More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_2203 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_2203  ABC transporter related  100 
 
 		 669 aa  1369    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0250  ATPase  64.66 
 
 		 662 aa  865    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2379  ABC transporter related  64.79 
 
 		 660 aa  864    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1761  ABC transporter related  50.15 
 
 		 647 aa  650    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0324  ABC transporter related  65.77 
 
 		 659 aa  873    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.843371  normal  0.526275 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1101  ABC transporter related  48.53 
 
 		 658 aa  589  1e-167  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0871053  normal  0.0818517 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_200  ABC transporter, ATP-binding protein  36 
 
 		 663 aa  373  1e-102  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0130  ABC transporter related  34.77 
 
 		 685 aa  374  1e-102  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.906602  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0224  ABC transporter, ATP-binding protein  35.85 
 
 		 663 aa  371  1e-101  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09590  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  35.59 
 
 		 709 aa  371  1e-101  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000107882  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06770  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain protein  34.32 
 
 		 668 aa  367  1e-100  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.00000102079  normal  0.871828 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1322  ABC transporter related  34.38 
 
 		 690 aa  358  1.9999999999999998e-97  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.225947 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0719  ABC transporter related  33.83 
 
 		 672 aa  355  2e-96  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.76998  hitchhiker  0.00730908 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1265  ABC transporter related  31.87 
 
 		 638 aa  347  4e-94  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.870161 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0222  ABC transporter related  34.07 
 
 		 644 aa  340  5e-92  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6057  ABC transporter related protein  34.25 
 
 		 688 aa  339  9.999999999999999e-92  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0310  ABC transporter related  35.15 
 
 		 649 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0473  ABC transporter related  34.78 
 
 		 648 aa  334  4e-90  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0375  putative ABC transporter ATP-binding protein  34.54 
 
 		 637 aa  333  5e-90  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0167  ABC transporter related protein  36.64 
 
 		 624 aa  333  5e-90  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.692888  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3628  ABC transporter related  34.17 
 
 		 649 aa  333  5e-90  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00303453  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2473  ABC transporter related  35.03 
 
 		 650 aa  333  6e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000325943 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1355  ABC transporter related  34.28 
 
 		 646 aa  333  9e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.195008  normal  0.583297 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0594  ABC transporter related protein  33.48 
 
 		 767 aa  332  2e-89  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1101  ABC transporter related protein  37.38 
 
 		 641 aa  330  6e-89  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4027  putative ABC transporter ATP-binding protein  35.19 
 
 		 635 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.963749  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2424  ABC transporter related  35.44 
 
 		 672 aa  327  5e-88  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0758588 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0299  putative ABC transporter ATP-binding protein  35.5 
 
 		 639 aa  326  1e-87  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3997  ABC transporter related  33.28 
 
 		 641 aa  325  2e-87  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2125  ABC transporter related  33.24 
 
 		 659 aa  325  2e-87  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.457352  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0601  ABC transporter related  32.63 
 
 		 651 aa  324  3e-87  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3847  putative ABC transporter ATP-binding protein  35.21 
 
 		 635 aa  324  4e-87  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3136  ABC transporter related  33.23 
 
 		 644 aa  323  5e-87  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0264  putative ABC transporter ATP-binding protein  34.08 
 
 		 640 aa  323  7e-87  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1626  ABC transporter related  34.35 
 
 		 619 aa  323  7e-87  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3689  putative ABC transporter ATP-binding protein  34.08 
 
 		 640 aa  322  9.999999999999999e-87  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3932  putative ABC transporter ATP-binding protein  34.08 
 
 		 640 aa  322  9.999999999999999e-87  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2216  ABC transporter, ATP-binding protein  29.82 
 
 		 632 aa  322  9.999999999999999e-87  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.812248  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0690  ABC transporter related  34.38 
 
 		 636 aa  322  1.9999999999999998e-86  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1247  ABC transporter related  32.3 
 
 		 645 aa  321  1.9999999999999998e-86  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00124998  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2084  ABC transporter related  32.35 
 
 		 642 aa  321  3e-86  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00913447  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2121  ABC transporter related  32.35 
 
 		 642 aa  321  3e-86  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000290627  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1664  ABC transporter ATP-binding protein  33.53 
 
 		 657 aa  321  3e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0247067 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4285  ABC transporter related protein  31.06 
 
 		 656 aa  321  3e-86  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.833629  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1367  ABC transporter, ATP-binding protein  35.35 
 
 		 634 aa  321  3.9999999999999996e-86  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0061  ABC transporter related  33.78 
 
 		 635 aa  320  5e-86  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.234701 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0402  ABC transporter ATPase  31.63 
 
 		 643 aa  320  5e-86  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.930478  hitchhiker  0.0019806 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3740  ABC transporter related  33.54 
 
 		 667 aa  318  2e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.345281  hitchhiker  0.00604484 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1658  ABC transporter, ATP-binding protein  30.79 
 
 		 644 aa  318  2e-85  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0768628  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3314  ABC transporter related  33.33 
 
 		 667 aa  316  7e-85  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.433886 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4562  putative ABC transporter ATP-binding protein  34.09 
 
 		 637 aa  316  9.999999999999999e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.673665 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0052  ABC transporter  34.33 
 
