173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0382 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_0842  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  55.14 
 
 		 629 aa  689    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.183197  normal  0.106762 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3525  carbon monoxide dehydrogenase  55.34 
 
 		 624 aa  702    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3028  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  71.86 
 
 		 625 aa  938    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1272  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  51.47 
 
 		 628 aa  660    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.142133  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1234  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  64.71 
 
 		 629 aa  870    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0405701  normal  0.377093 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2327  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  54.74 
 
 		 621 aa  702    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00453727  normal  0.0261188 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1341  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  55.34 
 
 		 623 aa  654    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2875  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  58.29 
 
 		 626 aa  726    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.843098  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1133  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  70.51 
 
 		 629 aa  887    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.394682  normal  0.139391 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2233  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  71.98 
 
 		 629 aa  919    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0382  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  100 
 
 		 631 aa  1284    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.72739  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0884  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  52.91 
 
 		 653 aa  672    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.17634  normal  0.977834 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0934  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  62.58 
 
 		 627 aa  830    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.502316  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0057  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  48.91 
 
 		 645 aa  584  1.0000000000000001e-165  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.612526  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0618  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  47.8 
 
 		 641 aa  575  1.0000000000000001e-162  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2098  carbon monoxide dehydrogenase subunit  46.35 
 
 		 640 aa  566  1e-160  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0335  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  48.63 
 
 		 642 aa  557  1e-157  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0882  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  48.29 
 
 		 635 aa  551  1e-155  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3185  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  44.67 
 
 		 679 aa  538  1e-151  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.579976  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2566  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  44.14 
 
 		 663 aa  518  1.0000000000000001e-145  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1461  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  43.29 
 
 		 656 aa  512  1e-144  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000668721  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3792  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  43.53 
 
 		 635 aa  501  1e-140  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.117932  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4498  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  43.93 
 
 		 663 aa  498  1e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.325797 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0072  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  44.2 
 
 		 635 aa  490  1e-137  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1427  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  43.74 
 
 		 639 aa  487  1e-136  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0870  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  45.37 
 
 		 628 aa  484  1e-135  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.404437  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2798  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  41.21 
 
 		 672 aa  465  1e-129  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1203  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  42.49 
 
 		 674 aa  460  9.999999999999999e-129  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1270  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  39.8 
 
 		 673 aa  441  9.999999999999999e-123  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00748773  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3780  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  40.26 
 
 		 674 aa  423  1e-117  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.288316  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04490  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  40.42 
 
 		 632 aa  423  1e-117  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1972  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  38.31 
 
 		 655 aa  405  1e-111  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000154748  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1736  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  37.54 
 
 		 666 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.306274  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1902  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  38.34 
 
 		 669 aa  382  1e-104  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000268472  hitchhiker  0.000000000000110792 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0860  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  34.55 
 
 		 695 aa  366  1e-100  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.199727  normal  0.922779 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1216  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  34.73 
 
 		 648 aa  361  2e-98  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.655192  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2801  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  35.69 
 
 		 670 aa  357  3.9999999999999996e-97  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000137875  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2918  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  33.92 
 
 		 710 aa  352  8.999999999999999e-96  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0596914  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0652  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  33.23 
 
 		 707 aa  352  1e-95  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00052858  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1131  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  33.76 
 
 		 676 aa  347  4e-94  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000338326  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0236  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  34.98 
 
 		 679 aa  345  2e-93  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1166  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  34.8 
 
 		 637 aa  344  4e-93  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0438  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  34.03 
 
 		 663 aa  340  5.9999999999999996e-92  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000530778  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3717  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  34.06 
 
 		 634 aa  335  1e-90  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2933  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  32.58 
 
 		 623 aa  320  3.9999999999999996e-86  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000257353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0888  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  32.74 
 
 		 629 aa  309  8e-83  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.186953  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0149  carbon-monoxide dehydrogenase (acceptor)  31.58 
 
 		 680 aa  291  3e-77  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2587  hydroxylamine reductase  25.71 
 
 		 547 aa  68.9  0.0000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000431874  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2909  hydroxylamine reductase  25.71 
 
 		 547 aa  68.9  0.0000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3188  hydroxylamine reductase  27 
 
 		 544 aa  65.9  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0212462 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1053  hydroxylamine reductase  24.26 
 
 		 539 aa  66.2  0.000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0845  hydroxylamine reductase  22.1 
 
 		 545 aa  65.1  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.633582  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3228  hydroxylamine reductase  24.35 
 
 		 568 aa  63.9  0.000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.892851 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1120  hydroxylamine reductase  26.52 
 
