More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1627 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1627  aminotransferase, class I and II  100 
 
 		 393 aa  788    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.703964 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2408  aminotransferase class I and II  60.53 
 
 		 383 aa  459  9.999999999999999e-129  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.987173  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3018  aminotransferase class I and II  60 
 
 		 383 aa  457  1e-127  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0763  aspartate aminotransferase  52.38 
 
 		 400 aa  370  1e-101  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1297  aspartate aminotransferase  50.38 
 
 		 400 aa  369  1e-101  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.216369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2422  aspartate aminotransferase  52.38 
 
 		 400 aa  370  1e-101  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.352097  normal  0.171699 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3925  aspartate aminotransferase  50.5 
 
 		 400 aa  371  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0454577  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1734  aspartate aminotransferase  52.41 
 
 		 400 aa  368  1e-101  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.395595  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4809  aspartate aminotransferase  50.38 
 
 		 400 aa  370  1e-101  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0412  aspartate aminotransferase  51.63 
 
 		 400 aa  366  1e-100  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4122  aspartate aminotransferase  50.63 
 
 		 401 aa  367  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1672  aspartate aminotransferase  51.15 
 
 		 400 aa  367  1e-100  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1103  aspartate aminotransferase  50.38 
 
 		 400 aa  365  1e-100  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4784  aspartate aminotransferase  46.74 
 
 		 387 aa  364  1e-99  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2997  aspartate aminotransferase  50.25 
 
 		 400 aa  363  2e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.308174  normal  0.423377 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1448  aspartate aminotransferase  50.89 
 
 		 400 aa  363  3e-99  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.7202  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1495  aspartate aminotransferase  50.64 
 
 		 400 aa  363  4e-99  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.473774  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2980  aspartate aminotransferase  50.13 
 
 		 400 aa  361  1e-98  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.181934  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2202  aspartate aminotransferase  49.74 
 
 		 393 aa  360  3e-98  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2736  aspartate aminotransferase  50 
 
 		 400 aa  359  4e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0888724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1490  L-aspartate aminotransferase  50.51 
 
 		 396 aa  358  9e-98  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1032  aminotransferase, class I and II  47.34 
 
 		 394 aa  358  9e-98  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.107898  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2233  aspartate aminotransferase  50.64 
 
 		 400 aa  358  9.999999999999999e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.117897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2737  aminotransferase class I and II  50.26 
 
 		 400 aa  357  9.999999999999999e-98  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.388362  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2030  aminotransferase class I and II  49.5 
 
 		 400 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.128582  normal  0.337144 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3150  aspartate aminotransferase  49.36 
 
 		 400 aa  356  3.9999999999999996e-97  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2545  aspartate aminotransferase  48.04 
 
 		 392 aa  356  3.9999999999999996e-97  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.112284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1801  aspartate aminotransferase  49.12 
 
 		 401 aa  356  3.9999999999999996e-97  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.81932  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2070  aminotransferase class I and II  50.37 
 
 		 400 aa  355  6.999999999999999e-97  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.117536 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1959  aminotransferase class I and II  50.75 
 
 		 400 aa  355  8.999999999999999e-97  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.39107  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0755  aspartate aminotransferase  46.41 
 
 		 395 aa  354  1e-96  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1138  aminotransferase, class I and II  48.21 
 
 		 395 aa  353  4e-96  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.025669  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2961  aminotransferase class I and II  50.26 
 
 		 400 aa  353  4e-96  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2344  aminotransferase class I and II  50.12 
 
 		 400 aa  353  4e-96  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.306055  normal  0.668996 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1241  aminotransferase class I and II  47.97 
 
 		 400 aa  352  8.999999999999999e-96  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.54576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2300  aspartate aminotransferase  48.97 
 
 		 400 aa  351  1e-95  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.10725  normal  0.390936 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0938  aminotransferase, class I and II  49.24 
 
 		 400 aa  351  1e-95  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0079  aminotransferase class I and II  49.74 
 
 		 400 aa  351  1e-95  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.940118  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1479  aspartate aminotransferase  49.12 
 
 		 400 aa  350  2e-95  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0669082 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2107  aspartate aminotransferase  49.62 
 
 		 400 aa  350  3e-95  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4061  aspartate aminotransferase  46.25 
 
 		 389 aa  349  4e-95  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.257184 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0293  aspartate aminotransferase  45.43 
 
 		 390 aa  349  4e-95  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.422454 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0762  aspartate aminotransferase  49.62 
 
 		 400 aa  348  8e-95  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.281955 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0979  aspartate aminotransferase  48.85 
 
 		 400 aa  348  9e-95  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0698  L-aspartate aminotransferase  48.72 
 
 		 401 aa  347  2e-94  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00325114  normal  0.844303 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1380  aminotransferase class I and II  50.13 
 
 		 398 aa  347  3e-94  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0129457  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0507  aspartate aminotransferase  48.97 
 
 		 393 aa  345  6e-94  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1056  aspartate aminotransferase A  51.01 
 
 		 400 aa  345  8.999999999999999e-94  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3821  aminotransferase class I and II  49.38 
 
 		 400 aa  345  8.999999999999999e-94  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.292304  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0257  aminotransferase class I and II  47.33 
 
