More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_5209 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_5209  DNA repair protein RecN  100 
 
 		 551 aa  1112    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1303  DNA repair protein RecN  61.68 
 
 		 557 aa  684    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.523963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3012  DNA repair protein  49.36 
 
 		 551 aa  532  1e-150  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.398213 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1139  DNA repair protein RecN  44.26 
 
 		 555 aa  460  9.999999999999999e-129  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6893  DNA repair protein RecN  43.45 
 
 		 549 aa  414  1e-114  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.23585  normal  0.532581 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09463  DNA repair protein RecN  43.12 
 
 		 550 aa  401  9.999999999999999e-111  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.070219  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1849  DNA repair protein RecN  40.3 
 
 		 551 aa  396  1e-109  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3465  DNA repair protein RecN  41.95 
 
 		 550 aa  385  1e-106  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.393637  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1845  Sigma 54 interacting domain protein  39.93 
 
 		 552 aa  368  1e-100  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.34764  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0370  DNA repair protein RecN  35.21 
 
 		 578 aa  320  3e-86  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.431573  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3462  recombination and repair protein  35.12 
 
 		 552 aa  306  5.0000000000000004e-82  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0594  DNA repair protein RecN  35.5 
 
 		 569 aa  306  8.000000000000001e-82  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0859323 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0537  DNA repair protein RecN  36.11 
 
 		 568 aa  300  6e-80  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.674533  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1104  recombination and repair protein  34.65 
 
 		 552 aa  300  6e-80  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.562592 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1104  recombination and repair protein  34.57 
 
 		 552 aa  299  9e-80  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.239344  normal  0.154382 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0701  DNA repair protein RecN  35.35 
 
 		 567 aa  298  2e-79  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1170  recombination and repair protein  34.57 
 
 		 552 aa  298  2e-79  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0260908 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2771  recombination and repair protein  33.87 
 
 		 552 aa  298  2e-79  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.170925  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1043  recombination and repair protein  33.69 
 
 		 552 aa  296  6e-79  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1218  recombination and repair protein  34.4 
 
 		 552 aa  296  7e-79  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.187963  normal  0.0934404 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3153  recombination and repair protein  34.4 
 
 		 552 aa  296  7e-79  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000145597  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3296  recombination and repair protein  34.4 
 
 		 552 aa  296  7e-79  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.182341  decreased coverage  0.000158665 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3151  recombination and repair protein  34.4 
 
 		 552 aa  296  7e-79  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0961248  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0378  recombination and repair protein  33.63 
 
 		 554 aa  293  4e-78  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.116911  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1763  DNA repair protein RecN  32.98 
 
 		 560 aa  291  3e-77  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.137867  normal  0.0495571 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1026  recombination and repair protein  35.61 
 
 		 554 aa  290  4e-77  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01130  recombination and repair protein  34.54 
 
 		 554 aa  290  6e-77  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2735  alkylhydroperoxidase AhpD core  33.39 
 
 		 557 aa  289  1e-76  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0271976  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0576  DNA repair protein RecN  34.31 
 
 		 568 aa  289  1e-76  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3096  DNA repair protein RecN  33.03 
 
 		 557 aa  288  2e-76  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004296  DNA repair protein RecN  34.54 
 
 		 554 aa  288  2e-76  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.782069  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1749  DNA repair protein RecN  34.39 
 
 		 574 aa  287  4e-76  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3359  recombination and repair protein  34.84 
 
 		 553 aa  286  9e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0341558 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1281  recombination and repair protein  33.21 
 
 		 553 aa  286  1.0000000000000001e-75  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000117137 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1904  DNA repair protein RecN  33.39 
 
 		 564 aa  283  5.000000000000001e-75  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3364  DNA repair protein RecN  32.68 
 
 		 559 aa  283  7.000000000000001e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.276138  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5483  DNA repair protein RecN  32.8 
 
 		 558 aa  282  9e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.582199  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1169  recombination and repair protein  34.17 
 
 		 553 aa  282  1e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0728  recombination and repair protein  33.45 
 
 		 553 aa  281  2e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.118324  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63010  DNA repair protein RecN  32.62 
 
 		 558 aa  281  2e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1179  DNA repair and genetic recombination protein  32.97 
 
 		 556 aa  281  2e-74  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2064  DNA repair protein RecN  33.64 
 
 		 558 aa  280  3e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.488529  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0963  recombination and repair protein  33.03 
 
 		 553 aa  281  3e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0199907  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1080  DNA repair protein RecN  33.21 
 
 		 558 aa  279  8e-74  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2889  recombination and repair protein  32.62 
 
 		 553 aa  278  1e-73  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000988342  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0968  DNA repair protein RecN  33.03 
 
 		 567 aa  278  1e-73  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.858596  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2976  recombination and repair protein  33.04 
 
 		 553 aa  278  2e-73  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0819489  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3686  recombination and repair protein  34.04 
 
 		 553 aa  278  2e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00128842  normal  0.127979 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1376  recombination and repair protein  33.04 
 
 		 553 aa  278  2e-73  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000000100313  normal  0.0248594 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0814  DNA repair protein RecN  32.04 
 
