More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_0329 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_0329  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
287 aa  576  1.0000000000000001e-163  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1273  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.52 
 
 
286 aa  338  5e-92  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1862  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.11 
 
 
283 aa  311  7.999999999999999e-84  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2552  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.72 
 
 
271 aa  306  2.0000000000000002e-82  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2201  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.78 
 
 
353 aa  279  4e-74  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.26861  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0037  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.47 
 
 
289 aa  279  5e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00200044  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1327  dipeptide ABC transporter, permease protein  51.3 
 
 
276 aa  275  5e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0013  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  46.84 
 
 
292 aa  269  4e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.943696  normal  0.0118376 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1343  dipeptide ABC transporter, permease protein  49.08 
 
 
285 aa  266  2.9999999999999995e-70  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.384157 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1467  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.35 
 
 
273 aa  259  5.0000000000000005e-68  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0214  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  46.47 
 
 
291 aa  249  5e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0189  oligopeptide ABC transporter, permease protein  44.27 
 
 
273 aa  242  3.9999999999999997e-63  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3068  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.45 
 
 
276 aa  215  5.9999999999999996e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1347  nickel/di-oligopepetide ABC transporter permease subunit  41.8 
 
 
270 aa  202  6e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0371314  normal  0.322841 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1923  ABC nickel/di-oligopepetide transporter, permease subunit  41.8 
 
 
270 aa  201  9e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00290921  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1378  ABC nickel/di-oligopepetide transporter, permease subunit  41.8 
 
 
270 aa  201  9e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.405632 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1363  ABC nickel/di-oligopepetide transporter, permease subunit  41.41 
 
 
270 aa  199  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0141464 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2104  Adipeptide/di-oligopeptide/nickel ABC transporter permease subunit  41.02 
 
 
270 aa  197  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000641453 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1127  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.91 
 
 
268 aa  185  9e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0682629  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1073  nickel ABC transporter, permease protein  42.91 
 
 
268 aa  185  9e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0308  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  38.52 
 
 
298 aa  179  4.999999999999999e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1677  oligopeptide transport system permease protein OppC  45.7 
 
 
276 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3549  binding-protein-dependent transport protein  41.73 
 
 
263 aa  172  5.999999999999999e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00345403  normal  0.0594422 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4498  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.44 
 
 
285 aa  170  2e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.886344  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03990  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  36.71 
 
 
277 aa  165  6.9999999999999995e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.518636  normal  0.0983545 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3642  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.84 
 
 
276 aa  162  5.0000000000000005e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0117  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.87 
 
 
281 aa  162  7e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0983595 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3037  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.3 
 
 
289 aa  159  4e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1597  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.5 
 
 
287 aa  158  1e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1663  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.06 
 
 
287 aa  155  6e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1093  peptide ABC transporter, permease protein, putative  35.9 
 
 
296 aa  155  7e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3090  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.44 
 
 
310 aa  154  1e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0510  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.51 
 
 
270 aa  154  2e-36  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2642  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.48 
 
 
310 aa  154  2e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1253  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.67 
 
 
305 aa  154  2e-36  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.95778  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0197  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.06 
 
 
275 aa  152  8e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1002  oligopeptide ABC transporter, permease protein  34.62 
 
 
283 aa  151  1e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0860  oligopeptide ABC transporter permease  35.37 
 
 
283 aa  151  1e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0910  oligopeptide ABC transporter permease protein  35.37 
 
 
283 aa  151  1e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4384  oligopeptide ABC transporter, permease protein  35.37 
 
 
283 aa  151  1e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  9.52955e-23 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0809  oligopeptide ABC transporter, permease  35.37 
 
 
283 aa  150  2e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0805  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.07 
 
 
283 aa  150  3e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.789025  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1190  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.62 
 
 
290 aa  149  4e-35  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.287104  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0998  oligopeptide ABC transporter, permease protein  34.19 
 
 
283 aa  149  5e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.8284200000000003e-62 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0947  oligopeptide ABC transporter, permease protein  34.93 
 
 
283 aa  149  6e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.177412  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0824  oligopeptide ABC transporter, permease  34.93 
 
 
283 aa  149  7e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4577  binding-protein-dependent transport systems inner membrane protein  33.46 
 
