286 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0707 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0707  phenylacetic acid degradation-related protein  100 
 
 		 139 aa  283  5e-76  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2200  thioesterase superfamily protein  60.31 
 
 		 139 aa  164  5e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0908  phenylacetic acid degradation-related protein  60.15 
 
 		 137 aa  163  5.9999999999999996e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3491  phenylacetic acid degradation-related protein  58.78 
 
 		 139 aa  157  4e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.782631 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1007  thioesterase superfamily protein  59.54 
 
 		 139 aa  157  4e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3582  phenylacetic acid degradation-related protein  55.56 
 
 		 143 aa  152  1e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.728907 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5184  putative esterase; putative phenylacetic acid degradation-related  56.3 
 
 		 142 aa  147  5e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.365814 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3644  thioesterase superfamily protein  57.78 
 
 		 143 aa  146  7e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0342  thioesterase superfamily protein  57.45 
 
 		 153 aa  146  1.0000000000000001e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0275  comA operon protein 2  50 
 
 		 139 aa  144  6e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0294  thioesterase superfamily protein  63.64 
 
 		 141 aa  143  9e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.356401  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2790  thioesterase family protein  51.91 
 
 		 139 aa  142  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.611974  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1162  thioesterase family protein  50 
 
 		 199 aa  142  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2944  thioesterase family protein  51.15 
 
 		 139 aa  141  4e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3233  phenylacetic acid degradation-related protein  53.44 
 
 		 139 aa  132  9.999999999999999e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.32812  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1614  thioesterase superfamily protein  38.6 
 
 		 136 aa  86.7  9e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0333607 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2101  thioesterase superfamily protein  37.17 
 
 		 135 aa  82.4  0.000000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2353  phenylacetic acid degradation-like protein  42.24 
 
 		 132 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.360376 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3655  hypothetical protein  35.88 
 
 		 145 aa  81.3  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.282714  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43600  hypothetical protein  35.88 
 
 		 145 aa  81.3  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0351333  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3441  thioesterase superfamily protein  38.64 
 
 		 132 aa  81.3  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.592897  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3890  hypothetical protein  39.39 
 
 		 133 aa  80.5  0.000000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.483397 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6229  thioesterase superfamily protein  34.11 
 
 		 144 aa  78.6  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.479788  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5139  thioesterase superfamily protein  31.3 
 
 		 141 aa  77.4  0.00000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1468  thioesterase superfamily protein  33.08 
 
 		 145 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3232  phenylacetic acid degradation-related protein  33.85 
 
 		 145 aa  76.3  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.335401  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2507  phenylacetic acid degradation-like protein  39.13 
 
 		 160 aa  75.5  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0305334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1083  phenylacetic acid degradation-related protein  34.88 
 
 		 132 aa  75.5  0.0000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1884  thioesterase superfamily protein  31.54 
 
 		 134 aa  74.7  0.0000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000959247  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4204  phenylacetic acid degradation-like protein  30.53 
 
 		 147 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.517567 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2347  phenylacetic acid degradation-related protein  32.33 
 
 		 144 aa  74.7  0.0000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0102  thioesterase superfamily protein  32.31 
 
 		 144 aa  73.9  0.0000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.306463  normal  0.0212661 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03576  esterase YdiI  36.15 
 
 		 142 aa  73.9  0.0000000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.653311  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2401  hypothetical protein  33.33 
 
 		 136 aa  72.8  0.000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00259206 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3063  thioesterase superfamily protein  31.16 
 
 		 139 aa  72.8  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.530863  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09903  hypothetical protein  32.77 
 
 		 140 aa  72.8  0.000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.229985  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1510  hypothetical protein  33.08 
 
 		 136 aa  72.4  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.564013  hitchhiker  0.000000864197 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2403  thioesterase superfamily protein  30.37 
 
 		 139 aa  71.6  0.000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2937  phenylacetic acid degradation-like protein  38.26 
 
 		 132 aa  71.6  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.332446  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1462  hypothetical protein  32.31 
 
 		 136 aa  72  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.134025 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0944  hypothetical protein  28.83 
 
 		 124 aa  71.6  0.000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00659595  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0963  hypothetical protein  28.83 
 
 		 124 aa  71.6  0.000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000957659  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2463  thioesterase superfamily protein  32.06 
 
 		 147 aa  71.2  0.000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0884978  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01655  hypothetical protein  32.31 
 
 		 136 aa  70.9  0.000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.243224  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1956  thioesterase superfamily protein  32.31 
 
 		 136 aa  70.9  0.000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.71253  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1767  hypothetical protein  32.31 
 
 		 136 aa  70.9  0.000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0044  hypothetical protein  36.97 
 
 		 140 aa  70.9  0.000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.338792  normal  0.576658 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01644  hypothetical protein  32.31 
 
 		 136 aa  70.9  0.000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.243206  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1902  hypothetical protein  32.31 
 
 		 136 aa  70.9  0.000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0509898  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0064  thioesterase superfamily protein  36.97 
 