 		 636 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1539  ABC transporter related  35.85 
 
 		 615 aa  315  1.9999999999999998e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.176229  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0298  ABC transporter ATP-binding protein  33.23 
 
 		 643 aa  315  1.9999999999999998e-84  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1623  hypothetical protein  34.08 
 
 		 636 aa  315  1.9999999999999998e-84  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1126  ABC transporter related  35.29 
 
 		 642 aa  315  1.9999999999999998e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0852453 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0351  ABC transporter related  30.76 
 
 		 645 aa  314  2.9999999999999996e-84  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2895  putative ABC transporter, fused ATPase subunits  35.69 
 
 		 615 aa  314  3.9999999999999997e-84  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1024  hypothetical protein  34.33 
 
 		 535 aa  314  3.9999999999999997e-84  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2545  ABC transporter-related protein  33.58 
 
 		 641 aa  313  4.999999999999999e-84  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00131859  decreased coverage  1.5432e-19 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2157  ABC transporter, duplicated ATPase subunits  35.87 
 
 		 548 aa  313  4.999999999999999e-84  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.428099  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0138  ABC transporter, ATP-binding protein  33.93 
 
 		 651 aa  313  9e-84  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03203  fused predicted transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  33.49 
 
 		 637 aa  312  1e-83  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0823398  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0360  ABC transporter related protein  33.49 
 
 		 637 aa  312  1e-83  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03155  hypothetical protein  33.49 
 
 		 637 aa  312  1e-83  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0843095  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0433  ABC transporter, ATP-binding protein  34.22 
 
 		 641 aa  312  1e-83  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4779  ABC transporter related  29.97 
 
 		 646 aa  312  1e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000154774  hitchhiker  0.00318423 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3549  putative ABC transporter ATP-binding protein  33.44 
 
 		 637 aa  312  1e-83  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.309193  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0241  ABC transporter related  32.25 
 
 		 658 aa  312  1e-83  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.348865  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3822  putative ABC transporter ATP-binding protein  33.49 
 
 		 637 aa  312  1e-83  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000840845  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0360  putative ABC transporter ATP-binding protein  33.49 
 
 		 637 aa  312  1e-83  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3727  putative ABC transporter ATP-binding protein  33.49 
 
 		 637 aa  313  1e-83  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.577827  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3764  putative ABC transporter ATP-binding protein  33.54 
 
 		 635 aa  312  1e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.460675 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4662  putative ABC transporter ATP-binding protein  33.49 
 
 		 637 aa  312  1e-83  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0192611  normal  0.11448 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2727  ABC transporter related  33.59 
 
 		 649 aa  313  1e-83  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.26231  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3827  putative ABC transporter ATP-binding protein  33.54 
 
 		 635 aa  312  1e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1747  ABC transporter related  34.66 
 
 		 615 aa  312  2e-83  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.219257  normal  0.123618 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3655  putative ABC transporter ATP-binding protein  33.33 
 
 		 635 aa  311  2e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4309  ABC transporter ATP-binding protein  34.95 
 
 		 540 aa  311  2e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.167754 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3634  putative ABC transporter ATP-binding protein  33.49 
 
 		 637 aa  311  2e-83  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000338837 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0293  ABC transporter, ATP-binding protein  32.21 
 
 		 659 aa  311  2e-83  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0524615  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0576  ABC transporter related  34.71 
 
 		 540 aa  311  2e-83  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0863  ABC transporter related  33.33 
 
 		 637 aa  311  2.9999999999999997e-83  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3476  ABC transporter related  33.33 
 
 		 637 aa  311  2.9999999999999997e-83  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0224  ABC transporter related  36.46 
 
 		 540 aa  311  2.9999999999999997e-83  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3656  putative ABC transporter ATP-binding protein  33.33 
 
 		 635 aa  311  2.9999999999999997e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5031  ABC transporter, ATP-binding protein  32.25 
 
 		 644 aa  311  2.9999999999999997e-83  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0210373  normal  0.641963 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0899  ABC transporter related  33.33 
 
 		 637 aa  311  2.9999999999999997e-83  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0262  ABC transporter ATP-binding protein  32.4 
 
 		 640 aa  311  2.9999999999999997e-83  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00579905  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0716  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  35.3 
 
 		 541 aa  311  2.9999999999999997e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3729  putative ABC transporter ATP-binding protein  33.39 
 
 		 635 aa  311  2.9999999999999997e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.83809  normal  0.145902 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0248  ABC transporter ATP-binding protein  32.4 
 
 		 658 aa  310  4e-83  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1792  ABC transporter related  35.61 
 
 		 548 aa  310  4e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1241  ABC transporter related  34.07 
 
 		 643 aa  310  4e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0288  ABC transporter, ATP-binding protein  32.4 
 
 		 658 aa  310  5e-83  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0741  ABC transporter related  33.28 
 
 		 637 aa  310  5e-83  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3281  ABC transporter related  33.28 
 
 		 637 aa  310  5e-83  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2199  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  36.17 
 
 		 645 aa  310  6.999999999999999e-83  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1237  ABC transporter ATPase  31.54 
 
 		 639 aa  310  8e-83  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0857839  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0192  ABC transporter related  35.92 
 
 		 540 aa  309  9e-83  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.566668 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>