88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_0632 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_0632  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  100 
 
 
281 aa  577  1e-164  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3299  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  90.36 
 
 
280 aa  531  1e-150  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1606  putative adenine-specific DNA methyltransferase  44.53 
 
 
284 aa  222  7e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.299391  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3545  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  40 
 
 
280 aa  206  2e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.164224  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1631  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  39.47 
 
 
289 aa  202  5e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00785835  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1480  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  40.77 
 
 
293 aa  196  4.0000000000000005e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000824208  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0050  prophage Lp2 protein 3  45.42 
 
 
290 aa  194  1e-48  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.287398  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2017  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  39.36 
 
 
290 aa  180  2.9999999999999997e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0878  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  35.14 
 
 
296 aa  165  5.9999999999999996e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0291145  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7315  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  30.8 
 
 
314 aa  146  4.0000000000000006e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.0000824248  hitchhiker  0.000000113371 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0061  DNA-methyltransferase  32 
 
 
324 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.403537  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2016  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  28.67 
 
 
306 aa  88.2  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.469174 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4407  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  27.8 
 
 
283 aa  87.4  3e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.167881 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1989  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  28.67 
 
 
306 aa  86.7  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2028  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  27.93 
 
 
292 aa  84.3  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3706  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  28.26 
 
 
248 aa  80.5  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1749  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  26.21 
 
 
280 aa  79.7  0.00000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0183349  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3043  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  27.62 
 
 
287 aa  78.6  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.106098  normal  0.895873 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2134  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  27.11 
 
 
289 aa  78.6  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0629434  normal  0.037417 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0503  site-specific DNA methylase-like protein  24.18 
 
 
297 aa  75.9  0.0000000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4215  DNA adenine methylase  27.6 
 
 
319 aa  74.7  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4254  DNA adenine methylase  27.6 
 
 
319 aa  74.7  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000556419 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0384  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  27.13 
 
 
277 aa  69.7  0.00000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.558909  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2437  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  28.22 
 
 
279 aa  69.7  0.00000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1098  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  23.81 
 
 
332 aa  65.5  0.0000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000180295 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0874  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  24.51 
 
 
313 aa  65.1  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.670148 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0465  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  25.35 
 
 
284 aa  63.5  0.000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.821976  normal  0.340502 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1513  DNA adenine methylase  22.9 
 
 
313 aa  60.5  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000971855  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3043  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  24.36 
 
 
273 aa  59.7  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0103783  normal  0.290519 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0917  retron adenine methylase  24.6 
 
 
285 aa  58.9  0.00000008  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000765231  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1790  DNA adenine methylase  24.8 
 
 
263 aa  58.5  0.0000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.557139  normal  0.0298379 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3649  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  24.74 
 
 
291 aa  58.2  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.782627  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3058  retron adenine methylase  24.6 
 
 
285 aa  58.9  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.99248 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2890  DNA adenine methylase  27.9 
 
 
295 aa  56.6  0.0000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1464  DNA adenine methylase  24.28 
 
 
266 aa  56.2  0.0000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000122278  normal  0.830812 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2150  DNA adenine methylase  23.32 
 
 
307 aa  55.5  0.0000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.184116  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0250  DNA adenine methylase  23.79 
 
 
279 aa  55.1  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3695  DNA adenine methylase  24.14 
 
 
279 aa  55.5  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4929  DNA adenine methylase  21.83 
 
 
275 aa  55.1  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.307357  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3891  DNA adenine methylase  23.79 
 
 
279 aa  53.9  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.728671 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0289  DNA adenine methylase  22.41 
 
 
279 aa  53.5  0.000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4539  DNA adenine methylase  22.42 
 
 
264 aa  53.5  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1477  DNA adenine methylase  23.43 
 
 
283 aa  53.5  0.000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3347  DNA adenine methylase  21.63 
 
 
303 aa  52.4  0.000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.873533  normal  0.758382 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0888  DNA adenine methylase  23.08 
 
 
290 aa  52.4  0.000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1475  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  21.09 
 
