More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_5582 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_5582  beta-lactamase domain protein  100 
 
 		 322 aa  660    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2292  beta-lactamase domain protein  57.88 
 
 		 321 aa  325  9e-88  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0204091  normal  0.304902 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2424  beta-lactamase domain protein  51.84 
 
 		 322 aa  288  8e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.238173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3996  beta-lactamase domain-containing protein  54.03 
 
 		 296 aa  283  2.0000000000000002e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.590455  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4636  beta-lactamase domain protein  52.11 
 
 		 299 aa  271  1e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.218254 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5818  beta-lactamase domain protein  51.57 
 
 		 294 aa  268  7e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2870  metal-dependent hydrolase  48.28 
 
 		 285 aa  266  4e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.154446  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2563  beta-lactamase domain protein  51.85 
 
 		 282 aa  265  5e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2427  beta-lactamase domain-containing protein  49.82 
 
 		 300 aa  264  1e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.501309  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3121  metallo-beta-lactamase family protein  47.51 
 
 		 285 aa  263  4e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2128  metal-dependent hydrolase  48.28 
 
 		 281 aa  262  4.999999999999999e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3110  metallo-beta-lactamase family protein  47.51 
 
 		 285 aa  261  8e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4522  beta-lactamase domain protein  51.78 
 
 		 299 aa  260  2e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.231723  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2561  beta-lactamase domain protein  51.84 
 
 		 275 aa  259  4e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000265837  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1047  beta-lactamase domain-containing protein  50.79 
 
 		 295 aa  259  6e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2900  metallo-beta-lactamase family protein  47.13 
 
 		 285 aa  258  7e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.248774  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3118  metallo-beta-lactamase family protein  47.13 
 
 		 281 aa  258  7e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4154  beta-lactamase domain-containing protein  52.17 
 
 		 299 aa  258  7e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.336345 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3140  metallo-beta-lactamase family protein  47.17 
 
 		 281 aa  258  1e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0313805  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2827  metal-dependent hydrolase  46.74 
 
 		 285 aa  258  1e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0133277  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3142  metallo-beta-lactamase family protein  46.36 
 
 		 285 aa  257  2e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0970008  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3529  beta-lactamase-like  51.44 
 
 		 277 aa  256  5e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0769  beta-lactamase domain-containing protein  47.47 
 
 		 273 aa  254  1.0000000000000001e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.310253 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0508  beta-lactamase domain protein  50.4 
 
 		 295 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6386  beta-lactamase domain-containing protein  38.67 
 
 		 300 aa  152  7e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1675  beta-lactamase domain protein  30.96 
 
 		 242 aa  89  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1078  beta-lactamase domain protein  29.54 
 
 		 402 aa  87  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.123154  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0646  beta-lactamase domain protein  28.28 
 
 		 226 aa  81.3  0.00000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4375  metallo-beta-lactamase family protein  31.68 
 
 		 209 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19030  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  27.86 
 
 		 278 aa  80.1  0.00000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.936146  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4003  metallo-beta-lactamase family protein  31.68 
 
 		 209 aa  79.7  0.00000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4341  metallo-beta-lactamase family protein  31.06 
 
 		 209 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4394  metallo-beta-lactamase family protein  31.06 
 
 		 209 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0859  metallo-beta-lactamase family protein  31.06 
 
 		 209 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4281  metallo-beta-lactamase family protein  31.68 
 
 		 209 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2372  putative hydrolase  31.82 
 
 		 217 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2505  putative hydrolase  33.18 
 
 		 217 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.341858  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4013  metallo-beta-lactamase family protein  31.06 
 
 		 209 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.098472  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1391  beta-lactamase domain-containing protein  26.67 
 
 		 244 aa  77.8  0.0000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.354164  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2440  hydrolase, putative  32.84 
 
 		 217 aa  77  0.0000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0911202  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1024  beta-lactamase domain protein  31.82 
 
 		 256 aa  77  0.0000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0619  beta-lactamase domain protein  28.63 
 
 		 240 aa  76.6  0.0000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.256454 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4163  metallo-beta-lactamase family protein  31.06 
 
 		 208 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00575624  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4485  metallo-beta-lactamase family protein  31.06 
 
 		 208 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.859552  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2960  putative hydrolase  30.91 
 
 		 217 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0047526 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2384  beta-lactamase domain protein  29.72 
 
 		 230 aa  75.5  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4114  beta-lactamase domain-containing protein  28.57 
 
 		 209 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2989  beta-lactamase domain-containing protein  30.43 
 
 		 209 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.86043  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2241  hydrolase  31.36 
 
 		 217 aa  73.6  0.000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.282445  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2175  metal-dependent hydrolase  31.36 
 
 		 217 aa  73.6  0.000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000879537  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2405  hydrolase  31.36 
 
 		 217 aa  73.6  0.000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.903974  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2422  putative hydrolase  31.36 
 
 		 217 aa  73.6  0.000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2161  metal-dependent hydrolase  31.36 
 