 		 140 aa  70.9  0.000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2452  thioesterase superfamily protein  31.82 
 
 		 138 aa  70.9  0.000000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.139649  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2177  thioesterase superfamily protein  34.62 
 
 		 138 aa  70.9  0.000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.554622  hitchhiker  0.00530749 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1887  hypothetical protein  32.31 
 
 		 136 aa  70.9  0.000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1660  thioesterase superfamily protein  32.84 
 
 		 140 aa  70.5  0.000000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0414266  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1945  hypothetical protein  32.31 
 
 		 136 aa  70.1  0.000000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000536011 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2754  thioesterase superfamily protein  31.82 
 
 		 138 aa  70.1  0.000000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.127218  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0099  hypothetical protein  33.83 
 
 		 140 aa  70.1  0.000000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2446  thioesterase superfamily protein  30.95 
 
 		 138 aa  69.7  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.16882 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1806  hypothetical protein  31.54 
 
 		 136 aa  68.6  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0972306  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2216  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase domain protein  31.11 
 
 		 147 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1977  hypothetical protein  31.54 
 
 		 136 aa  68.6  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000333806 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1497  hypothetical protein  31.54 
 
 		 136 aa  68.6  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00047246 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1478  hypothetical protein  31.54 
 
 		 136 aa  68.6  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.301889  hitchhiker  0.0000119819 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1846  thioesterase superfamily protein  33.08 
 
 		 138 aa  67.8  0.00000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1740  esterase YdiI  33.08 
 
 		 138 aa  67.8  0.00000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2595  hypothetical protein  33.08 
 
 		 138 aa  67.8  0.00000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4719  thioesterase superfamily protein  28.03 
 
 		 143 aa  68.2  0.00000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0069  thioesterase superfamily protein  31.58 
 
 		 140 aa  67.8  0.00000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0548  hypothetical protein  31.82 
 
 		 150 aa  67.8  0.00000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0710753 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1024  thioesterase superfamily protein  29.66 
 
 		 142 aa  67.4  0.00000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2909  thioesterase superfamily protein  30.6 
 
 		 138 aa  67  0.00000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1589  ComA operon protein (competence protein)  28.7 
 
 		 124 aa  67  0.00000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0541408  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3883  thioesterase superfamily protein  28.69 
 
 		 145 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000319228 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1692  thioesterase superfamily protein  30.37 
 
 		 140 aa  65.5  0.0000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.879751  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0061  phenylacetic acid degradation-related protein  31.58 
 
 		 140 aa  65.5  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.518307  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0946  hypothetical protein  28.36 
 
 		 139 aa  65.1  0.0000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2025  phenylacetic acid degradation-related protein  29.77 
 
 		 147 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.24286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2224  thioesterase superfamily protein  30.53 
 
 		 142 aa  64.7  0.0000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00436859  hitchhiker  0.00000299365 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0636  thioesterase superfamily protein  28.69 
 
 		 145 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0530  ComA2 family protein  27.03 
 
 		 124 aa  64.3  0.0000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.184702  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3526  thioesterase superfamily protein  34.09 
 
 		 127 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2603  hypothetical protein  30.23 
 
 		 149 aa  64.3  0.0000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.104103  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0561  hypothetical protein  28.69 
 
 		 145 aa  63.9  0.0000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1451  phenylacetic acid degradation-related protein  30.23 
 
 		 142 aa  64.3  0.0000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0114  phenylacetic acid degradation-related protein  33.33 
 
 		 142 aa  63.9  0.0000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.503505 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2153  thioesterase superfamily protein  35.34 
 
 		 132 aa  63.5  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.446608  normal  0.433555 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3484  thioesterase superfamily protein  36.36 
 
 		 135 aa  63.2  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0438493 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5047  putative comA operon protein  32.95 
 
 		 127 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.766218  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4737  thioesterase superfamily protein  32.95 
 
 		 127 aa  62.8  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00953247  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0187  putative comA operon protein  32.95 
 
 		 127 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5054  comA operon protein, putative  32.95 
 
 		 127 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1314  thioesterase superfamily protein  30.3 
 
 		 138 aa  62.8  0.000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3942  hypothetical protein  25.19 
 
 		 145 aa  62.8  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.196603 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0084  thioesterase superfamily protein  31.06 
 
 		 157 aa  62.4  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1441  hypothetical protein  32.35 
 
 		 153 aa  62  0.000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2944  hypothetical protein  27.41 
 
 		 145 aa  61.6  0.000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.121135 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3192  hypothetical protein  27.05 
 
 		 149 aa  61.6  0.000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.15742  normal  0.345039 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1498  thioesterase superfamily protein  31.03 
 
 		 149 aa  61.2  0.000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1317  phenylacetic acid degradation-related protein  29.17 
 
 		 172 aa  61.2  0.000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3092  phenylacetic acid degradation-related protein  27.41 
 
 		 158 aa  61.2  0.000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>