176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2938 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_0423  hydroxylamine reductase  74.71 
 
 
435 aa  674    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000304226  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2938  hydroxylamine reductase  100 
 
 
461 aa  955    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000065218  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2940  hydroxylamine reductase  74.05 
 
 
447 aa  677    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00378374  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3216  hydroxylamine reductase  65.27 
 
 
428 aa  609  1e-173  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3446  hydroxylamine reductase  65.2 
 
 
436 aa  610  1e-173  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3153  hydroxylamine reductase  64.57 
 
 
428 aa  604  9.999999999999999e-173  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1803  hydroxylamine reductase  64.73 
 
 
436 aa  607  9.999999999999999e-173  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3471  hydroxylamine reductase  64.5 
 
 
436 aa  605  9.999999999999999e-173  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00683577  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3151  hydroxylamine reductase  65.27 
 
 
428 aa  607  9.999999999999999e-173  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000614247  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3243  hydroxylamine reductase  64.57 
 
 
428 aa  602  1.0000000000000001e-171  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.19186  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3497  hydroxylamine reductase  64.57 
 
 
428 aa  602  1.0000000000000001e-171  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3458  hydroxylamine reductase  64.27 
 
 
436 aa  604  1.0000000000000001e-171  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1676  hydroxylamine reductase  64.69 
 
 
428 aa  600  1e-170  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.150263  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2542  hydroxylamine reductase  61.52 
 
 
435 aa  567  1e-160  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0330494  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1377  hydroxylamine reductase  58.26 
 
 
441 aa  548  1e-154  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0447  hydroxylamine reductase  57.14 
 
 
454 aa  544  1e-153  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1540  hydroxylamine reductase  57.53 
 
 
442 aa  531  1e-149  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0468  hybrid cluster protein  55.25 
 
 
444 aa  516  1.0000000000000001e-145  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000131773  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0137  hydroxylamine reductase  58.7 
 
 
427 aa  512  1e-144  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000271526  normal  0.86078 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1816  hydroxylamine reductase  54.05 
 
 
453 aa  508  1e-143  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0688399  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0918  hydroxylamine reductase  57.76 
 
 
444 aa  511  1e-143  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0273412  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1905  hydroxylamine reductase  54.06 
 
 
427 aa  465  9.999999999999999e-131  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00412747  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1302  hydroxylamine reductase  51.19 
 
 
433 aa  428  1e-119  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1577  hydroxylamine reductase  48.85 
 
 
431 aa  427  1e-118  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1643  hydroxylamine reductase  48.39 
 
 
431 aa  422  1e-117  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3228  hydroxylamine reductase  49.75 
 
 
568 aa  403  1e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.892851 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1033  hydroxylamine reductase  49.75 
 
 
568 aa  402  1e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1173  hydroxylamine reductase  47.61 
 
 
549 aa  396  1e-109  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000032867  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1609  hydroxylamine reductase  49.51 
 
 
542 aa  396  1e-109  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.726092  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1750  hybrid cluster protein  48.65 
 
 
532 aa  392  1e-108  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.531638  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0663  hydroxylamine reductase  48.04 
 
 
541 aa  394  1e-108  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.430546  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1600  hydroxylamine reductase  49.02 
 
 
542 aa  389  1e-107  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28240  hydroxylamine reductase  48.8 
 
 
525 aa  386  1e-106  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.230727 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0213  hydroxylamine reductase  49.63 
 
 
533 aa  387  1e-106  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.8548  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3188  hydroxylamine reductase  50.48 
 
 
544 aa  387  1e-106  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0212462 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2872  hydroxylamine reductase  48.28 
 
 
553 aa  387  1e-106  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000295577  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2647  hydroxylamine reductase  49.38 
 
 
533 aa  387  1e-106  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.654819  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3038  hydroxylamine reductase  48.17 
 
 
549 aa  385  1e-106  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3702  hydroxylamine reductase  49.88 
 
 
533 aa  386  1e-106  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.456407  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0585  hydroxylamine reductase  49.38 
 
 
533 aa  387  1e-106  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000760383  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1364  hydroxylamine reductase  48.77 
 
 
549 aa  385  1e-106  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.453221  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0674  hydroxylamine reductase  48.05 
 
 
548 aa  382  1e-105  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.09718  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1239  hydroxylamine reductase  47.92 
 
 
549 aa  384  1e-105  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000262121  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2834  hydroxylamine reductase  47.68 
 
 
547 aa  382  1e-105  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000787255  hitchhiker  0.00000000000275149 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2222  hydroxylamine reductase  47.87 
 
 
430 aa  384  1e-105  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.040247  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0837  hydroxylamine reductase  47.55 
 
 
550 aa  379  1e-104  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00540032  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0988  hydroxylamine reductase  47.32 
 
 
539 aa  378  1e-103  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.160693 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2641  hydroxylamine reductase  48.41 
 
 
537 aa  377  1e-103  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.897837  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2190  hydroxylamine reductase  46 
 
