More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1071 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1071  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  100 
 
 
187 aa  376  1e-104  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.45442  normal  0.648956 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3540  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  36.44 
 
 
162 aa  75.1  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00955446 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0797  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  36.84 
 
 
158 aa  74.3  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0014  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  38.62 
 
 
156 aa  73.9  0.000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2644  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  39.2 
 
 
164 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1139  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  34.93 
 
 
189 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.414141  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1317  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  39.71 
 
 
175 aa  72.4  0.000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0700  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  40.91 
 
 
157 aa  72.4  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.192591  normal  0.865877 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1065  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  34.75 
 
 
146 aa  72  0.000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1562  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  32.78 
 
 
169 aa  71.6  0.000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0968895  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3054  tRNA-specific adenosine deaminase  38.46 
 
 
165 aa  71.6  0.000000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0158  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  36.36 
 
 
190 aa  71.2  0.000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0204  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  33.92 
 
 
168 aa  70.5  0.00000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.938161  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3095  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  41.82 
 
 
147 aa  70.5  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.786655  normal  0.970184 
 
 
-
 
NC_006691  CNF00550  tRNA specific adenosine deaminase, putative  35.25 
 
 
239 aa  69.7  0.00000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00012286  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1603  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  40.48 
 
 
161 aa  70.1  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0633824  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1238  tRNA-adenosine deaminase  38.33 
 
 
222 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1229  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  29.23 
 
 
156 aa  69.3  0.00000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2142  tRNA-adenosine deaminase  37.72 
 
 
147 aa  69.3  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3140  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  37.1 
 
 
175 aa  68.9  0.00000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.386014 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2982  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  34.53 
 
 
175 aa  68.9  0.00000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3563  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  37.69 
 
 
166 aa  68.9  0.00000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1381  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  36.8 
 
 
175 aa  68.6  0.00000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.366116  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0677  cytosine deaminase  33.33 
 
 
145 aa  68.6  0.00000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3629  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  37.69 
 
 
166 aa  67.8  0.00000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1986  tRNA-adenosine deaminase  36 
 
 
152 aa  67.8  0.00000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.365375  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4158  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  35.9 
 
 
160 aa  67.8  0.00000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4941  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  39.67 
 
 
168 aa  67.8  0.00000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2773  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  39.2 
 
 
164 aa  67.8  0.00000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2996  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  36.8 
 
 
174 aa  67  0.0000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2778  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  37.29 
 
 
165 aa  67.4  0.0000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1221  tRNA-specific adenosine deaminase  37.69 
 
 
168 aa  67.4  0.0000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1786  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  33.33 
 
 
145 aa  67  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.315123  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0051  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  31.3 
 
 
146 aa  67.4  0.0000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_78481  cytosine deaminase  28.67 
 
 
150 aa  67.4  0.0000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.701177  normal  0.798696 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3763  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  39.23 
 
 
150 aa  67.4  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.253802  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1307  cytosine deaminase  33.58 
 
 
145 aa  66.6  0.0000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3621  tRNA-specific adenosine deaminase  38.4 
 
 
200 aa  66.6  0.0000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0013  hypothetical protein  34.59 
 
 
151 aa  66.6  0.0000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000252281  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4719  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  36.44 
 
 
174 aa  66.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.267474  normal  0.468215 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1251  tRNA-specific adenosine deaminase  38.4 
 
 
187 aa  66.6  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0516611  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1145  tRNA-specific adenosine deaminase  38.4 
 
 
200 aa  66.2  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2811  tRNA-specific adenosine deaminase  39.13 
 
 
172 aa  65.9  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.221212  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2946  tRNA-specific adenosine deaminase  39.13 
 
 
172 aa  65.9  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2771  tRNA-specific adenosine deaminase  39.13 
 
 
172 aa  65.9  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2834  tRNA-specific adenosine deaminase  39.13 
 
 
172 aa  65.9  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.730135 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4584  tRNA-adenosine deaminase  39.32 
 
 
165 aa  66.2  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2730  tRNA-specific adenosine deaminase  39.13 
 
 
172 aa  66.2  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.635658  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3656  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  38.4 
 
 
170 aa  66.2  0.0000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3121  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  35.56 
 
 
177 aa  65.9  0.0000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1480  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  28.83 
 
 
145 aa  65.5  0.0000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2973  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  29.06 
 
