More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1873 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_1873  beta-lactamase domain protein  100 
 
 		 244 aa  498  1e-140  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.871278  normal  0.674736 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2569  metallo-beta-lactamase family protein  41.44 
 
 		 228 aa  177  2e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0247403  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2221  Zn-dependent hydrolase  40.91 
 
 		 228 aa  168  6e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.448191  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2298  metallo-beta-lactamase family protein  39.09 
 
 		 228 aa  165  6.9999999999999995e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2266  Zn-dependent hydrolase  40 
 
 		 228 aa  165  6.9999999999999995e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.064814  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2472  metallo-beta-lactamase family protein  39.09 
 
 		 228 aa  165  6.9999999999999995e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.760184  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2493  metallo-beta-lactamase family protein  39.09 
 
 		 228 aa  165  6.9999999999999995e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2902  metallo-beta-lactamase family protein  40.91 
 
 		 228 aa  164  9e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.150382  normal  0.132575 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2428  metallo-beta-lactamase family protein  40.91 
 
 		 228 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2506  metallo-beta-lactamase family protein  41.82 
 
 		 228 aa  162  3e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0156142  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1796  beta-lactamase domain-containing protein  38.01 
 
 		 230 aa  163  3e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1991  beta-lactamase domain-containing protein  39.61 
 
 		 226 aa  161  1e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00243387  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3947  beta-lactamase domain protein  37.61 
 
 		 246 aa  150  2e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.304771  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2167  beta-lactamase domain protein  32.13 
 
 		 245 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0330732  normal  0.0181786 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2218  beta-lactamase domain-containing protein  35.44 
 
 		 217 aa  124  2e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.250629  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2440  hydrolase, putative  35.44 
 
 		 217 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0911202  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2241  hydrolase  34.47 
 
 		 217 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.282445  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2175  metal-dependent hydrolase  34.47 
 
 		 217 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000879537  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2422  putative hydrolase  34.47 
 
 		 217 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2405  hydrolase  34.47 
 
 		 217 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.903974  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2161  metal-dependent hydrolase  33.98 
 
 		 217 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.57885  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2384  beta-lactamase domain protein  32.77 
 
 		 230 aa  112  7.000000000000001e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2372  putative hydrolase  31.55 
 
 		 217 aa  112  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2960  putative hydrolase  32.52 
 
 		 217 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0047526 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2505  putative hydrolase  32.52 
 
 		 217 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.341858  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2396  beta-lactamase domain protein  34.63 
 
 		 228 aa  87.4  2e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3529  beta-lactamase-like  35.58 
 
 		 277 aa  83.6  0.000000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2916  beta-lactamase-like protein  30.81 
 
 		 239 aa  82  0.000000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1101  beta-lactamase domain protein  33.48 
 
 		 232 aa  79  0.00000000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1047  beta-lactamase domain-containing protein  30.8 
 
 		 295 aa  75.5  0.0000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5455  beta-lactamase domain protein  29.22 
 
 		 322 aa  74.7  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.245866  normal  0.258375 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2019  beta-lactamase domain-containing protein  27.08 
 
 		 308 aa  74.7  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.677789  normal  0.140339 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0646  beta-lactamase domain protein  30.57 
 
 		 226 aa  73.9  0.000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0513  beta-lactamase domain-containing protein  29.86 
 
 		 228 aa  74.3  0.000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000000126924  hitchhiker  0.000693595 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5818  beta-lactamase domain protein  32.46 
 
 		 294 aa  73.6  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3562  beta-lactamase domain protein  29.09 
 
 		 228 aa  71.6  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.000949082  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2427  beta-lactamase domain-containing protein  32.21 
 
 		 300 aa  71.6  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.501309  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2879  AMP-dependent synthetase and ligase  26.25 
 
 		 862 aa  71.6  0.00000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2787  beta-lactamase domain-containing protein  30.26 
 
 		 305 aa  71.6  0.00000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2424  beta-lactamase domain protein  31.63 
 
 		 322 aa  70.9  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.238173  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0424  beta-lactamase domain protein  27.27 
 
 		 223 aa  70.5  0.00000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.65466  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0035  beta-lactamase domain protein  29.56 
 
 		 210 aa  70.1  0.00000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3735  beta-lactamase domain protein  26.5 
 
 		 246 aa  69.7  0.00000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.555348  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2127  beta-lactamase domain protein  28.86 
 
 		 213 aa  69.3  0.00000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.0013409  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2163  beta-lactamase domain protein  29.05 
 
 		 312 aa  68.2  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0111163  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2563  beta-lactamase domain protein  31.13 
 
 		 282 aa  67.4  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2001  beta-lactamase domain protein  30.86 
 
 		 306 aa  67  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0769  beta-lactamase domain-containing protein  32.58 
 
 		 273 aa  67.8  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.310253 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1991  beta-lactamase domain protein  27.39 
 
 		 310 aa  67  0.0000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1288  beta-lactamase-like protein  28.7 
 
