More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1421 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1421  PfkB  100 
 
 		 284 aa  567  1e-161  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0830137 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2969  ribokinase-like domain-containing protein  54.26 
 
 		 302 aa  255  6e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05325  sugar kinase protein  50.91 
 
 		 307 aa  253  3e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.244562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0334  putative fructokinase  54.18 
 
 		 302 aa  253  3e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.894295  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3386  fructokinase, putative  54.18 
 
 		 302 aa  253  3e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0217609  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0526  fructokinase  54.18 
 
 		 302 aa  253  3e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.29396  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2033  putative fructokinase  54.18 
 
 		 302 aa  253  3e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0347  putative fructokinase  54.18 
 
 		 302 aa  253  3e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.494645  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2251  putative fructokinase  54.18 
 
 		 302 aa  253  3e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.763261  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3060  putative fructokinase  54.18 
 
 		 302 aa  253  3e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0148  ribokinase-like domain-containing protein  51.96 
 
 		 308 aa  251  9.000000000000001e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3021  ribokinase-like domain-containing protein  54.61 
 
 		 302 aa  248  1e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0298  fructokinase, putative  53.09 
 
 		 302 aa  246  3e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2884  ribokinase-like domain-containing protein  52.86 
 
 		 302 aa  244  9e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2994  ribokinase-like domain-containing protein  53.21 
 
 		 302 aa  238  8e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2360  PfkB  52.86 
 
 		 302 aa  236  2e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2974  ribokinase-like domain-containing protein  52.86 
 
 		 302 aa  236  2e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0423  PfkB domain protein  50.2 
 
 		 305 aa  236  4e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.311866 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1714  ribokinase-like domain-containing protein  49.45 
 
 		 319 aa  236  4e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0308067 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4286  putative carbohydrate kinase  50.2 
 
 		 305 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6323  ribokinase family sugar kinase  52.14 
 
 		 302 aa  231  8.000000000000001e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1516  ribokinase-like domain-containing protein  50 
 
 		 312 aa  231  9e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.115005  normal  0.017116 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1060  PfkB  50 
 
 		 312 aa  230  2e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1540  ribokinase-like domain-containing protein  50 
 
 		 312 aa  230  2e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1422  ribokinase-like domain-containing protein  50.37 
 
 		 316 aa  224  2e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4680  PfkB, ribokinase family  49.63 
 
 		 311 aa  222  7e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0234219  normal  0.218214 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1462  ribokinase-like domain-containing protein  50 
 
 		 316 aa  221  8e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.081481  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1648  fructokinase  49.18 
 
 		 308 aa  219  3.9999999999999997e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2634  PfkB  37.67 
 
 		 312 aa  133  3e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1115  PfkB domain protein  39.14 
 
 		 322 aa  134  3e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5591  ribokinase-like domain-containing protein  38.18 
 
 		 314 aa  127  2.0000000000000002e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.651891 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2416  ribokinase-like domain-containing protein  35.86 
 
 		 319 aa  123  3e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0306608  normal  0.469914 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3429  ribokinase-like domain-containing protein  41.77 
 
 		 312 aa  122  5e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.343851  normal  0.0113168 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000598  fructokinase  32.87 
 
 		 337 aa  120  3.9999999999999996e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00217717  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0139  PfkB domain protein  34.14 
 
 		 308 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.49186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4474  ribokinase-like domain-containing protein  36.08 
 
 		 315 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.491556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2239  ribokinase-like domain-containing protein  35.71 
 
 		 306 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0115  fructokinase  33.79 
 
 		 308 aa  117  1.9999999999999998e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2701  fructokinase  34.95 
 
 		 312 aa  116  3e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000723148  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0112  fructokinase  33.56 
 
 		 308 aa  116  3.9999999999999997e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0686594  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2674  PfkB  33.56 
 
 		 309 aa  116  3.9999999999999997e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.201136  normal  0.321692 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33610  sugar kinase, ribokinase  32.42 
 
 		 307 aa  115  6.9999999999999995e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.469298 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2019  aminoimidazole riboside kinase  33.7 
 
 		 298 aa  114  1.0000000000000001e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0270358  normal  0.162694 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2257  putative fructokinase  37.33 
 
 		 306 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0759  PfkB domain-containing protein  34.46 
 
 		 306 aa  114  2.0000000000000002e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0530  fructokinase  33.56 
 
 		 308 aa  114  2.0000000000000002e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.955105  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2905  aminoimidazole riboside kinase  34.05 
 
 		 306 aa  113  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00998461  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0135  PfkB domain protein  32.75 
 
 		 308 aa  112  9e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.472286 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2434  carbohydrate kinase, PfkB  34.26 
 
 		 312 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0244722 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2035  ribokinase-like domain-containing protein  35.81 
 
 		 321 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0129  ribokinase-like domain-containing protein  33.91 
 