 
310 aa  52  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2876  retron adenine methylase  22.5 
 
 
285 aa  51.6  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.672134  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0139  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  23.64 
 
 
296 aa  51.6  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1279  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  23.64 
 
 
296 aa  51.6  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.230898  hitchhiker  0.0056893 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3140  DNA adenine methylase  23.67 
 
 
638 aa  51.6  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3376  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  23.57 
 
 
268 aa  51.2  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.684699  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2786  DNA adenine methylase  24.4 
 
 
284 aa  50.8  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0697189  normal  0.0136814 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3703  DNA adenine methylase  22.94 
 
 
279 aa  51.2  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3635  putative adenine-specific DNA methyltransferase  23.86 
 
 
268 aa  50.4  0.00003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0650243  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1568  methyltransferase, putative  23.18 
 
 
296 aa  49.7  0.00005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.58261  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0847  DNA adenine methylase  23.58 
 
 
306 aa  49.7  0.00005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1627  putative N-6 adenine-specific DNA methylase  23.53 
 
 
268 aa  48.9  0.00008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3321  DNA adenine methylase  21.84 
 
 
289 aa  48.9  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3769  adenine-specific DNA methyltransferase  22.88 
 
 
268 aa  48.5  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.307242  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4006  DNA adenine methylase  22.86 
 
 
279 aa  47.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.081668 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4110  DNA adenine methylase  22.07 
 
 
279 aa  48.1  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.395819  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1281  DNA adenine methylase  24.4 
 
 
288 aa  48.1  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.329872  normal  0.126066 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3839  DNA adenine methylase  19.93 
 
 
318 aa  47.8  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.236937  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1093  DNA adenine methylase  21.38 
 
 
286 aa  47.8  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.118835  hitchhiker  0.000226621 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3396  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  23.44 
 
 
263 aa  47  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.181939  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5555  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  29.67 
 
 
304 aa  46.6  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000602778 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4081  DNA adenine methylase  21.72 
 
 
279 aa  46.6  0.0004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3360  adenine specific DNA methyltransferase, D12 class  22.86 
 
 
262 aa  46.2  0.0005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0151  DNA adenine methylase  22.96 
 
 
306 aa  46.6  0.0005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.851887  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2052  N6 adenine-specific DNA methyltransferase, D12 class  23.48 
 
 
268 aa  46.2  0.0006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0637864  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0884  DNA adenine methylase  21.01 
 
 
294 aa  46.2  0.0006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000960446 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4000  DNA adenine methylase  21.72 
 
 
279 aa  46.2  0.0006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2979  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  23.05 
 
 
254 aa  46.2  0.0006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2320  DNA adenine methylase  23.05 
 
 
272 aa  46.2  0.0006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.3975  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4199  DNA adenine methylase  21.72 
 
 
279 aa  46.2  0.0006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.246501  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0834  DNA adenine methylase  27.73 
 
 
251 aa  45.8  0.0007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000010943  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4452  DNA adenine methyltransferase  28.28 
 
 
296 aa  45.8  0.0009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2787  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  30.28 
 
 
305 aa  45.4  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.113292  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0220  DNA adenine methylase  23.19 
 
 
271 aa  44.7  0.002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1588  DNA adenine methylase  19.11 
 
 
278 aa  43.9  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3837  DNA adenine methylase  20.07 
 
 
279 aa  43.9  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0233  DNA adenine methylase  20.97 
 
 
293 aa  43.5  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.793505 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2376  DNA adenine methyltransferase  25.29 
 
 
285 aa  43.5  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00648987  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4704  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  25 
 
 
286 aa  43.1  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0118751  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0670  DNA adenine methylase  29.07 
 
 
163 aa  43.1  0.006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0429675  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3004  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  22.87 
 
 
321 aa  43.1  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2747  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  24.77 
 
 
303 aa  42.7  0.006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.356078 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1756  site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  22.58 
 
 
306 aa  42.4  0.008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.663014  normal  0.0339487 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>