 
526 aa  378  1e-103  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.317395  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3576  hydroxylamine reductase  48.15 
 
 
531 aa  376  1e-103  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0704  hydroxylamine reductase  47.8 
 
 
537 aa  375  1e-103  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.308475 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1657  hydroxylamine reductase  48.62 
 
 
556 aa  375  1e-102  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.922648  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1355  hydroxylamine reductase  48.62 
 
 
557 aa  375  1e-102  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2941  hydroxylamine reductase  49.14 
 
 
565 aa  372  1e-102  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3446  hydroxylamine reductase  47.55 
 
 
542 aa  375  1e-102  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  unclonable  0.0000118604 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1201  hydroxylamine reductase  47.9 
 
 
531 aa  373  1e-102  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1168  hydroxylamine reductase  45.72 
 
 
552 aa  369  1e-101  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0742  hydroxylamine reductase  47.64 
 
 
531 aa  371  1e-101  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.483638  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3125  hydroxylamine reductase  45.72 
 
 
551 aa  370  1e-101  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2759  hydroxylamine reductase  49.75 
 
 
549 aa  366  1e-100  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0596  hydroxylamine reductase  47.67 
 
 
535 aa  366  1e-100  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2386  hydroxylamine reductase  48.65 
 
 
566 aa  363  3e-99  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00790044  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1165  hydroxylamine reductase  46.15 
 
 
552 aa  360  2e-98  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_12416  predicted protein  46.06 
 
 
551 aa  360  2e-98  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0981  hydroxylamine reductase  45.98 
 
 
557 aa  359  5e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00091795 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1120  hydroxylamine reductase  47.91 
 
 
568 aa  358  9e-98  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.170872  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0816  hydroxylamine reductase  44.66 
 
 
545 aa  357  1.9999999999999998e-97  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0974  hydroxylamine reductase  48.76 
 
 
546 aa  356  5e-97  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00100558  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1424  hydroxylamine reductase  46 
 
 
522 aa  356  5e-97  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.013462  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0845  hydroxylamine reductase  44.66 
 
 
545 aa  356  5.999999999999999e-97  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.633582  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003799  hydroxylamine reductase  43.96 
 
 
553 aa  353  2e-96  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4165  hydroxylamine reductase  43.29 
 
 
549 aa  353  4e-96  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1069  hydroxylamine reductase  45.38 
 
 
554 aa  352  5.9999999999999994e-96  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1260  hydroxylamine reductase  45.13 
 
 
552 aa  352  1e-95  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.181543  hitchhiker  0.000316349 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2371  hydroxylamine reductase  46.11 
 
 
550 aa  350  3e-95  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0406  hybrid cluster protein  45.32 
 
 
554 aa  350  5e-95  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1055  hydroxylamine reductase  43.83 
 
 
554 aa  349  8e-95  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0895  hydroxylamine reductase  44.06 
 
 
554 aa  348  1e-94  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.62617 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2701  hydroxylamine reductase  43.84 
 
 
550 aa  348  1e-94  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1174  hydroxylamine reductase  44.2 
 
 
554 aa  347  2e-94  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0529148  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2617  hydroxylamine reductase  43.84 
 
 
550 aa  347  2e-94  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1591  hydroxylamine reductase  43.84 
 
 
550 aa  347  2e-94  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01080  hydroxylamine reductase  46.25 
 
 
520 aa  346  4e-94  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.626709  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1798  hydroxylamine reductase  44.64 
 
 
557 aa  346  5e-94  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1293  hydroxylamine reductase  43.46 
 
 
554 aa  345  8e-94  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.86267  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3097  hydroxylamine reductase  43.46 
 
 
554 aa  345  1e-93  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0213297  normal  0.133055 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1260  hydroxylamine reductase  43.46 
 
 
554 aa  344  2e-93  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4539  hydroxylamine reductase  43.83 
 
 
549 aa  344  2e-93  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1054  hydroxylamine reductase  43.21 
 
 
550 aa  343  2.9999999999999997e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1004  hydroxylamine reductase  43.21 
 
 
550 aa  343  4e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.97662  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0937  hydroxylamine reductase  43.21 
 
 
550 aa  343  4e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.697919  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1035  hydroxylamine reductase  43.21 
 
 
550 aa  343  4e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0972  hydroxylamine reductase  43.21 
 
 
550 aa  343  4e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1216  hydroxylamine reductase  43.21 
 
 
554 aa  343  5e-93  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.453579  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6194  hydroxylamine reductase  46.8 
 
 
553 aa  343  5e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.994183  normal  0.0395415 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2909  hydroxylamine reductase  44.81 
 
 
547 aa  342  5.999999999999999e-93  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2587  hydroxylamine reductase  44.81 
 
 
547 aa  342  5.999999999999999e-93  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000431874  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1707  hydroxylamine reductase  44.3 
 
 
550 aa  342  1e-92  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1053  hydroxylamine reductase  44.74 
 
 
539 aa  342  1e-92  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0036  hydroxylamine reductase  44.97 
 
 
542 aa  341  1e-92  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>