198 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0872 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0872  ATPase  100 
 
 
340 aa  672    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.571105  normal  0.718721 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1251  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  63.01 
 
 
347 aa  357  1.9999999999999998e-97  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2569  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.42 
 
 
327 aa  231  2e-59  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0483  ATPase  46.59 
 
 
327 aa  228  8e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0748  hypothetical protein  45.99 
 
 
347 aa  224  2e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2286  hypothetical protein  46.04 
 
 
348 aa  222  9e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2964  hypothetical protein  40.13 
 
 
348 aa  213  3.9999999999999995e-54  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.171946  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1782  ATPase  38.55 
 
 
331 aa  211  1e-53  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.860256  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1729  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  41.92 
 
 
330 aa  207  2e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000142331  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0522  AAA family ATPase  39.93 
 
 
332 aa  193  5e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.010453  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1546  hypothetical protein  43.14 
 
 
379 aa  191  1e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.776475 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1600  MoxR-like ATPase  39.21 
 
 
332 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2040  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  41.96 
 
 
364 aa  169  5e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0628555  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1319  hypothetical protein  34.88 
 
 
369 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0249  hypothetical protein  39.05 
 
 
367 aa  152  5.9999999999999996e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.211939  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1218  hypothetical protein  35.22 
 
 
369 aa  152  7e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.780645 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0256  hypothetical protein  36.54 
 
 
368 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.143072  normal  0.216525 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1403  hypothetical protein  33.65 
 
 
369 aa  146  5e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2697  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  35.35 
 
 
347 aa  144  1e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1928  MoxR-like protein ATPase-like protein  35.14 
 
 
353 aa  143  4e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1973  hypothetical protein  38.62 
 
 
372 aa  143  5e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0367199  normal  0.929244 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1490  AAA_3 ATPase  38.94 
 
 
364 aa  142  6e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1340  ATPase  40.27 
 
 
372 aa  142  9e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.287921  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0152  P-loop ATPase  39.82 
 
 
379 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1784  ATPase  39.82 
 
 
372 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6512  ATPase  34.25 
 
 
342 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5603  ATPase  33.86 
 
 
341 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1120  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  35.21 
 
 
354 aa  137  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5262  AAA ATPase  33.1 
 
 
354 aa  125  8.000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.786609  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1621  AAA ATPase  33.1 
 
 
354 aa  125  8.000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.171391  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8670  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  37.5 
 
 
414 aa  124  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0965091  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00799  ATPase  34.32 
 
 
334 aa  124  2e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000387294  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2868  ATPase  36.7 
 
 
414 aa  112  6e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.249465  normal  0.109975 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3321  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  37.18 
 
 
418 aa  108  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.395905  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1301  ATPase  30.32 
 
 
328 aa  102  1e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.777797  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1808  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  36.82 
 
 
398 aa  102  1e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.0067351  normal  0.07307 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3122  hypothetical protein  33.33 
 
 
387 aa  101  2e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0934  ATPase  36 
 
 
302 aa  100  4e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1448  ATPase  27.35 
 
 
360 aa  99.8  6e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.440303  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1850  ATPase  32.6 
 
 
351 aa  99.4  7e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5996  hypothetical protein  36.15 
 
 
369 aa  98.6  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1910  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  33.45 
 
 
360 aa  99  1e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2936  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  35.87 
 
 
361 aa  97.1  4e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.26531  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1812  ATPase  32.16 
 
 
351 aa  96.3  7e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1462  ATPase  30.54 
 
 
352 aa  94  3e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0637  hypothetical protein  24.52 
 
 
371 aa  92.4  1e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.261889  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0623  hypothetical protein  25.65 
 
 
371 aa  92.4  1e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00147327  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1222  AAA ATPase  26.24 
 
 
505 aa  91.3  2e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16090  ATPase family protein associated with various cellular activities (AAA)  27.39 
 
 
489 aa  90.1  5e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.454576  hitchhiker  0.000000267923 
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3480  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  32.51 
 
 
367 aa  89  1e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1259  AAA ATPase  31.34 
 
