More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4501 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_0345  sulfatase  72.23 
 
 
474 aa  719    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00158762  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4501  sulfatase  100 
 
 
481 aa  989    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.930305  normal  0.505642 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3852  sulfatase  54.49 
 
 
468 aa  524  1e-147  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1327  sulfatase  53.24 
 
 
480 aa  500  1e-140  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.499609  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2166  sulfatase  45.82 
 
 
497 aa  411  1e-113  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.696706  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3661  sulfatase  44.69 
 
 
500 aa  393  1e-108  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0317755  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6288  sulfatase  42.15 
 
 
523 aa  389  1e-107  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.44956 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3296  sulfatase  44.52 
 
 
460 aa  385  1e-106  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0308085  hitchhiker  0.000582836 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3373  sulfatase  43.34 
 
 
481 aa  361  2e-98  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2382  sulfatase  41.99 
 
 
488 aa  354  2e-96  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.285521  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1497  sulfatase  39.17 
 
 
536 aa  351  2e-95  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.139846  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0491  sulfatase  41.1 
 
 
500 aa  309  8e-83  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.244971 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1638  sulfatase  40.26 
 
 
457 aa  303  5.000000000000001e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.132093 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4498  sulfatase  36.71 
 
 
462 aa  244  3e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.697848  normal  0.704843 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6289  sulfatase  33.6 
 
 
486 aa  221  1.9999999999999999e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.235101 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6052  sulfatase  33.77 
 
 
453 aa  219  6e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0889  sulfatase  33.04 
 
 
500 aa  219  7e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00184444  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0451  sulfatase  32.17 
 
 
719 aa  215  9.999999999999999e-55  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0740  sulfatase  32.4 
 
 
440 aa  214  1.9999999999999998e-54  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2602  sulfatase  34.23 
 
 
452 aa  213  4.9999999999999996e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.128586 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2941  sulfatase  32.06 
 
 
480 aa  211  2e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.515365 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0895  sulfatase  32.09 
 
 
471 aa  210  5e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.281969  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1520  sulfatase  33.94 
 
 
631 aa  207  4e-52  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0242635  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0785  sulfatase  32.62 
 
 
472 aa  206  1e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.288009  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1881  sulfatase  32.78 
 
 
490 aa  205  2e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0953  sulfatase  31.56 
 
 
1414 aa  204  3e-51  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.462358  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2743  sulfatase  30.12 
 
 
581 aa  204  4e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.866766  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3949  sulfatase  33.12 
 
 
470 aa  203  6e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.184377  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1516  sulfatase  33.13 
 
 
553 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.943825  normal  0.893122 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4652  sulfatase  33.65 
 
 
551 aa  200  5e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4692  sulfatase  33.92 
 
 
491 aa  200  6e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.66699 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0474  sulfatase  34.23 
 
 
491 aa  199  7.999999999999999e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3436  sulfatase  32.05 
 
 
462 aa  199  1.0000000000000001e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0296  sulfatase  33.48 
 
 
442 aa  198  2.0000000000000003e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2379  sulfatase  31.04 
 
 
470 aa  197  3e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0936  sulfatase  31.11 
 
 
479 aa  195  1e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3980  Cerebroside-sulfatase  32.74 
 
 
458 aa  194  3e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.459906 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1213  sulfatase  32.06 
 
 
487 aa  194  3e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.255178  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1449  sulfatase  31.89 
 
 
495 aa  192  1e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.499056  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4996  sulfatase  32.88 
 
 
506 aa  191  2e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.317023 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2657  sulfatase  29.03 
 
 
519 aa  191  2.9999999999999997e-47  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3999  sulfatase  33.4 
 
 
467 aa  191  2.9999999999999997e-47  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2738  sulfatase  31.57 
 
 
466 aa  190  4e-47  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.846304  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8255  sulfatase  31.83 
 
 
482 aa  189  9e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.229678  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1182  sulfatase  31.73 
 
 
465 aa  189  1e-46  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0302  sulfatase  31.98 
 
 
543 aa  189  1e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.139649 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1506  sulfatase  32.18 
 
 
501 aa  189  1e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.265184 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4650  sulfatase  29.52 
 
 
539 aa  188  2e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2052  sulfatase  30.42 
 
 
543 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.430392  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0881  sulfatase  31.4 
 
 
510 aa  184  3e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.789189  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1353  n-acetylgalactosamine-6-sulfate sulfatase  32.98 
 
 
471 aa  184  4.0000000000000006e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0725989  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0360  Steryl-sulfatase  31.78 
 