 		 402 aa  344  2e-93  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1791  aminotransferase class I and II  49.5 
 
 		 400 aa  343  2e-93  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.033856 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1087  aminotransferase  45.94 
 
 		 392 aa  344  2e-93  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1924  aspartate aminotransferase  44.13 
 
 		 397 aa  343  2.9999999999999997e-93  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1642  aspartate aminotransferase  44.39 
 
 		 397 aa  342  5e-93  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5177  class I/II aminotransferase  44.7 
 
 		 388 aa  342  7e-93  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.530188  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0353  aminotransferase class I and II  48.21 
 
 		 391 aa  342  9e-93  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.818092  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1545  aspartate aminotransferase  46.17 
 
 		 423 aa  341  1e-92  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1569  aminotransferase  46.62 
 
 		 398 aa  341  2e-92  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2127  aspartate aminotransferase  45.99 
 
 		 388 aa  340  2e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1755  aminotransferase, class I and II  45.43 
 
 		 394 aa  340  2e-92  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1621  aspartate aminotransferase  43.77 
 
 		 395 aa  340  2.9999999999999998e-92  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.624357  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0630  aspartate aminotransferase  45.92 
 
 		 394 aa  340  2.9999999999999998e-92  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3420  aminotransferase, class I and II  47.17 
 
 		 408 aa  340  4e-92  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1760  aminotransferase class I and II  48.09 
 
 		 393 aa  338  7e-92  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1134  aspartate aminotransferase  44.96 
 
 		 387 aa  337  9.999999999999999e-92  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.338962  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0543  aminotransferase, class I and II  48.1 
 
 		 394 aa  338  9.999999999999999e-92  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2112  aspartate aminotransferase  47.44 
 
 		 396 aa  338  9.999999999999999e-92  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000221711  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0388  aminotransferase class I and II  44.96 
 
 		 392 aa  337  1.9999999999999998e-91  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0056  aspartate aminotransferase  44.85 
 
 		 379 aa  336  2.9999999999999997e-91  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1135  aminotransferase  46.94 
 
 		 400 aa  336  3.9999999999999995e-91  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.309528  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3084  aminotransferase, class I and II  48.74 
 
 		 402 aa  336  3.9999999999999995e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.373251  normal  0.60396 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0073  hypothetical protein  44.3 
 
 		 392 aa  335  5.999999999999999e-91  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2058  aminotransferase, class I and II  48.53 
 
 		 404 aa  335  7e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.675506  normal  0.386904 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3439  aminotransferase  49.11 
 
 		 402 aa  335  7.999999999999999e-91  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1665  aminotransferase, class I and II  42.61 
 
 		 398 aa  335  7.999999999999999e-91  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0122976  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0085  hypothetical protein  44.3 
 
 		 392 aa  335  1e-90  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2382  aspartate aminotransferase  43.44 
 
 		 388 aa  333  2e-90  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.814332 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1696  aminotransferase, class I and II  46.06 
 
 		 397 aa  333  2e-90  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0798597  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2654  aspartate aminotransferase  48.99 
 
 		 400 aa  334  2e-90  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.24242  decreased coverage  0.00639864 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1319  aminotransferase  46.08 
 
 		 398 aa  334  2e-90  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.399658  normal  0.480926 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2149  aminotransferase  48.35 
 
 		 401 aa  333  2e-90  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.286758 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0172  aminotransferase, class I and II  48.48 
 
 		 403 aa  333  4e-90  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3551  aminotransferase  46.15 
 
 		 400 aa  333  4e-90  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.547606 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2331  aspartate aminotransferase  43.19 
 
 		 388 aa  332  5e-90  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3740  aminotransferase class I and II  46.23 
 
 		 397 aa  332  7.000000000000001e-90  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0346922  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8484  aminotransferase class I and II  45.79 
 
 		 409 aa  332  7.000000000000001e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.245208  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1232  aspartate aminotransferase A protein  48.39 
 
 		 404 aa  331  1e-89  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0739615 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2501  aminotransferase, class I and II  44.13 
 
 		 397 aa  331  1e-89  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000255264  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3744  aspartate aminotransferase  43.81 
 
 		 395 aa  331  1e-89  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.369906  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1470  aspartate aminotransferase  44.59 
 
 		 395 aa  331  1e-89  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1712  aspartate aminotransferase  44.07 
 
 		 395 aa  331  1e-89  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000959703  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1674  aspartate aminotransferase  44.07 
 
 		 395 aa  330  2e-89  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1454  aspartate aminotransferase  44.59 
 
 		 395 aa  330  2e-89  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1426  aspartate aminotransferase  44.59 
 
 		 395 aa  330  2e-89  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1427  aspartate aminotransferase  44.59 
 
 		 395 aa  330  2e-89  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1568  aspartate aminotransferase  44.59 
 
 		 395 aa  330  2e-89  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1601  aspartate aminotransferase  43.81 
 
 		 395 aa  330  2e-89  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.43863  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0165  aminotransferase, class I and II  46.06 
 
 		 390 aa  330  2e-89  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1639  aspartate aminotransferase  44.59 
 
 		 395 aa  330  2e-89  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000120157 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2902  aminotransferase, class I and II  45.66 
 
 		 406 aa  329  4e-89  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0134054 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>