 
412 aa  88.2  2e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5422  ATPase  31.78 
 
 
368 aa  88.2  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2825  MoxR-like protein ATPase-like protein  29.38 
 
 
367 aa  87.4  3e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1425  AAA ATPase  29.34 
 
 
362 aa  85.9  8e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.113795 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2042  AAA ATPase  27.6 
 
 
396 aa  85.9  9e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0306993  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2494  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  25.85 
 
 
521 aa  84.3  0.000000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2669  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  30 
 
 
372 aa  84  0.000000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000749839  normal  0.0501266 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5625  ATPase  30.8 
 
 
368 aa  84  0.000000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.486488  normal  0.318658 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5803  ATPase  30.8 
 
 
368 aa  84  0.000000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000039959 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4134  ATPase  30.04 
 
 
379 aa  73.6  0.000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2360  hypothetical protein  25.9 
 
 
359 aa  73.6  0.000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.615726  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0805  hypothetical protein  27.65 
 
 
355 aa  67  0.0000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0051  hypothetical protein  26.61 
 
 
353 aa  66.6  0.0000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.645365  normal  0.49777 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3359  hypothetical protein  29.21 
 
 
353 aa  64.7  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2921  hypothetical protein  28.92 
 
 
353 aa  65.1  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.772953 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1363  hypothetical protein  28.92 
 
 
353 aa  64.3  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1491  MoxR protein, putative  35.53 
 
 
315 aa  60.5  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00106383  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1883  ATPase  32.61 
 
 
306 aa  59.7  0.00000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.666763 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1800  hypothetical protein  25.21 
 
 
381 aa  55.1  0.000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3493  ATPase  29.08 
 
 
356 aa  53.9  0.000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2044  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  31.34 
 
 
314 aa  53.1  0.000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2303  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  31.39 
 
 
306 aa  52.8  0.000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2370  MoxR-like ATPase  26.47 
 
 
305 aa  52.8  0.000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.470488  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2814  ATPase  31.39 
 
 
306 aa  52.8  0.000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.826305  normal  0.378923 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1689  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  28.87 
 
 
338 aa  52.8  0.000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3009  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  30.29 
 
 
331 aa  52.8  0.000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.116146  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0864  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  34.53 
 
 
317 aa  52  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2386  ATPase  31.06 
 
 
306 aa  52.4  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02436  methanol dehydrogenase regulator  34.18 
 
 
308 aa  51.6  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.808259  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1523  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  28.06 
 
 
305 aa  51.6  0.00002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2964  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  32.06 
 
 
305 aa  50.8  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00460178 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3552  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  30 
 
 
403 aa  50.8  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2426  ATPase  30.94 
 
 
314 aa  51.2  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.624284  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2774  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  28.12 
 
 
351 aa  50.8  0.00003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.335282  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1323  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  32.85 
 
 
308 aa  51.2  0.00003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.167846  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1319  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  32.06 
 
 
305 aa  50.4  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.225363  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0475  ATPase  23.72 
 
 
383 aa  50.4  0.00004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2163  ATPase  31.39 
 
 
306 aa  50.4  0.00004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.591841  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0415  ATPase  29.11 
 
 
302 aa  50.8  0.00004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1365  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  26.14 
 
 
313 aa  49.7  0.00007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.780175  normal  0.334218 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2096  ATPase  29.93 
 
 
306 aa  49.7  0.00008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0462  MoxR family ATPase  31.9 
 
 
343 aa  49.3  0.00009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1792  ATPase  33.74 
 
 
317 aa  48.9  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.611153  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2119  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  28.67 
 
 
334 aa  48.9  0.0001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0947462  normal  0.0709428 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0042  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  27.34 
 
 
325 aa  49.3  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0456  MoxR-like ATPase  28.66 
 
 
318 aa  48.9  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1419  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  26.97 
 
 
345 aa  48.9  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_71553  predicted protein  32.17 
 
 
4979 aa  48.5  0.0002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.473575 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1103  MoxR-related protein  28.28 
 
 
318 aa  48.1  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0941  ATPase  27.61 
 
 
308 aa  48.1  0.0002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>