47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_5680 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_5680  hypothetical protein  100 
 
 		 366 aa  751    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0387198  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0808  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  32.29 
 
 		 362 aa  159  8e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000170863  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0249  Shikimate/quinate 5-dehydrogenase  29.89 
 
 		 370 aa  154  2.9999999999999998e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00032725  normal  0.391108 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0115  Shikimate/quinate 5-dehydrogenase  30.52 
 
 		 364 aa  148  1.0000000000000001e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000323099  hitchhiker  0.00167749 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0150  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  30.68 
 
 		 360 aa  146  5e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000131066  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1649  Shikimate/quinate 5-dehydrogenase  30.57 
 
 		 359 aa  142  7e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0173  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  30.48 
 
 		 357 aa  139  7e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000696733  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0129  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  30.95 
 
 		 371 aa  139  7.999999999999999e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.00000000445979  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00730  Shikimate/quinate 5-dehydrogenase  30.03 
 
 		 362 aa  125  1e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000274075  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04713  putative aminotransferase protein  29.81 
 
 		 845 aa  112  7.000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.924872 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2483  dehydrogenase-like protein  28.45 
 
 		 728 aa  112  8.000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0417165  normal  0.165062 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4364  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  25.89 
 
 		 691 aa  111  2.0000000000000002e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0103685  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2362  dehydrogenase-like protein  28.45 
 
 		 728 aa  111  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.221453 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0662  Shikimate/quinate 5-dehydrogenase  25.56 
 
 		 681 aa  109  8.000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0104064  hitchhiker  0.00000472149 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1059  dehydrogenase-like  28.32 
 
 		 684 aa  107  3e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1668  putative dehydrogenase  26.72 
 
 		 689 aa  106  7e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0410472  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6305  aminotransferase class-III  29.31 
 
 		 955 aa  102  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.946043 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1617  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  25.36 
 
 		 685 aa  100  3e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1964  putative dehydrogenase  26.5 
 
 		 710 aa  100  4e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.220999  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0399  hypothetical protein  33.33 
 
 		 340 aa  98.2  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.247515  normal  0.582942 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05971  dehydrogenase  29.6 
 
 		 346 aa  98.2  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.620838  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1330  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  25.07 
 
 		 685 aa  97.4  3e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.372745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0898  dehydrogenase-like protein  28.84 
 
 		 340 aa  96.7  6e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0157574  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0872  dehydrogenase like protein  28.84 
 
 		 340 aa  96.7  6e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1566  dehydrogenase-like protein  28.61 
 
 		 707 aa  95.1  1e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.386533  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2305  dehydrogenase-like  29.17 
 
 		 720 aa  95.1  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1644  dehydrogenase-like protein  28.41 
 
 		 707 aa  94.4  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2279  hypothetical protein  28.2 
 
 		 339 aa  92.4  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.898255 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05891  dehydrogenase  28.45 
 
 		 346 aa  91.3  3e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0334693  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05891  dehydrogenase  28.45 
 
 		 346 aa  89.7  8e-17  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.735878  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05361  dehydrogenase  28.67 
 
 		 346 aa  89  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2534  hypothetical protein  29.21 
 
 		 339 aa  89  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05591  dehydrogenase  28.16 
 
 		 346 aa  88.2  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1864  dehydrogenase  28.16 
 
 		 346 aa  88.6  2e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0533  hypothetical protein  28.45 
 
 		 346 aa  87.8  3e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1634  hypothetical protein  29.03 
 
 		 346 aa  84.7  0.000000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.509196  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1594  hypothetical protein  28.2 
 
 		 341 aa  85.1  0.000000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.293919 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0440  putative class-III aminotransferase  26.44 
 
 		 891 aa  82  0.00000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0001965  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1254  protein of unknown function DUF205  26.96 
 
 		 574 aa  82.4  0.00000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.9558  normal  0.305152 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0989  hypothetical protein  26.78 
 
 		 556 aa  82  0.00000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.39207  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3370  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.04 
 
 		 339 aa  81.6  0.00000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.121651  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0729  hypothetical protein  27.82 
 
 		 346 aa  80.1  0.00000000000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2946  aminotransferase class-III  25.69 
 
 		 957 aa  77  0.0000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.818635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1012  hypothetical protein  25.59 
 
 		 560 aa  73.6  0.000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0262179  hitchhiker  0.000000557566 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07811  hypothetical protein  29.51 
 
 		 191 aa  66.2  0.0000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2782  pyridoxalphosphate dependent aminotransferase, class III  29.1 
 
 		 959 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2973  aminotransferase class-III  29.1 
 
 		 956 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>