 		 308 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1102  PfkB domain protein  34.01 
 
 		 306 aa  111  2.0000000000000002e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.534067  normal  0.794033 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0600  aminoimidazole riboside kinase  32.98 
 
 		 323 aa  111  2.0000000000000002e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0795  PfkB domain protein  29.58 
 
 		 315 aa  109  4.0000000000000004e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3755  PfkB domain protein  35.17 
 
 		 307 aa  110  4.0000000000000004e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0212856  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19960  PfkB domain protein  31.49 
 
 		 323 aa  108  9.000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0931  ribokinase-like domain-containing protein  36.55 
 
 		 306 aa  108  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.63818 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1154  ribokinase-like domain-containing protein  27.94 
 
 		 319 aa  107  2e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0389  PfkB  30.24 
 
 		 323 aa  107  2e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.211683  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0395  aminoimidazole riboside kinase  32.86 
 
 		 311 aa  107  2e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0581877  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0836  PfkB  33.68 
 
 		 306 aa  107  3e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.408369  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2946  ribokinase-like domain-containing protein  34.48 
 
 		 306 aa  107  3e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.014237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7023  ribokinase-like domain-containing protein  30.47 
 
 		 319 aa  105  6e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16610  PfkB-family carbohydrate kinase  31.51 
 
 		 323 aa  105  1e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0928  fructokinase  32.81 
 
 		 321 aa  104  2e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1025  PfkB domain protein  29.43 
 
 		 333 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00743339 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34340  fructokinase  36.68 
 
 		 310 aa  104  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00034201  normal  0.472957 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0109  ribokinase-like domain-containing protein  33.89 
 
 		 335 aa  103  2e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1715  PfkB domain protein  31.31 
 
 		 334 aa  103  2e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.189965 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0996  PfkB domain protein  29.79 
 
 		 333 aa  103  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1118  PfkB domain protein  33.99 
 
 		 316 aa  103  3e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.59245  normal  0.875512 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1119  ribokinase-like domain-containing protein  29.17 
 
 		 322 aa  103  3e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0351  aminoimidazole riboside kinase  34.19 
 
 		 307 aa  103  3e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.735787  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0053  ribokinase-like domain-containing protein  32.99 
 
 		 317 aa  103  3e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2797  carbohydrate kinase  34.63 
 
 		 308 aa  103  4e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.375815  normal  0.409466 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17670  PfkB-family carbohydrate kinase  34.8 
 
 		 323 aa  103  4e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0565403  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0971  aminoimidazole riboside kinase  29.75 
 
 		 308 aa  103  4e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00309121  normal  0.0346902 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2919  fructokinase  36.11 
 
 		 310 aa  102  6e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.141756  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3592  PfkB domain protein  33.86 
 
 		 311 aa  102  6e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0720957  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3872  ribokinase-like domain-containing protein  33.9 
 
 		 300 aa  102  1e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4464  aminoimidazole riboside kinase  30.99 
 
 		 319 aa  101  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.680577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1891  ribokinase-like domain-containing protein  34.71 
 
 		 313 aa  101  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.370401  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0996  PfkB domain protein  33.09 
 
 		 298 aa  100  2e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.809854  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4283  aminoimidazole riboside kinase  30.99 
 
 		 319 aa  99.8  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1782  fructokinase  27.72 
 
 		 315 aa  99.8  5e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0521883  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2896  PfkB domain protein  31.34 
 
 		 316 aa  99.8  5e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2220  ribokinase-like domain-containing protein  33.19 
 
 		 316 aa  99  8e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.101084 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0108  ribokinase-like domain-containing protein  35.25 
 
 		 310 aa  99  8e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4798  ribokinase-like domain-containing protein  35.46 
 
 		 317 aa  99  9e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.28126  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2919  PfkB  30.65 
 
 		 325 aa  98.6  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000103669  normal  0.041423 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0501  PfkB domain protein  32.92 
 
 		 320 aa  98.6  1e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.501412  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4616  PfkB domain protein  31.27 
 
 		 326 aa  98.6  1e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2647  aminoimidazole riboside kinase  30.5 
 
 		 304 aa  98.6  1e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2120  ribokinase-like domain-containing protein  33.33 
 
 		 311 aa  97.8  2e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.56437  normal  0.133617 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1030  PfkB domain protein  31.84 
 
 		 329 aa  97.4  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.185699  normal  0.340834 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1088  PfkB domain protein  29.88 
 
 		 315 aa  97.1  3e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.332998  normal  0.446333 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3592  aminoimidazole riboside kinase  30.14 
 
 		 304 aa  97.1  3e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000158875 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4203  aminoimidazole riboside kinase  32.77 
 
 		 309 aa  97.1  3e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.831759  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1510  fructokinase  27.37 
 
 		 315 aa  97.1  3e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00409278  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4395  aminoimidazole riboside kinase  30.63 
 
 		 319 aa  96.7  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>