 		 570 aa  277  3e-73  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1196  recombination and repair protein  33.03 
 
 		 553 aa  276  6e-73  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1611  DNA repair protein RecN  33.21 
 
 		 559 aa  276  6e-73  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000188364  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1578  DNA repair protein RecN  33.21 
 
 		 559 aa  276  6e-73  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3298  recombination and repair protein  32.07 
 
 		 553 aa  276  1.0000000000000001e-72  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.121559  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3626  DNA repair protein RecN  33.57 
 
 		 558 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3218  recombination and repair protein  31.34 
 
 		 553 aa  274  3e-72  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2475  recombination and repair protein  32.37 
 
 		 565 aa  273  8.000000000000001e-72  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0596  DNA repair protein RecN  31.55 
 
 		 572 aa  270  2.9999999999999997e-71  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0866  DNA repair protein RecN  32.73 
 
 		 555 aa  270  4e-71  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1151  recombination and repair protein  35.41 
 
 		 554 aa  270  4e-71  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.901201  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1335  DNA repair protein RecN  30.91 
 
 		 551 aa  270  7e-71  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3096  DNA repair protein RecN  31.91 
 
 		 574 aa  270  7e-71  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.155422 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42990  DNA repair protein RecN  32.68 
 
 		 557 aa  269  8e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3856  recombination and repair protein  32.04 
 
 		 553 aa  269  8.999999999999999e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00344363  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1059  DNA repair protein RecN  31.74 
 
 		 553 aa  268  1e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0987529  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2774  recombination and repair protein  31.74 
 
 		 553 aa  268  1e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000103072  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2768  recombination and repair protein  31.74 
 
 		 553 aa  268  1e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00054696  normal  0.107417 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1068  recombination and repair protein  31.74 
 
 		 553 aa  268  1e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0569436  normal  0.137036 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2900  recombination and repair protein  31.74 
 
 		 553 aa  269  1e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.004413  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02504  recombination and repair protein  31.74 
 
 		 553 aa  268  2e-70  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0788874  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02468  hypothetical protein  31.74 
 
 		 553 aa  268  2e-70  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.116899  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4595  DNA repair protein RecN  34.45 
 
 		 557 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.202375 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4729  DNA repair protein RecN  34.45 
 
 		 557 aa  266  5.999999999999999e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00366375 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0703  DNA repair protein RecN  33.74 
 
 		 557 aa  266  5.999999999999999e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.926549  hitchhiker  0.000359109 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3005  recombination and repair protein  31.56 
 
 		 553 aa  266  8.999999999999999e-70  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000658292  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3011  recombination and repair protein  32.03 
 
 		 553 aa  265  1e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3966  DNA repair protein RecN  31.4 
 
 		 556 aa  265  1e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.284551 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4197  DNA repair protein RecN  30.63 
 
 		 557 aa  265  2e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.312426  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1612  DNA repair protein RecN  35.94 
 
 		 573 aa  264  2e-69  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.458504 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4507  DNA repair protein RecN  32.03 
 
 		 557 aa  264  3e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2897  recombination and repair protein  31.85 
 
 		 553 aa  264  3e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2899  recombination and repair protein  31.85 
 
 		 553 aa  264  3e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2879  recombination and repair protein  31.85 
 
 		 553 aa  264  3e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.158329 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2829  recombination and repair protein  31.85 
 
 		 553 aa  264  3e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00407233  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0651  DNA repair protein  31.72 
 
 		 559 aa  263  4e-69  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0761  DNA repair protein RecN  31.18 
 
 		 557 aa  263  6e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.345087  normal  0.395212 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1666  DNA repair protein RecN  31.5 
 
 		 577 aa  262  1e-68  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0942  DNA repair protein RecN  30.74 
 
 		 554 aa  261  2e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2680  DNA repair protein RecN  31.34 
 
 		 554 aa  261  3e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1446  DNA repair protein RecN  29.6 
 
 		 556 aa  260  4e-68  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000211173  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4730  DNA repair protein RecN  33.51 
 
 		 557 aa  259  7e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.46357  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1691  DNA repair protein RecN  30.58 
 
 		 557 aa  259  8e-68  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.893605  hitchhiker  0.00244544 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1860  DNA repair protein RecN  33.33 
 
 		 558 aa  259  9e-68  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.457848  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1385  DNA repair protein  29.42 
 
 		 608 aa  258  2e-67  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0276871  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02270  DNA repair ATPase RecN  32.01 
 
 		 561 aa  257  3e-67  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0914  DNA repair protein RecN  32.8 
 
 		 558 aa  256  5e-67  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.473015  normal  0.408005 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3602  DNA repair protein RecN  30.25 
 
 		 557 aa  256  6e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00779581 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3825  DNA repair protein RecN  30.89 
 
 		 561 aa  256  7e-67  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.321139  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0775  DNA repair protein RecN  32.5 
 
 		 552 aa  256  7e-67  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000179189 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0903  DNA repair protein RecN  29.16 
 
 		 554 aa  256  9e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>