More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_5368 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_5368  Sigma 54 interacting domain protein  100 
 
 		 614 aa  1249    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03742  chelatase protein  49.31 
 
 		 637 aa  557  1e-157  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.84057 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1776  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  40.48 
 
 		 688 aa  467  9.999999999999999e-131  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0449  magnesium chelatase  39.12 
 
 		 669 aa  421  1e-116  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0156382  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1910  Magnesium chelatase  39.58 
 
 		 660 aa  408  1.0000000000000001e-112  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2071  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  41.52 
 
 		 622 aa  403  1e-111  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.498251  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2054  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  41.52 
 
 		 622 aa  403  1e-111  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.457872  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2117  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  41.52 
 
 		 622 aa  403  1e-111  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0165109 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0291  magnesium chelatase, ChlI subunit  38.86 
 
 		 680 aa  402  9.999999999999999e-111  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.129294 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1277  Magnesium chelatase  39.48 
 
 		 650 aa  400  9.999999999999999e-111  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.951784  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1020  cobaltochelatase subunit  38.89 
 
 		 653 aa  398  1e-109  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.816011  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1261  magnesium chelatase  37.72 
 
 		 689 aa  396  1e-109  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1700  Sigma 54 interacting domain protein  40.96 
 
 		 618 aa  395  1e-108  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.808868  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1192  Magnesium chelatase  38.26 
 
 		 696 aa  390  1e-107  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000678359  hitchhiker  0.00162635 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4050  magnesium chelatase  41.13 
 
 		 626 aa  386  1e-106  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2302  magnesium chelatase  42.58 
 
 		 638 aa  385  1e-106  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141886 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0546  cobaltochelatase subunit  40.68 
 
 		 674 aa  381  1e-104  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.200541  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1209  magnesium chelatase  38.82 
 
 		 670 aa  369  1e-101  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12865  magnesium chelatase  41.49 
 
 		 629 aa  372  1e-101  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.498334  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3857  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  37.72 
 
 		 665 aa  364  3e-99  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.149974  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6039  Magnesium chelatase  38.38 
 
 		 719 aa  360  4e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2889  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  39.73 
 
 		 653 aa  359  8e-98  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1621  von Willebrand factor type A  38.02 
 
 		 699 aa  355  1e-96  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.921819  normal  0.480885 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2134  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  37.63 
 
 		 674 aa  340  5e-92  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.118601  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4044  magnesium chelatase ATPase subunit D  33.94 
 
 		 671 aa  319  1e-85  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.653268 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0556  Magnesium chelatase  51.4 
 
 		 346 aa  311  2.9999999999999997e-83  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1208  magnesium chelatase  51.25 
 
 		 372 aa  311  2.9999999999999997e-83  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0636  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  49.07 
 
 		 616 aa  309  8e-83  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.122113  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1420  magnesium chelatase  48.77 
 
 		 364 aa  307  5.0000000000000004e-82  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.79128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3097  magnesium chelatase  48.75 
 
 		 364 aa  303  5.000000000000001e-81  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.822319  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3380  magnesium chelatase  33.61 
 
 		 594 aa  302  1e-80  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.193165 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2088  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  35.66 
 
 		 600 aa  296  1e-78  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2299  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  46.99 
 
 		 788 aa  293  5e-78  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.291711  normal  0.0239656 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2274  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  32.08 
 
 		 677 aa  291  2e-77  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1835  magnesium chelatase ATPase subunit I  49.52 
 
 		 336 aa  290  7e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.053644 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2433  magnesium chelatase ATPase subunit I  49.03 
 
 		 337 aa  289  1e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1262  magnesium chelatase  46.46 
 
 		 345 aa  289  1e-76  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.885997  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1046  magnesium chelatase ATPase subunit I  45.62 
 
 		 383 aa  288  2e-76  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0697348 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1438  magnesium chelatase ATPase subunit I  45.62 
 
 		 383 aa  287  2.9999999999999996e-76  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0127945  normal  0.972517 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0108  magnesium chelatase  44.95 
 
 		 356 aa  286  5.999999999999999e-76  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.013372  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2728  magnesium chelatase ATPase subunit I  48.38 
 
 		 337 aa  286  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.111269 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2505  magnesium chelatase ATPase subunit I  48.38 
 
 		 337 aa  286  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.57993  normal  0.244137 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1276  Magnesium chelatase  46.91 
 
 		 351 aa  285  2.0000000000000002e-75  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3280  magnesium chelatase ATPase subunit I  47.19 
 
 		 373 aa  285  2.0000000000000002e-75  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1021  Magnesium chelatase  47.09 
 
 		 347 aa  285  2.0000000000000002e-75  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17760  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  47.28 
 
 		 674 aa  284  3.0000000000000004e-75  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.715479 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0970  magnesium chelatase ATPase subunit I  47.5 
 
 		 369 aa  284  4.0000000000000003e-75  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.726798  normal  0.50852 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3123  magnesium chelatase ATPase subunit I  48.45 
 
 		 370 aa  283  6.000000000000001e-75  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2068  magnesium chelatase ATPase subunit I  48.55 
 
 		 341 aa  283  7.000000000000001e-75  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.876863 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4158  magnesium chelatase  49.06 
 