 		 568 aa  62.4  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.170872  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0036  hydroxylamine reductase  25.36 
 
 		 542 aa  61.6  0.00000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0981  hydroxylamine reductase  24.06 
 
 		 557 aa  60.8  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00091795 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0816  hydroxylamine reductase  22.92 
 
 		 545 aa  60.1  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1905  hydroxylamine reductase  25.14 
 
 		 427 aa  58.9  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00412747  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0596  hydroxylamine reductase  28.57 
 
 		 535 aa  59.3  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0468  hybrid cluster protein  23.28 
 
 		 444 aa  59.7  0.0000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000131773  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1201  hydroxylamine reductase  25.34 
 
 		 531 aa  58.9  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3576  hydroxylamine reductase  24.64 
 
 		 531 aa  58.9  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1168  hydroxylamine reductase  21.92 
 
 		 552 aa  58.9  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1239  hydroxylamine reductase  25.21 
 
 		 549 aa  58.9  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000262121  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1669  hydroxylamine reductase  23.75 
 
 		 540 aa  58.2  0.0000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.100106  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0749  hydroxylamine reductase  24.23 
 
 		 543 aa  57.8  0.0000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000113817  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0219  hydroxylamine reductase  22.07 
 
 		 538 aa  57.8  0.0000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2940  hydroxylamine reductase  23.59 
 
 		 447 aa  57.8  0.0000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00378374  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3038  hydroxylamine reductase  25.21 
 
 		 549 aa  57.8  0.0000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1173  hydroxylamine reductase  23.46 
 
 		 549 aa  57.8  0.0000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000032867  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1798  hydroxylamine reductase  24.8 
 
 		 557 aa  57.4  0.0000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1634  hydroxylamine reductase  23.84 
 
 		 538 aa  57.8  0.0000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.228305  normal  0.622946 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2941  hydroxylamine reductase  27.8 
 
 		 565 aa  57.4  0.0000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1424  hydroxylamine reductase  25.1 
 
 		 522 aa  57.4  0.0000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.013462  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2647  hydroxylamine reductase  24.5 
 
 		 533 aa  57.4  0.0000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.654819  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0585  hydroxylamine reductase  24.5 
 
 		 533 aa  57.4  0.0000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000760383  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0105  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit alpha  22.96 
 
 		 766 aa  57.4  0.0000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2641  hydroxylamine reductase  27.04 
 
 		 537 aa  56.6  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.897837  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3702  hydroxylamine reductase  26.26 
 
 		 533 aa  56.6  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.456407  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1919  hydroxylamine reductase  25.67 
 
 		 553 aa  57  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.877615  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2875  hydroxylamine reductase  24.31 
 
 		 548 aa  56.6  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0115588  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1364  hydroxylamine reductase  25.14 
 
 		 549 aa  55.8  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.453221  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1829  hydroxylamine reductase  25.07 
 
 		 545 aa  55.5  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3125  hydroxylamine reductase  26.04 
 
 		 551 aa  55.1  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0893  hydroxylamine reductase  23.68 
 
 		 546 aa  55.1  0.000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2938  hydroxylamine reductase  28.57 
 
 		 461 aa  55.1  0.000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000065218  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0213  hydroxylamine reductase  25.22 
 
 		 533 aa  55.1  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.8548  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0663  hydroxylamine reductase  28 
 
 		 541 aa  54.7  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.430546  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0674  hydroxylamine reductase  24.01 
 
 		 548 aa  54.3  0.000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.09718  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0988  hydroxylamine reductase  26.18 
 
 		 539 aa  54.3  0.000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.160693 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2872  hydroxylamine reductase  25 
 
 		 553 aa  54.3  0.000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000295577  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0423  hydroxylamine reductase  23.53 
 
 		 435 aa  53.9  0.000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000304226  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3948  hybrid cluster protein  23.53 
 
 		 551 aa  53.9  0.000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0137  hydroxylamine reductase  28.75 
 
 		 427 aa  53.5  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000271526  normal  0.86078 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2189  hydroxylamine reductase  24.92 
 
 		 538 aa  53.5  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00125687  normal  0.781035 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1978  hydroxylamine reductase  24.79 
 
 		 542 aa  53.1  0.00001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.881596  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0406  hybrid cluster protein  26.51 
 
 		 554 aa  53.1  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2759  hydroxylamine reductase  27.22 
 
 		 549 aa  52.4  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1660  hydroxylamine reductase  26.7 
 
 		 562 aa  52.8  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0977  hydroxylamine reductase  23.01 
 
 		 555 aa  53.1  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.349617 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>