More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0330 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0330  queuine tRNA-ribosyltransferase  100 
 
 		 388 aa  800    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00349082 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2997  queuine tRNA-ribosyltransferase  66.15 
 
 		 384 aa  539  9.999999999999999e-153  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.804004  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2476  queuine tRNA-ribosyltransferase  67.54 
 
 		 383 aa  535  1e-151  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0632  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.65 
 
 		 392 aa  417  9.999999999999999e-116  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0931  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.6 
 
 		 394 aa  416  9.999999999999999e-116  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12290  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.32 
 
 		 373 aa  412  1e-114  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000356741  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0852  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.8 
 
 		 370 aa  403  1e-111  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1330  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.8 
 
 		 365 aa  401  9.999999999999999e-111  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.442991  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2435  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.36 
 
 		 372 aa  395  1e-109  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1782  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.36 
 
 		 372 aa  395  1e-109  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00114635 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1716  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.43 
 
 		 371 aa  394  1e-108  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.2965  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3622  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.39 
 
 		 372 aa  394  1e-108  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00110996  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1791  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.4 
 
 		 370 aa  393  1e-108  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000378979  hitchhiker  0.00274251 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2619  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.21 
 
 		 373 aa  389  1e-107  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1457  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.41 
 
 		 375 aa  388  1e-107  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000844701  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1666  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.12 
 
 		 370 aa  390  1e-107  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.098612  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0455  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.31 
 
 		 384 aa  386  1e-106  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0958  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.86 
 
 		 374 aa  388  1e-106  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0452051  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1696  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.27 
 
 		 379 aa  382  1e-105  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1729  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.27 
 
 		 379 aa  382  1e-105  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.37523  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3755  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.8 
 
 		 387 aa  384  1e-105  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.145582 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1694  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.69 
 
 		 373 aa  382  1e-105  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.556038 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1194  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.27 
 
 		 367 aa  382  1e-105  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0530  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.69 
 
 		 373 aa  383  1e-105  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00176978  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1259  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.93 
 
 		 379 aa  379  1e-104  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.527316  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1203  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.42 
 
 		 379 aa  377  1e-103  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.261953  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0919  queuine tRNA-ribosyltransferase  54 
 
 		 381 aa  378  1e-103  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2518  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.73 
 
 		 380 aa  375  1e-103  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00624233  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1347  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.84 
 
 		 372 aa  375  1e-103  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0820  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.93 
 
 		 387 aa  378  1e-103  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0505  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.92 
 
 		 394 aa  375  1e-103  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0930  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.55 
 
 		 380 aa  378  1e-103  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1785  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.6 
 
 		 380 aa  376  1e-103  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0229472  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0605  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.23 
 
 		 395 aa  376  1e-103  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.522263 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1800  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.03 
 
 		 374 aa  375  1e-103  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1187  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.47 
 
 		 384 aa  373  1e-102  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00200873  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2795  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.1 
 
 		 366 aa  374  1e-102  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3305  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.81 
 
 		 366 aa  372  1e-102  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.423867 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1699  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.68 
 
 		 382 aa  372  1e-102  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1290  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.24 
 
 		 375 aa  372  1e-102  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14600  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.24 
 
 		 372 aa  373  1e-102  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3384  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.9 
 
 		 374 aa  369  1e-101  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000344335  normal  0.488605 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3123  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.9 
 
 		 374 aa  369  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00561158  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2844  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.1 
 
 		 377 aa  370  1e-101  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0875  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.11 
 
 		 375 aa  370  1e-101  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.68635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3264  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.9 
 
 		 374 aa  369  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000400897  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2833  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.28 
 
 		 372 aa  368  1e-101  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01046  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.17 
 
 		 378 aa  368  1e-101  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1703  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.97 
 
 		 383 aa  368  1e-101  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.108277  normal  0.62465 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2456  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.8 
 
 		 367 aa  370  1e-101  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.359127  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2011  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.53 
 
 		 380 aa  369  1e-101  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.638578  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4345  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.41 
 
 		 377 aa  368  1e-101  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000330572 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0159  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.81 
 
 		 382 aa  368  1e-101  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.95405  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00354  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.99 
 
 		 375 aa  366  1e-100  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.520405  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3203  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.99 
 
 		 375 aa  366  1e-100  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.372376  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0833  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.25 
 
 		 371 aa  368  1e-100  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.936074  normal  0.0233256 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02941  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.62 
 
 		 372 aa  368  1e-100  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.483841  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0396  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.28 
 
 		 380 aa  368  1e-100  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000954967  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0486  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.99 
 
 		 375 aa  366  1e-100  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00358  hypothetical protein  47.99 
 
 		 375 aa  366  1e-100  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.575633  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0876  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.96 
 
 		 377 aa  367  1e-100  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.321375 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3291  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.9 
 
 		 381 aa  367  1e-100  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1524  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.25 
 
 		 383 aa  368  1e-100  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000558338  normal  0.0203734 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0382  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.57 
 
 		 357 aa  366  1e-100  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1275  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.22 
 
 		 336 aa  368  1e-100  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2906  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.86 
 
 		 387 aa  366  1e-100  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.905549  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0270  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.17 
 
 		 379 aa  367  1e-100  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.147453  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004367  tRNA-guanine transglycosylase  46.9 
 
 		 382 aa  366  1e-100  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1019  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.53 
 
 		 381 aa  367  1e-100  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2398  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.68 
 
 		 368 aa  368  1e-100  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000165402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3134  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.63 
 
 		 379 aa  366  1e-100  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.212476  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3227  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.99 
 
 		 375 aa  366  1e-100  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000187089 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0436  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.99 
 
 		 375 aa  366  1e-100  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40480  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.67 
 
 		 371 aa  366  1e-100  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0521  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.27 
 
 		 371 aa  367  1e-100  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3227  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.24 
 
 		 375 aa  366  1e-100  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.956515 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2435  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.17 
 
 		 375 aa  365  1e-100  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2757  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.96 
 
 		 386 aa  365  1e-100  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.717518 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0438  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.99 
 
 		 375 aa  366  1e-100  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0325  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.99 
 
 		 375 aa  366  1e-100  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0863  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.96 
 
 		 377 aa  368  1e-100  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.313127 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0476  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.99 
 
 		 375 aa  366  1e-100  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0444  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.72 
 
 		 375 aa  365  1e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1061  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.08 
 
 		 374 aa  365  1e-99  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00184616 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2109  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.42 
 
 		 379 aa  364  1e-99  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0451  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.72 
 
 		 375 aa  365  1e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0945287  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0505  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.72 
 
 		 375 aa  365  1e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0445  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.72 
 
 		 375 aa  364  1e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0464  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.72 
 
 		 375 aa  365  1e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.992026  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2068  Queuine tRNA-ribosyltransferase  49.45 
 
 		 371 aa  364  1e-99  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3407  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.12 
 
 		 370 aa  363  2e-99  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.38542  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3520  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.14 
 
 		 377 aa  363  2e-99  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.1241  normal  0.323798 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4502  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.8 
 
 		 379 aa  363  4e-99  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000575969  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1120  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.19 
 
 		 385 aa  362  4e-99  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.38532  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4161  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.8 
 
 		 379 aa  363  4e-99  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000310592  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4647  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.8 
 
 		 379 aa  363  4e-99  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000256565  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4551  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.8 
 
 		 379 aa  363  4e-99  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000170513  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0699  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.8 
 
 		 379 aa  363  4e-99  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000227158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2647  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.9 
 
 		 381 aa  362  4e-99  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.0000000956702  hitchhiker  0.00180241 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0907  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.44 
 
 		 372 aa  363  4e-99  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>