3363  hypothetical protein  20.08 
 
 		 607 aa  50.1  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.194578  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2666  hypothetical protein  25.53 
 
 		 553 aa  49.7  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0477  hypothetical protein  21.84 
 
 		 543 aa  48.9  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000481423  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3277  hypothetical protein  31.72 
 
 		 728 aa  48.5  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0296184  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4711  ATP-dependent endonuclease of the OLD family- like protein  21.29 
 
 		 648 aa  48.5  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6476  ATP-dependent endonuclease, OLD family  26.24 
 
 		 762 aa  47.8  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2550  recombination protein F  39.22 
 
 		 371 aa  47.8  0.0006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0191996  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3140  ATP-dependent endonuclease, OLD family protein  23.5 
 
 		 681 aa  47  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.239895  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1844  ATP-dependent OLD family endonuclease  22.92 
 
 		 640 aa  46.6  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3193  plasmid-related protein  23.98 
 
 		 674 aa  45.8  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0945381 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1006  hypothetical protein  23.05 
 
 		 552 aa  46.2  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0940  hypothetical protein  23.05 
 
 		 552 aa  46.2  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0974  conserved protein nucleotide triphosphate hydrolase domain  23.05 
 
 		 552 aa  46.2  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.120281  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1037  hypothetical protein  23.05 
 
 		 552 aa  46.2  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1057  conserved protein, nucleotide triphosphate hydrolase domain protein  23.05 
 
 		 552 aa  46.2  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2791  ATP-dependent OLD family endonuclease  24.76 
 
 		 677 aa  45.4  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0639956 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4970  ATP-dependent OLD family endonuclease  24.76 
 
 		 677 aa  45.4  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00358529 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1679  hypothetical protein  26.38 
 
 		 351 aa  45.4  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000489043 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2452  hypothetical protein  23.73 
 
 		 552 aa  45.1  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.234891  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1038  hypothetical protein  24.49 
 
 		 552 aa  44.7  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2283  hypothetical protein  23.73 
 
 		 552 aa  45.1  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0243665  normal  0.014671 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0950  hypothetical protein  23.73 
 
 		 552 aa  45.1  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.714273  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2766  conserved hypothetical protein  23.73 
 
 		 552 aa  44.7  0.005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.72525  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000190  ATP-dependent endonuclease  22.07 
 
 		 544 aa  44.7  0.005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0284428  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0980  hypothetical protein  23.73 
 
 		 552 aa  44.7  0.005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2727  ATP-dependent OLD family endonuclease  24.24 
 
 		 607 aa  44.7  0.005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00887  hypothetical protein  23.73 
 
 		 552 aa  44.7  0.005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00881  conserved protein with nucleoside triphosphate hydrolase domain  23.73 
 
 		 552 aa  44.7  0.005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2720  ATP-dependent OLD family endonuclease  23.73 
 
 		 552 aa  44.7  0.005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.560965  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4083  ATP-dependent OLD family endonuclease  23.57 
 
 		 566 aa  44.3  0.007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.186045  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0004  DNA replication and repair protein RecF  36.17 
 
 		 374 aa  44.3  0.007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000920069  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0546  ATP-dependent OLD family endonuclease  26.88 
 
 		 708 aa  43.9  0.009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2954  putative exonuclease  24.32 
 
 		 659 aa  43.9  0.009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4848  ATP-dependent OLD family endonuclease  22.5 
 
 		 626 aa  43.9  0.01  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1516  ATP-dependent endonuclease family protein  20.26 
 
 		 586 aa  43.9  0.01  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.749e-16 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>