 
308 aa  148  9e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0046213 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0718  putative dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter, permease protein  31.8 
 
 
298 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.724633  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1969  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.15 
 
 
266 aa  147  2.0000000000000003e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.451413  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1222  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.47 
 
 
310 aa  146  3e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0299978 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0269  ABC transporter related protein  31.54 
 
 
867 aa  147  3e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1282  oligopeptide ABC transporter, permease protein  32.48 
 
 
300 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.284613  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0312  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.69 
 
 
313 aa  144  2e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2420  dipeptide ABC transport system inner membrane binding component DppC  35.71 
 
 
288 aa  144  2e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000767733 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4051  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  31.42 
 
 
306 aa  143  3e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.722195  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1948  oligopeptide transport system permease protein C  31.54 
 
 
300 aa  143  3e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6294  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.51 
 
 
303 aa  143  3e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4129  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.71 
 
 
312 aa  143  4e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02947  hypothetical protein  31.82 
 
 
302 aa  142  4e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1658  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.42 
 
 
303 aa  142  6e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.11217  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0011  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.71 
 
 
307 aa  142  7e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3650  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.97 
 
 
359 aa  142  8e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1761  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.8 
 
 
309 aa  141  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0937857  normal  0.182989 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2796  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.39 
 
 
299 aa  141  9.999999999999999e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3674  oligopeptide ABC transporter, permease  32.08 
 
 
279 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0467802 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002961  oligopeptide transport system permease protein OppC  30.58 
 
 
300 aa  140  3e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0860  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.93 
 
 
287 aa  140  3e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000642732  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2115  peptide ABC transporter membrane protein  35.56 
 
 
286 aa  140  3e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2084  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.39 
 
 
309 aa  140  3e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4658  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.27 
 
 
294 aa  139  3.9999999999999997e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.249945  normal  0.298261 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1359  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.03 
 
 
308 aa  139  4.999999999999999e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0236512  normal  0.473156 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1592  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.91 
 
 
280 aa  139  6e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.961775 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1236  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  31.91 
 
 
284 aa  139  6e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.143707  normal  0.209567 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0204  hypothetical protein  28.99 
 
 
286 aa  138  7.999999999999999e-32  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2660  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.48 
 
 
294 aa  138  7.999999999999999e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00097283 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4965  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.57 
 
 
309 aa  139  7.999999999999999e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.031791  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0213  hypothetical protein  28.99 
 
 
286 aa  138  7.999999999999999e-32  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2500  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.19 
 
 
296 aa  137  1e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.143013 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2032  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.91 
 
 
285 aa  137  1e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2704  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.48 
 
 
301 aa  138  1e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0611  oligopeptide ABC transporter, permease protein  31.11 
 
 
300 aa  137  2e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1010  peptide ABC transporter, permease protein  31.95 
 
 
286 aa  137  2e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0643  oligopeptide ABC transporter, permease protein  30.34 
 
 
292 aa  137  2e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1137  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.27 
 
 
293 aa  137  2e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000296229  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2745  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.77 
 
 
313 aa  137  2e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0718  hypothetical protein  31.12 
 
 
282 aa  137  2e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.661918 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0455  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.64 
 
 
309 aa  137  2e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0448  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.91 
 
 
287 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.144364 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4458  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.19 
 
 
286 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2788  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.45 
 
 
310 aa  137  3.0000000000000003e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0564  peptide ABC transporter, protein inner membrane binding component  31.13 
 
 
314 aa  136  3.0000000000000003e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2642  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.91 
 
 
280 aa  136  4e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3861  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.62 
 
 
359 aa  136  4e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.61209  hitchhiker  0.00385009 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1340  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.14 
 
 
469 aa  136  4e-31  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0751  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.93 
 
 
287 aa  135  6.0000000000000005e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1420  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.53 
 
 
471 aa  135  6.0000000000000005e-31  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0657441  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0031  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.77 
 
 
286 aa  135  8e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4406  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.59 
 
 
308 aa  135  9e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0952  peptide ABC transporter, permease protein  32.07 
 
 
286 aa  134  9.999999999999999e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1607  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.92 
 
 
355 aa  134  9.999999999999999e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>