More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2627 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_2627  aminotransferase class I and II  100 
 
 		 395 aa  819    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0082  aminotransferase class I and II  40.86 
 
 		 390 aa  305  1.0000000000000001e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6129  aminotransferase class I and II  39.59 
 
 		 390 aa  281  1e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.849535  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3478  aminotransferase class I and II  35.84 
 
 		 379 aa  248  2e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.53524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0217  aminotransferase, class I and II  35.82 
 
 		 367 aa  231  2e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0515  histidinol phosphate aminotransferase  38.07 
 
 		 386 aa  200  3.9999999999999996e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.839874  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0846  histidinol-phosphate aminotransferase  34.56 
 
 		 358 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3005  histidinol-phosphate aminotransferase  35.45 
 
 		 370 aa  196  6e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.13886  normal  0.0347946 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0978  histidinol-phosphate aminotransferase  36.45 
 
 		 370 aa  196  8.000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.811497  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01458  putative aminotransferase  36.86 
 
 		 391 aa  195  1e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01039  histidinol-phosphate aminotransferase  37.03 
 
 		 393 aa  194  2e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.161415  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0742  histidinol-phosphate aminotransferase  35.15 
 
 		 371 aa  192  7e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1155  histidinol-phosphate aminotransferase  35.06 
 
 		 363 aa  192  8e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0824  histidinol-phosphate aminotransferase  37.61 
 
 		 383 aa  189  5.999999999999999e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0205035  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1198  histidinol-phosphate aminotransferase  31.8 
 
 		 370 aa  186  4e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.107306  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1194  histidinol-phosphate aminotransferase  34.67 
 
 		 373 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0775  histidinol-phosphate aminotransferase  35.15 
 
 		 374 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00278497 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0612  histidinol-phosphate aminotransferase  33.23 
 
 		 369 aa  184  2.0000000000000003e-45  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2193  histidinol-phosphate aminotransferase  34.35 
 
 		 392 aa  184  3e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1983  histidinol-phosphate aminotransferase  33.54 
 
 		 362 aa  183  5.0000000000000004e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000438985  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1024  histidinol-phosphate aminotransferase  34.55 
 
 		 374 aa  182  8.000000000000001e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0846  histidinol-phosphate aminotransferase  34.56 
 
 		 374 aa  182  9.000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0562865 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1684  histidinol-phosphate aminotransferase  34.24 
 
 		 369 aa  181  2e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1964  histidinol-phosphate aminotransferase  34.74 
 
 		 369 aa  180  4e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0905  histidinol-phosphate aminotransferase  34.82 
 
 		 374 aa  179  8e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1241  histidinol-phosphate aminotransferase  31.74 
 
 		 370 aa  178  2e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1184  histidinol-phosphate aminotransferase  34.43 
 
 		 362 aa  176  4e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00881865  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1681  histidinol-phosphate aminotransferase  31.93 
 
 		 370 aa  176  8e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2574  histidinol-phosphate aminotransferase  35.15 
 
 		 376 aa  175  9.999999999999999e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.62978  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23290  histidinol-phosphate aminotransferase  33.53 
 
 		 369 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.113747 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1811  histidinol-phosphate aminotransferase  32.74 
 
 		 375 aa  174  1.9999999999999998e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4075  histidinol-phosphate aminotransferase  33.94 
 
 		 370 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000427384  normal  0.244863 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1851  histidinol-phosphate aminotransferase  34.24 
 
 		 369 aa  173  5e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.328665  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1645  histidinol-phosphate aminotransferase  32.53 
 
 		 370 aa  172  7.999999999999999e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3864  aminotransferase  31.72 
 
 		 374 aa  172  7.999999999999999e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.502444  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2405  histidinol-phosphate aminotransferase  32.84 
 
 		 389 aa  172  9e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1400  histidinol-phosphate aminotransferase  31.93 
 
 		 370 aa  172  1e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0230  histidinol-phosphate aminotransferase  31.66 
 
 		 362 aa  172  1e-41  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1233  histidinol-phosphate aminotransferase  35.86 
 
 		 362 aa  172  1e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15840  histidinol-phosphate aminotransferase  34.55 
 
 		 370 aa  172  1e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1428  histidinol-phosphate aminotransferase  31.86 
 
 		 370 aa  171  2e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1539  histidinol-phosphate aminotransferase  31.86 
 
 		 370 aa  171  2e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1594  histidinol-phosphate aminotransferase  34.17 
 
 		 365 aa  171  2e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121928 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2584  putative aminotransferase  33.96 
 
 		 374 aa  171  2e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.975598  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1612  histidinol-phosphate aminotransferase  31.86 
 
 		 370 aa  171  3e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0219277 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1312  histidinol-phosphate aminotransferase  34.23 
 
 		 374 aa  171  3e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000790606 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1400  histidinol-phosphate aminotransferase  31.86 
 
 		 370 aa  170  4e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.563984  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1453  histidinol phosphate aminotransferase  31.04 
 
 		 383 aa  170  4e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0142373  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1417  histidinol-phosphate aminotransferase  32.46 
 
 		 371 aa  169  6e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31820  putative aminotransferase  31.1 
 
 		 374 aa  169  6e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.437419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1520  histidinol-phosphate aminotransferase  31.2 
 
 		 375 aa  169  8e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0496  histidinol-phosphate aminotransferase  34.42 
 