 		 217 aa  73.6  0.000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.57885  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2218  beta-lactamase domain-containing protein  30.54 
 
 		 217 aa  73.6  0.000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.250629  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3735  beta-lactamase domain protein  26.85 
 
 		 246 aa  72.8  0.000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.555348  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0198  beta-lactamase domain protein  30.67 
 
 		 210 aa  72  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5152  metallo-beta-lactamase family protein  31.8 
 
 		 240 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.810942  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4874  metallo-beta-lactamase family protein  29.83 
 
 		 240 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5245  metallo-beta-lactamase family protein  29.83 
 
 		 240 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0022  beta-lactamase domain protein  30.37 
 
 		 213 aa  70.1  0.00000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.887133  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0019  beta-lactamase domain-containing protein  29.78 
 
 		 207 aa  70.1  0.00000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.751358  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5146  metallo-beta-lactamase family protein  31.8 
 
 		 240 aa  70.1  0.00000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2493  beta-lactamase-like  29.57 
 
 		 232 aa  70.1  0.00000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2916  beta-lactamase-like protein  27.27 
 
 		 239 aa  70.1  0.00000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4832  beta-lactamase domain-containing protein  31.51 
 
 		 240 aa  69.3  0.00000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4731  metallo-beta-lactamase family protein  29.58 
 
 		 240 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2375  beta-lactamase domain protein  27.5 
 
 		 210 aa  68.9  0.0000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5114  metallo-beta-lactamase family protein  31.34 
 
 		 240 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3947  beta-lactamase domain protein  26.91 
 
 		 246 aa  67.8  0.0000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.304771  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5606  beta-lactamase domain protein  29.86 
 
 		 221 aa  68.6  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4716  metallo-beta-lactamase family protein  29.58 
 
 		 240 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3562  beta-lactamase domain protein  31.86 
 
 		 228 aa  67  0.0000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.000949082  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5141  metallo-beta-lactamase family protein  31.05 
 
 		 240 aa  66.6  0.0000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2879  beta-lactamase domain protein  28.57 
 
 		 216 aa  66.6  0.0000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.191235  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0619  beta-lactamase domain-containing protein  32 
 
 		 273 aa  65.9  0.0000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1374  beta-lactamase domain-containing protein  26.64 
 
 		 192 aa  65.9  0.0000000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.09884  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1919  beta-lactamase domain protein  28.83 
 
 		 243 aa  65.1  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000566164  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1101  beta-lactamase domain protein  37.5 
 
 		 232 aa  64.7  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1263  beta-lactamase domain protein  24.03 
 
 		 231 aa  63.9  0.000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.795749 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5069  beta-lactamase domain protein  29.09 
 
 		 214 aa  63.5  0.000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.137937  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0097  metal-dependent hydrolase  25.73 
 
 		 239 aa  62.8  0.000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.233639  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1399  beta-lactamase domain protein  27.13 
 
 		 230 aa  62.8  0.000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.290066 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0387  beta-lactamase domain-containing protein  24.57 
 
 		 231 aa  62.8  0.000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.084331  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2087  hydrolase  32.43 
 
 		 224 aa  62  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2167  beta-lactamase domain protein  30.51 
 
 		 245 aa  62.4  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0330732  normal  0.0181786 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1110  metallo-beta-lactamase family protein  30.25 
 
 		 207 aa  61.2  0.00000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1796  beta-lactamase domain-containing protein  23.26 
 
 		 230 aa  61.2  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2310  beta-lactamase domain protein  30.3 
 
 		 246 aa  60.5  0.00000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.1865  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3547  hypothetical protein  28.95 
 
 		 255 aa  60.5  0.00000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.152924  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0406  metallo-beta-lactamase superfamily protein  28.12 
 
 		 209 aa  60.1  0.00000005  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.735657  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1287  beta-lactamase domain-containing protein  30.34 
 
 		 226 aa  60.1  0.00000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0372729  normal  0.0146108 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0443  beta-lactamase domain protein  26.01 
 
 		 208 aa  59.3  0.00000009  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1603  beta-lactamase domain-containing protein  27.8 
 
 		 207 aa  59.3  0.00000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0599073  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1637  beta-lactamase domain-containing protein  27.8 
 
 		 207 aa  59.3  0.00000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.084203  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2396  beta-lactamase domain protein  27.52 
 
 		 228 aa  58.9  0.0000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1873  beta-lactamase domain protein  27.59 
 
 		 244 aa  58.9  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.871278  normal  0.674736 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3171  beta-lactamase domain protein  26.44 
 
 		 211 aa  58.9  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.343145 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2902  metallo-beta-lactamase family protein  26.76 
 
 		 228 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.150382  normal  0.132575 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2141  Beta-lactamase-like  26.58 
 
 		 354 aa  58.5  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3968  beta-lactamase domain-containing protein  24.58 
 
 		 317 aa  58.2  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0386675  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>