 		 776 aa  282  1e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0127951  normal  0.72272 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3731  magnesium chelatase ATPase subunit I  48.54 
 
 		 368 aa  282  2e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.786606  normal  0.0984598 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1631  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  46.88 
 
 		 386 aa  281  2e-74  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.374894  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1519  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  47.19 
 
 		 374 aa  281  3e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0208517  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0785  magnesium chelatase ATPase subunit I  46.25 
 
 		 384 aa  281  3e-74  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.98065  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0713  magnesium chelatase ATPase subunit I  46.44 
 
 		 362 aa  281  3e-74  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1796  magnesium chelatase ATPase subunit I  45.31 
 
 		 391 aa  281  3e-74  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3622  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  46.25 
 
 		 405 aa  281  3e-74  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.164219 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1544  magnesium chelatase ATPase subunit I  46.69 
 
 		 377 aa  280  7e-74  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000269356 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3856  Magnesium chelatase  45.69 
 
 		 365 aa  280  7e-74  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.257397  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1621  magnesium chelatase ATPase subunit I  45.94 
 
 		 382 aa  279  8e-74  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1952  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  46.44 
 
 		 362 aa  280  8e-74  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0857411  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1433  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  44.79 
 
 		 337 aa  279  1e-73  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0583  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  45.96 
 
 		 364 aa  278  2e-73  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00224642  normal  0.0296662 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3502  magnesium chelatase subunit I  46.08 
 
 		 334 aa  278  3e-73  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.602006  normal  0.630421 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0454  magnesium chelatase ATPase subunit I  45.62 
 
 		 358 aa  278  3e-73  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0467  magnesium chelatase ATPase subunit I  45.62 
 
 		 358 aa  278  3e-73  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.571149  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1250  magnesium chelatase ATPase subunit I  47.45 
 
 		 340 aa  277  5e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00136205 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11601  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  46.44 
 
 		 362 aa  276  6e-73  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11611  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  46.44 
 
 		 362 aa  276  6e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1902  magnesium chelatase ATPase subunit I  46.39 
 
 		 379 aa  275  1.0000000000000001e-72  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0141145 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0648  magnesium chelatase ATPase subunit I  45.62 
 
 		 357 aa  275  3e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15321  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  44.89 
 
 		 362 aa  274  4.0000000000000004e-72  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0698  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  44.89 
 
 		 362 aa  274  4.0000000000000004e-72  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0276  magnesium chelatase, ChlI subunit  33.39 
 
 		 619 aa  274  4.0000000000000004e-72  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0650073  normal  0.0615582 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1066  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  46.13 
 
 		 362 aa  273  5.000000000000001e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5861  Magnesium chelatase  45.4 
 
 		 680 aa  273  5.000000000000001e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1622  magnesium chelatase ATPase subunit I  46.79 
 
 		 341 aa  273  6e-72  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0751  magnesium chelatase subunit D/I family protein  46.71 
 
 		 309 aa  273  8.000000000000001e-72  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.426772  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1693  magnesium chelatase ATPase subunit I  47.45 
 
 		 340 aa  272  1e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.578375  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1493  magnesium chelatase ATPase subunit I  46.56 
 
 		 386 aa  272  1e-71  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11461  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  45.51 
 
 		 362 aa  272  1e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.134782  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1022  magnesium chelatase subunit I  46.93 
 
 		 334 aa  271  2e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0936495  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4017  magnesium chelatase ATPase subunit I  46.82 
 
 		 340 aa  271  2e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0371739  normal  0.311095 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13860  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  48.94 
 
 		 351 aa  271  4e-71  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0485  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  46.96 
 
 		 394 aa  270  4e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0861468  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0750  magnesium chelatase subunit D/I family protein  30.17 
 
 		 643 aa  270  8e-71  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11361  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  44.58 
 
 		 362 aa  269  1e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.810628 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3771  magnesium chelatase ATPase subunit I  46.5 
 
 		 340 aa  269  1e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0136041 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3148  magnesium chelatase, subunit ChII, putative  43.65 
 
 		 342 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.210132  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0273  magnesium chelatase subunit I  46.28 
 
 		 334 aa  268  2.9999999999999995e-70  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.308898  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0375  magnesium chelatase  45.86 
 
 		 637 aa  268  2.9999999999999995e-70  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.165558  normal  0.638672 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0229  magnesium chelatase  45.86 
 
 		 637 aa  268  2.9999999999999995e-70  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4585  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  44.48 
 
 		 335 aa  267  4e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1006  von Willebrand factor type A  44.94 
 
 		 749 aa  267  4e-70  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1916  magnesium chelatase subunit I  46.28 
 
 		 334 aa  267  5e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.808705 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5885  chelatase protein  51.13 
 
 		 713 aa  267  5.999999999999999e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0403011  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3014  magnesium chelatase, ChlI subunit  44.26 
 
 		 344 aa  266  7e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.397275  normal  0.647492 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2772  magnesium chelatase  45.98 
 
 		 333 aa  266  1e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2423  magnesium chelatase  46.78 
 
 		 340 aa  264  3e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.536796  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3097  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  45.89 
 
 		 333 aa  264  3e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>