More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0234 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_0234  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 163 aa  335  1.9999999999999998e-91  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.425088  normal  0.397447 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1463  NUDIX hydrolase  48.7 
 
 		 165 aa  155  2e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.116619  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2664  NUDIX hydrolase family protein  45.28 
 
 		 161 aa  146  1.0000000000000001e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.472799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0717  NUDIX hydrolase  37.23 
 
 		 168 aa  89  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1790  NUDIX hydrolase  37.96 
 
 		 168 aa  87.8  5e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000145412  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2057  NUDIX hydrolase  36.3 
 
 		 168 aa  84.7  5e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000169928  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1184  NUDIX hydrolase  33.61 
 
 		 147 aa  78.6  0.00000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000616693  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0490  NUDIX/MutT family protein  35.07 
 
 		 168 aa  73.9  0.000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.0000000000225283  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0096  NUDIX hydrolase  43.62 
 
 		 141 aa  72.8  0.000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0757202  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1648  NUDIX hydrolase  31.5 
 
 		 172 aa  70.9  0.000000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000051086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5820  hypothetical protein  34.23 
 
 		 158 aa  67.8  0.00000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67120  hypothetical protein  37.9 
 
 		 158 aa  67.4  0.00000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3311  NUDIX hydrolase  35.59 
 
 		 147 aa  67  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.585247  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2915  hypothetical protein  36.72 
 
 		 148 aa  66.2  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.13474  normal  0.624718 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0645  NUDIX hydrolase  41.94 
 
 		 153 aa  63.5  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0664584 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3644  mutT/nudix family protein  33.33 
 
 		 147 aa  63.5  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3416  mutT/nudix family protein  32.48 
 
 		 147 aa  63.2  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1584  mutT/nudix family protein  33.93 
 
 		 147 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0325451 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0722  NUDIX hydrolase  34.97 
 
 		 146 aa  62.8  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.421237  normal  0.366527 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2012  NUDIX hydrolase, MutT  35.21 
 
 		 158 aa  62.8  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3685  mutT/nudix family protein  32.48 
 
 		 147 aa  63.2  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.293788  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3636  mutT/nudix family protein  32.48 
 
 		 147 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2554  NUDIX hydrolase  31.47 
 
 		 160 aa  62.4  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3377  MutT/Nudix family protein  32.48 
 
 		 147 aa  62  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3653  mutT/nudix family protein  32.48 
 
 		 147 aa  61.6  0.000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3327  MutT/Nudix family protein  33.04 
 
 		 147 aa  61.2  0.000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3733  mutT/nudix family protein  36.36 
 
 		 147 aa  60.5  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.412613  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0533  MutT/NUDIX family protein  37.14 
 
 		 140 aa  57.8  0.00000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0677  mutT/nudix family protein  36.28 
 
 		 140 aa  57.8  0.00000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000877041 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2457  NUDIX hydrolase  30.17 
 
 		 147 aa  57.4  0.00000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0350138  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0691  mutT/nudix family protein  35.4 
 
 		 140 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0589  mutT/nudix family protein  35.4 
 
 		 140 aa  56.2  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2459  MutT/Nudix family protein  28.95 
 
 		 147 aa  55.8  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000023854  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0533  MutT/NUDIX family protein  35.4 
 
 		 140 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.133702  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0622  mutT/nudix family protein  35.4 
 
 		 140 aa  56.2  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2037  NUDIX hydrolase  36.05 
 
 		 155 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2749  mutT/nudix family protein  29.46 
 
 		 147 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000217381  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0473  protein of unknown function DUF1152  33.82 
 
 		 530 aa  55.5  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2429  MutT/Nudix family protein  28.95 
 
 		 147 aa  55.1  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0417987  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1768  NUDIX hydrolase  32.35 
 
 		 136 aa  55.5  0.0000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4678  mutT/nudix family protein  35.4 
 
 		 140 aa  54.7  0.0000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.1477999999999999e-21 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2498  mutT/nudix family protein  28.57 
 
 		 147 aa  54.3  0.0000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000463679  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0251  mutator mutT protein  39.53 
 
 		 130 aa  54.3  0.0000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2683  mutT/nudix family protein  28.57 
 
 		 147 aa  54.3  0.0000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0227  hypothetical protein  37.93 
 
 		 167 aa  54.3  0.0000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2836  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 158 aa  53.9  0.0000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.927915  normal  0.666703 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2698  mutT/nudix family protein  28.57 
 
 		 147 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000763334 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0659  mutT/nudix family protein  34.51 
 
 		 140 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.73799  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2116  NUDIX hydrolase  32.04 
 
 		 136 aa  53.1  0.000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0783  NUDIX hydrolase  36.67 
 
