60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3861 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_3861  hypothetical protein  100 
 
 		 141 aa  288  2e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000667493  normal  0.500407 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2141  hypothetical protein  64.23 
 
 		 138 aa  160  8.000000000000001e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2117  hypothetical protein  48.2 
 
 		 136 aa  123  8.000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.169759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0876  hypothetical protein  46.76 
 
 		 136 aa  120  7e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3702  hypothetical protein  44.72 
 
 		 134 aa  117  3.9999999999999996e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00000000180279  unclonable  0.0000000000000038565 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0873  hypothetical protein  68.6 
 
 		 86 aa  116  9.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0855  hypothetical protein  52.89 
 
 		 142 aa  115  1.9999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3770  hypothetical protein  38.58 
 
 		 160 aa  110  5e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3683  hypothetical protein  35.9 
 
 		 141 aa  79.7  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0218781  normal  0.0754722 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3819  hypothetical protein  33.98 
 
 		 136 aa  78.6  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0966901  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1540  hypothetical protein  28.65 
 
 		 198 aa  65.9  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.110674  normal  0.265917 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3315  hypothetical protein  27.05 
 
 		 161 aa  62.8  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.300584 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2981  hypothetical protein  34.48 
 
 		 135 aa  62  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.789055  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1342  hypothetical protein  33.04 
 
 		 138 aa  60.5  0.000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0252295  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0545  hypothetical protein  31.9 
 
 		 135 aa  59.3  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.336103  normal  0.0525174 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0917  hypothetical protein  32.26 
 
 		 152 aa  59.3  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0530  hypothetical protein  31.9 
 
 		 135 aa  59.3  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.382149 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2341  hypothetical protein  29.91 
 
 		 146 aa  58.9  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.438637  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3246  hypothetical protein  32.76 
 
 		 132 aa  58.9  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1502  hypothetical protein  26.4 
 
 		 159 aa  57.8  0.00000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.494789 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3735  hypothetical protein  31.78 
 
 		 154 aa  57  0.00000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0568  hypothetical protein  30.36 
 
 		 150 aa  57  0.00000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.119864 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2461  hypothetical protein  28.85 
 
 		 150 aa  56.6  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.958192  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3448  hypothetical protein  28.21 
 
 		 140 aa  55.5  0.0000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000390264  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2977  hypothetical protein  25.89 
 
 		 170 aa  55.1  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.250173  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0885  hypothetical protein  26.67 
 
 		 149 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1038  hypothetical protein  26.67 
 
 		 149 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33580  hypothetical protein  32.97 
 
 		 156 aa  53.9  0.0000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7386  hypothetical protein  32.18 
 
 		 173 aa  52.4  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.280707 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3790  hypothetical protein  32.32 
 
 		 145 aa  50.1  0.000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.22271  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6616  hypothetical protein  31.96 
 
 		 156 aa  50.1  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5009  hypothetical protein  32.32 
 
 		 145 aa  49.3  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3576  hypothetical protein  34.34 
 
 		 143 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2530  hypothetical protein  28.8 
 
 		 148 aa  48.5  0.00003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5746  hypothetical protein  30.93 
 
 		 151 aa  48.1  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.360533  normal  0.553676 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6688  hypothetical protein  30.93 
 
 		 151 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.215425 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5845  hypothetical protein  30.93 
 
 		 151 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6212  hypothetical protein  30.93 
 
 		 151 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00619591 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1901  hypothetical protein  28.8 
 
 		 148 aa  47.8  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.451689  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5990  hypothetical protein  30.93 
 
 		 151 aa  47.8  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.558327  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5332  hypothetical protein  30.93 
 
 		 151 aa  47.8  0.00005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.486943  normal  0.0360239 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1793  hypothetical protein  28.8 
 
 		 148 aa  47.8  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2004  hypothetical protein  26.5 
 
 		 127 aa  47.4  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.888626  normal  0.327416 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0206  hypothetical protein  28.35 
 
 		 158 aa  47  0.00008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0880357  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000265  hypothetical protein  27.45 
 
 		 150 aa  46.6  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3540  hypothetical protein  31.2 
 
 		 146 aa  45.8  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2186  hypothetical protein  28.32 
 
 		 176 aa  46.2  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1639  hypothetical protein  26.67 
 
 		 166 aa  45.4  0.0003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0205  hypothetical protein  24.72 
 
 		 152 aa  45.4  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1140  hypothetical protein  26.09 
 
 		 142 aa  45.1  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.272267  normal  0.0148221 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2092  hypothetical protein  27.43 
 
 		 176 aa  45.1  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05635  hypothetical protein  27.45 
 
 		 150 aa  44.3  0.0005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0459  hypothetical protein  29.41 
 
 		 165 aa  43.5  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.181647  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5272  hypothetical protein  30.19 
 
 		 161 aa  43.5  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.271323  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0495  hypothetical protein  27.5 
 
 		 178 aa  42.4  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.336133 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4772  hypothetical protein  23.93 
 
 		 159 aa  41.6  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.35022 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3436  hypothetical protein  29.07 
 
 		 191 aa  41.2  0.005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.64721  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2931  hypothetical protein  26.09 
 
 		 120 aa  41.2  0.005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.24493 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2341  hypothetical protein  23.42 
 
 		 143 aa  40.8  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.586477  normal  0.693202 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1750  hypothetical protein  26.55 
 
 		 174 aa  40  0.01  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>