 		 329 aa  66.6  0.0000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0619  beta-lactamase domain protein  30.05 
 
 		 240 aa  67  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.256454 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2842  Beta-lactamase-like  32.77 
 
 		 311 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.577034 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3996  beta-lactamase domain-containing protein  25.23 
 
 		 296 aa  65.9  0.0000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.590455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5820  beta-lactamase domain-containing protein  31.25 
 
 		 317 aa  65.9  0.0000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0920097 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2040  Zn-dependent hydrolase  25.11 
 
 		 331 aa  65.5  0.0000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5395  beta-lactamase domain protein  31.03 
 
 		 305 aa  65.5  0.0000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6066  beta-lactamase domain protein  26.12 
 
 		 308 aa  65.1  0.0000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3121  metallo-beta-lactamase family protein  31.25 
 
 		 285 aa  65.1  0.0000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2561  beta-lactamase domain protein  28.25 
 
 		 275 aa  65.1  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000265837  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5731  beta-lactamase domain protein  32.95 
 
 		 310 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.194082  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2128  metal-dependent hydrolase  30.36 
 
 		 281 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2292  beta-lactamase domain protein  30.36 
 
 		 321 aa  64.7  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0204091  normal  0.304902 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3110  metallo-beta-lactamase family protein  30.36 
 
 		 285 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2454  Beta-lactamase-like  33.72 
 
 		 319 aa  63.2  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1919  beta-lactamase domain protein  29.41 
 
 		 243 aa  63.2  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000566164  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4636  beta-lactamase domain protein  30.63 
 
 		 299 aa  63.5  0.000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.218254 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3968  beta-lactamase domain-containing protein  26.56 
 
 		 317 aa  62.8  0.000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0386675  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3118  metallo-beta-lactamase family protein  29.6 
 
 		 281 aa  63.2  0.000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2900  metallo-beta-lactamase family protein  29.6 
 
 		 285 aa  62.8  0.000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.248774  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6025  beta-lactamase domain-containing protein  32 
 
 		 310 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.706578  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4154  beta-lactamase domain-containing protein  30.77 
 
 		 299 aa  62.8  0.000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.336345 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6698  beta-lactamase domain protein  31.07 
 
 		 310 aa  62.4  0.000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.386764  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5781  beta-lactamase domain-containing protein  32 
 
 		 310 aa  62.4  0.000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4522  beta-lactamase domain protein  30.77 
 
 		 299 aa  62.4  0.000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.231723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1372  beta-lactamase domain protein  26.44 
 
 		 328 aa  62.4  0.000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.93843  normal  0.529651 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0508  beta-lactamase domain protein  30 
 
 		 295 aa  62.4  0.000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1391  beta-lactamase domain-containing protein  30 
 
 		 244 aa  62  0.000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.354164  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2870  metal-dependent hydrolase  29.91 
 
 		 285 aa  61.6  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.154446  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4731  metallo-beta-lactamase family protein  26.32 
 
 		 240 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3769  Beta-lactamase-like  29.11 
 
 		 326 aa  61.6  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6643  beta-lactamase domain-containing protein  30.51 
 
 		 310 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3882  Zn-dependent hydrolase  27.27 
 
 		 317 aa  60.8  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2354  beta-lactamase domain-containing protein  29.07 
 
 		 306 aa  60.8  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.186414 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0914  beta-lactamase domain protein  27.1 
 
 		 311 aa  60.8  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0640856  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5114  metallo-beta-lactamase family protein  27.35 
 
 		 240 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1642  beta-lactamase domain protein  31.25 
 
 		 302 aa  60.8  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.526333  normal  0.287941 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1829  beta-lactamase domain protein  28.65 
 
 		 311 aa  60.5  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0164526  normal  0.939049 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4874  metallo-beta-lactamase family protein  25.44 
 
 		 240 aa  60.1  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5245  metallo-beta-lactamase family protein  25.44 
 
 		 240 aa  60.1  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3142  metallo-beta-lactamase family protein  29.46 
 
 		 285 aa  60.1  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0970008  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5152  metallo-beta-lactamase family protein  25.78 
 
 		 240 aa  60.5  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.810942  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1661  beta-lactamase domain protein  28.02 
 
 		 241 aa  60.5  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2827  metal-dependent hydrolase  29.02 
 
 		 285 aa  59.7  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0133277  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4206  metallo-beta-lactamase domain-containing protein  26.03 
 
 		 317 aa  58.9  0.00000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3890  zinc metallohydrolase  26.75 
 
 		 317 aa  58.9  0.00000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.489775  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4159  hypothetical protein  26.75 
 
 		 317 aa  58.9  0.00000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3476  beta-lactamase-like  27.73 
 
 		 321 aa  58.9  0.00000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.907089  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5582  beta-lactamase domain protein  27.59 
 
 		 322 aa  58.9  0.00000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2832  beta-lactamase domain-containing protein  27 
 
 		 317 aa  58.9  0.00000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.422682  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0438  hypothetical protein  25 
 
 		 328 aa  58.9  0.00000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000571233  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>