 		 139 aa  53.1  0.000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0156175  normal  0.134596 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2719  mutT/nudix family protein  28.57 
 
 		 147 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00471958  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0536  NUDIX hydrolase  33.63 
 
 		 140 aa  52.8  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2076  NUDIX hydrolase  33.61 
 
 		 141 aa  52.8  0.000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.963545 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1086  NUDIX hydrolase  31.5 
 
 		 236 aa  52.8  0.000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.702437  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3001  NUDIX hydrolase  41.18 
 
 		 134 aa  52.8  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.759496  normal  0.595772 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2698  A/G-specific adenine glycosylase  45.45 
 
 		 396 aa  52.4  0.000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.265639 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5579  NUDIX hydrolase  39.13 
 
 		 173 aa  52.4  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.542924  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1798  LacI family transcription regulator  49.18 
 
 		 473 aa  52.4  0.000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.651793 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0258  MutT/Nudix family protein  38.57 
 
 		 137 aa  52  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0073  MutT/nudix family protein  37.21 
 
 		 162 aa  52  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0618  NUDIX hydrolase  46.15 
 
 		 166 aa  52  0.000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2831  NUDIX hydrolase  34.12 
 
 		 155 aa  51.6  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00779282  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0317  ADP-ribose pyrophosphatase  34.29 
 
 		 156 aa  51.2  0.000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2406  NUDIX hydrolase  25.38 
 
 		 148 aa  51.2  0.000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3147  NUDIX hydrolase  32.63 
 
 		 144 aa  50.8  0.000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.232456  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4745  mutT/nudix family protein  39.06 
 
 		 144 aa  50.8  0.000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.710264  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2616  NUDIX hydrolase  50.98 
 
 		 146 aa  50.8  0.000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0542  NUDIX hydrolase  38.54 
 
 		 147 aa  50.4  0.000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.184867  normal  0.118986 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0572  NUDIX hydrolase  38.54 
 
 		 147 aa  50.4  0.000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.546019  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0090  NUDIX hydrolase  38.54 
 
 		 147 aa  50.4  0.000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8400  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  37.86 
 
 		 139 aa  50.4  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.24066 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0884  NUDIX hydrolase  34.26 
 
 		 137 aa  50.4  0.00001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3244  NUDIX hydrolase  35.9 
 
 		 158 aa  50.1  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0480  NUDIX hydrolase  35.14 
 
 		 184 aa  50.4  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.227834  hitchhiker  0.00765199 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2460  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 165 aa  50.4  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00334111  normal  0.173261 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0715  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 299 aa  50.1  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3056  mutT/nudix family protein  32.94 
 
 		 157 aa  50.4  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0514  NUDIX hydrolase  28.19 
 
 		 142 aa  50.1  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.000824501  hitchhiker  0.00000161401 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0598  NUDIX hydrolase  28.68 
 
 		 163 aa  49.7  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3170  NUDIX hydrolase  37.04 
 
 		 179 aa  49.3  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0771  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  57.14 
 
 		 134 aa  49.3  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.012976  normal  0.720455 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3512  mutator mutT protein  35.51 
 
 		 149 aa  49.7  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2765  MutT/Nudix family protein  32.94 
 
 		 157 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3048  MutT/Nudix family protein  32.94 
 
 		 155 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2289  NUDIX hydrolase  37 
 
 		 132 aa  50.1  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.648467  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3533  NUDIX family pyrophosphatase  35.51 
 
 		 334 aa  49.3  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1123  NUDIX hydrolase  48.33 
 
 		 140 aa  49.3  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.824308  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0498  putative mutator protein(7,8-dihydro-8- oxoguanine-triphosphatase), MutT  38.54 
 
 		 142 aa  49.7  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.718712 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2429  mutT like protein  32.32 
 
 		 134 aa  49.3  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1377  NUDIX hydrolase  41.43 
 
 		 171 aa  48.9  0.00003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.054711  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3537  mutator mutT protein  35.51 
 
 		 149 aa  48.9  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1183  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 130 aa  48.9  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3733  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  35.71 
 
 		 150 aa  48.9  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0829824  normal  0.0242018 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1760  NUDIX hydrolase  36.96 
 
 		 134 aa  49.3  0.00003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3746  NUDIX hydrolase  32.11 
 
 		 142 aa  48.5  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3245  mutator mutT protein  35.51 
 
 		 149 aa  48.5  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0459  putative mutator mutT protein  35.51 
 
 		 149 aa  48.5  0.00004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3935  NUDIX hydrolase  48.33 
 
 		 180 aa  48.5  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.445815  hitchhiker  0.00928201 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2537  NUDIX family pyrophosphatase  35.51 
 
 		 149 aa  48.5  0.00004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1317  putative mutator mutT protein  35.51 
 
 		 149 aa  48.5  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>