 		 374 aa  169  1e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.128785  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1442  histidinol-phosphate aminotransferase  31.33 
 
 		 370 aa  168  1e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0567  histidinol-phosphate aminotransferase  35.03 
 
 		 381 aa  168  2e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01910  Histidinol-phosphate transaminase  31.8 
 
 		 372 aa  167  2.9999999999999998e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2138  histidinol-phosphate aminotransferase  33.85 
 
 		 363 aa  167  4e-40  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.302169  normal  0.180028 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0717  histidinol-phosphate aminotransferase  34.85 
 
 		 374 aa  167  4e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1249  histidinol-phosphate aminotransferase  31.31 
 
 		 367 aa  166  8e-40  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.109002  normal  0.0431111 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1931  histidinol-phosphate aminotransferase  30.98 
 
 		 367 aa  164  2.0000000000000002e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3457  aminotransferase  31.66 
 
 		 342 aa  164  3e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.750525  normal  0.247357 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0175  histidinol-phosphate aminotransferase  32.31 
 
 		 370 aa  164  3e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.645733  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2137  histidinol-phosphate aminotransferase  33.64 
 
 		 365 aa  163  4.0000000000000004e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1185  histidinol-phosphate aminotransferase  33.23 
 
 		 380 aa  163  5.0000000000000005e-39  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.318294 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1679  histidinol-phosphate aminotransferase  31.1 
 
 		 362 aa  163  5.0000000000000005e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1116  histidinol-phosphate aminotransferase  31.8 
 
 		 370 aa  162  9e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.177687 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3038  histidinol-phosphate aminotransferase  32.56 
 
 		 365 aa  162  1e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.141855  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3654  aminotransferase class I and II  31.72 
 
 		 411 aa  162  1e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1205  histidinol-phosphate aminotransferase  32.64 
 
 		 380 aa  162  1e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.67172  normal  0.780528 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0166  histidinol-phosphate aminotransferase  33.64 
 
 		 352 aa  161  2e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.506851  normal  0.633959 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0926  histidinol-phosphate aminotransferase  30 
 
 		 377 aa  160  4e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0893821 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4642  histidinol-phosphate aminotransferase  31.68 
 
 		 359 aa  159  6e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.937142 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2015  histidinol-phosphate aminotransferase  32.32 
 
 		 373 aa  159  7e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.788991  normal  0.413564 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4751  aminotransferase class I and II  30.82 
 
 		 383 aa  159  7e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000197662  hitchhiker  0.00000444162 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1868  histidinol-phosphate aminotransferase  29.45 
 
 		 386 aa  159  9e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0318031  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0482  histidinol-phosphate aminotransferase  34.36 
 
 		 365 aa  157  2e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0235  histidinol-phosphate transaminase  31.97 
 
 		 365 aa  158  2e-37  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1964  histidinol-phosphate aminotransferase  29.97 
 
 		 373 aa  157  3e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3084  histidinol-phosphate aminotransferase  31.32 
 
 		 366 aa  157  4e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02340  aminotransferase  31.85 
 
 		 370 aa  157  4e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0938  histidinol-phosphate aminotransferase  31.4 
 
 		 370 aa  156  5.0000000000000005e-37  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0507  histidinol-phosphate aminotransferase  29.88 
 
 		 371 aa  155  1e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.485217  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2116  histidinol-phosphate aminotransferase  30.79 
 
 		 388 aa  155  1e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000848316  unclonable  0.00000966557 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4075  histidinol-phosphate aminotransferase  33.74 
 
 		 363 aa  154  2e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2051  aminotransferase class I and II  30.31 
 
 		 394 aa  154  2e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.418792  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2197  histidinol-phosphate aminotransferase  30.56 
 
 		 366 aa  154  2.9999999999999998e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2705  putative aminotransferase  29.57 
 
 		 373 aa  153  5e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.34008  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2310  histidinol-phosphate aminotransferase  31.82 
 
 		 364 aa  153  5.9999999999999996e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.357051 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2352  aminotransferase class I and II  30.31 
 
 		 394 aa  152  8e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.218999  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01830  aminotransferase  31.27 
 
 		 351 aa  152  8.999999999999999e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1335  histidinol-phosphate aminotransferase  33.04 
 
 		 394 aa  150  3e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.687157  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2354  histidinol-phosphate aminotransferase  31.59 
 
 		 371 aa  150  4e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.880639  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0158  putative aminotransferase  33.02 
 
 		 356 aa  150  5e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1574  histidinol-phosphate aminotransferase  31.02 
 
 		 370 aa  150  5e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35930  aminotransferase  32.54 
 
 		 367 aa  149  6e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.669588 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1208  histidinol-phosphate aminotransferase  30.51 
 
 		 385 aa  149  7e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0342464  normal  0.0473532 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25490  aminotransferase  31.13 
 
 		 363 aa  149  7e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0349529  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0381  histidinol-phosphate aminotransferase  30.84 
 
 		 353 aa  149  7e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.359416  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0660  histidinol-phosphate aminotransferase  32.33 
 
 		 370 aa  149  8e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1020  histidinol-phosphate aminotransferase  30.06 
 
 		 365 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.874382  unclonable  0.0000000000413694 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0302  histidinol-phosphate aminotransferase  31.23 
 
 		 355 aa  148  2.0000000000000003e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.162534  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>