 
553 aa  184  4.0000000000000006e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4240  twin-arginine translocation pathway signal  32.92 
 
 
457 aa  183  5.0000000000000004e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.615359  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3501  sulfatase  30.41 
 
 
506 aa  183  5.0000000000000004e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.486843  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0038  sulfatase  30.95 
 
 
497 aa  183  6e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0555  sulfatase  33.56 
 
 
486 aa  183  7e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0039  sulfatase  31.81 
 
 
497 aa  183  7e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.225946 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2674  sulfatase  30.77 
 
 
559 aa  183  7e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.687796  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0038  sulfatase  31.81 
 
 
497 aa  183  7e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.292867  hitchhiker  0.00560398 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0040  sulfatase  31.3 
 
 
497 aa  182  8.000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.843312  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0040  sulfatase  31.3 
 
 
497 aa  182  8.000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.872346  normal  0.13967 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5003  sulfatase  31.07 
 
 
533 aa  182  9.000000000000001e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2364  sulfatase family protein  32.09 
 
 
492 aa  182  1e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.027189  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2831  sulfatase  30.13 
 
 
440 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0404074 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1131  sulfatase  29.59 
 
 
551 aa  180  4.999999999999999e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3913  sulfatase  29.32 
 
 
522 aa  180  5.999999999999999e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.656698  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3654  sulfatase  30.35 
 
 
489 aa  179  1e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0466355 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2065  sulfatase  30.52 
 
 
542 aa  179  1e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0577602 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3659  sulfatase  31.05 
 
 
484 aa  177  3e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000330438  normal  0.826759 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0571  sulfatase  28.99 
 
 
517 aa  177  3e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3801  sulfatase  30.6 
 
 
453 aa  177  5e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00499822  normal  0.102523 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2408  sulfatase  30 
 
 
548 aa  175  1.9999999999999998e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.387467  hitchhiker  0.00012242 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2850  sulfatase  29.38 
 
 
563 aa  174  2.9999999999999996e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00796001  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5404  sulfatase  31.45 
 
 
457 aa  174  2.9999999999999996e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.268396  normal  0.742595 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3047  sulfatase  28.73 
 
 
503 aa  173  5e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0209579 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3640  sulfatase  28.24 
 
 
520 aa  173  5.999999999999999e-42  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0015  sulfatase  30.65 
 
 
497 aa  173  5.999999999999999e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.689426  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3375  sulfatase  27.24 
 
 
571 aa  173  5.999999999999999e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.590124 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2680  arylsulfatase  29.64 
 
 
584 aa  172  1e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.246177  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1568  sulfatase  29.51 
 
 
638 aa  171  2e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0365787  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4466  sulfatase  31.05 
 
 
453 aa  171  2e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0640965 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3650  sulfatase  31.22 
 
 
482 aa  172  2e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00127194  decreased coverage  0.00847064 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02310  arylsulfatase  30.13 
 
 
536 aa  169  1e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3662  sulfatase  28.82 
 
 
637 aa  169  1e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.33998  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0263  arylsulfatase  30.13 
 
 
536 aa  169  1e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0208  sulfatase  30.34 
 
 
536 aa  168  2e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2368  putative N-acetylglucosamine-6-sulfatase  29.51 
 
 
537 aa  168  2.9999999999999998e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2053  sulfatase  30.27 
 
 
556 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.627693  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0354  sulfatase  28.07 
 
 
493 aa  165  1.0000000000000001e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3577  sulfatase  30.68 
 
 
438 aa  165  2.0000000000000002e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.176651  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3903  arylsulfatase  30.63 
 
 
563 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.313687  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2294  sulfatase  30.82 
 
 
442 aa  164  4.0000000000000004e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.434198  normal  0.499589 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06847  arylsulfatase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G12940)  27.16 
 
 
616 aa  162  1e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.246594  normal  0.336427 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1776  sulfatase  31.06 
 
 
520 aa  162  1e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.791288 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3115  cerebroside-sulfatase  30.04 
 
 
440 aa  162  1e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.100154  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2434  sulfatase  30.32 
 
 
564 aa  162  2e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4261  sulfatase  29.4 
 
 
506 aa  162  2e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.362858 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1780  sulfatase  30.6 
 
 
481 aa  161  2e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0997  sulfatase  28.19 
 
 
517 aa  160  4e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.224171  normal  0.0910854 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1986  sulfatase  29.22 
 
 
555 aa  160  4e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.737695 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>