 
274 aa  65.9  0.0000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4089  tRNA-adenosine deaminase  33.87 
 
 
156 aa  65.9  0.0000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0226545 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1109  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  37.98 
 
 
167 aa  65.5  0.0000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0232  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  35.56 
 
 
157 aa  65.1  0.0000000005  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0819594  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2030  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  34.88 
 
 
146 aa  65.1  0.0000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000721347  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2711  tRNA-specific adenosine deaminase  37.98 
 
 
167 aa  65.5  0.0000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2704  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  34.75 
 
 
154 aa  65.1  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3399  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  34.75 
 
 
154 aa  65.1  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.837271  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3696  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  37.23 
 
 
183 aa  65.1  0.0000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0595885  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2264  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  34.56 
 
 
181 aa  65.1  0.0000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000142338  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02453  tRNA-specific adenosine deaminase  37.98 
 
 
178 aa  65.1  0.0000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0738  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  35.48 
 
 
150 aa  65.1  0.0000000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02417  hypothetical protein  37.98 
 
 
178 aa  65.1  0.0000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2843  tRNA-specific adenosine deaminase  37.98 
 
 
178 aa  65.1  0.0000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2712  tRNA-specific adenosine deaminase  37.98 
 
 
178 aa  65.1  0.0000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004282  tRNA-specific adenosine-34 deaminase  38.69 
 
 
182 aa  65.1  0.0000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3044  tRNA-specific adenosine deaminase  37.21 
 
 
169 aa  65.1  0.0000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.872342  normal  0.0227305 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2923  tRNA-specific adenosine deaminase  37.98 
 
 
178 aa  65.1  0.0000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1315  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  35.48 
 
 
163 aa  65.1  0.0000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.847285  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1271  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  36 
 
 
177 aa  65.1  0.0000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000483662  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1618  tRNA-adenosine deaminase  39.09 
 
 
158 aa  65.1  0.0000000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0117  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  31.58 
 
 
145 aa  65.1  0.0000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.515188 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0415  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  35.71 
 
 
149 aa  64.7  0.0000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.605346 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01393  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  36.72 
 
 
223 aa  64.7  0.0000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.331355  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3793  tRNA-specific adenosine deaminase  37.21 
 
 
167 aa  64.7  0.0000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3638  tRNA-adenosine deaminase  38.06 
 
 
160 aa  64.7  0.0000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0945  cytosine deaminase  34.26 
 
 
177 aa  64.3  0.000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.353729  normal  0.610423 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0612  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  37.5 
 
 
153 aa  64.3  0.000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2603  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  38.94 
 
 
155 aa  63.9  0.000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000499641  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3524  tRNA-adenosine deaminase  40 
 
 
171 aa  63.9  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0595  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  33.85 
 
 
156 aa  63.9  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1017  tRNA-adenosine deaminase  41.8 
 
 
164 aa  64.3  0.000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.251058  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0581  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  33.85 
 
 
156 aa  63.9  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.679154  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2977  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  35.78 
 
 
145 aa  63.9  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1397  cytosine deaminase  35.78 
 
 
145 aa  63.2  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1080  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  34.21 
 
 
168 aa  63.2  0.000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0018  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  36.28 
 
 
160 aa  63.5  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000222669  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4636  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  40.74 
 
 
146 aa  63.5  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0025  tRNA-adenosine deaminase  35.56 
 
 
150 aa  63.2  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000596631  hitchhiker  0.00000110312 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2506  cytosine deaminase  32.76 
 
 
149 aa  63.5  0.000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0043356  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2749  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  40 
 
 
155 aa  63.5  0.000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.58237 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1299  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  36 
 
 
178 aa  63.5  0.000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00201602  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1942  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  36.36 
 
 
152 aa  63.5  0.000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0944  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  28.75 
 
 
160 aa  63.5  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.91853  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0498  cytosine deaminase, putative  37.1 
 
 
153 aa  62.4  0.000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.490204 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1614  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  33.56 
 
 
166 aa  62.8  0.000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0790384  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2798  cytosine deaminase  34.86 
 
 
145 aa  62.4  0.000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0390  zinc-binding domain-containing protein  38.46 
 
 
193 aa  62.8  0.000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5742  Cytosine deaminase  28.7 
 
 
144 aa  62.8  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>