More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0151 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_0151  dihydrolipoamide dehydrogenase  100 
 
 
467 aa  935    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2347  dihydrolipoamide dehydrogenase  57.45 
 
 
475 aa  453  1.0000000000000001e-126  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2832  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.4 
 
 
463 aa  310  2.9999999999999997e-83  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0846  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.13 
 
 
465 aa  309  8e-83  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0515  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.93 
 
 
463 aa  306  7e-82  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.023508  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4513  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.79 
 
 
465 aa  305  1.0000000000000001e-81  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0173943  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0365  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.77 
 
 
458 aa  297  3e-79  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3520  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.86 
 
 
602 aa  296  6e-79  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.501053  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0955  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.39 
 
 
470 aa  293  3e-78  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.205743  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0454  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.42 
 
 
470 aa  292  1e-77  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2397  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.13 
 
 
468 aa  291  1e-77  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00706968 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1805  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.37 
 
 
616 aa  291  2e-77  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1763  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.05 
 
 
459 aa  291  2e-77  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.733287  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3705  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.77 
 
 
468 aa  291  2e-77  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.215491 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1128  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.69 
 
 
470 aa  289  6e-77  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.025111 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03103  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.64 
 
 
607 aa  289  6e-77  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2011  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.7 
 
 
478 aa  289  8e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.156976  normal  0.369181 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3594  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.58 
 
 
492 aa  288  1e-76  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0264  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.58 
 
 
473 aa  287  2e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1835  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.39 
 
 
470 aa  288  2e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1156  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.61 
 
 
480 aa  286  4e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.354559  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2133  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.47 
 
 
467 aa  286  5.999999999999999e-76  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.191316  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1665  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.82 
 
 
491 aa  284  2.0000000000000002e-75  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.771016  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2201  2-oxoglutarate dehydrogenase, E3 component, lipoamide dehydrogenase  35.12 
 
 
478 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00788973  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1084  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.56 
 
 
473 aa  284  2.0000000000000002e-75  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.737232  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3309  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.47 
 
 
462 aa  283  3.0000000000000004e-75  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.900179  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0608  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.23 
 
 
458 aa  280  3e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1926  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.74 
 
 
476 aa  279  7e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1945  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.52 
 
 
459 aa  279  7e-74  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.341599  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1774  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.53 
 
 
476 aa  279  8e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1752  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.53 
 
 
476 aa  279  8e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4269  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.96 
 
 
462 aa  279  9e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.170998  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2352  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.93 
 
 
467 aa  278  1e-73  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.357235  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1719  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.53 
 
 
476 aa  279  1e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1392  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.31 
 
 
476 aa  279  1e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6035  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.77 
 
 
466 aa  278  2e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2306  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.53 
 
 
473 aa  278  2e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2554  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.32 
 
 
476 aa  278  2e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.40022  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0550  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.83 
 
 
467 aa  278  2e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00865571  normal  0.262982 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1978  hypothetical protein  37.18 
 
 
462 aa  277  2e-73  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21030  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.68 
 
 
562 aa  277  3e-73  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000667155  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1830  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.88 
 
 
466 aa  276  5e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.803775  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1050  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.32 
 
 
476 aa  276  7e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.164535  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1002  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.32 
 
 
476 aa  276  7e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.219613  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0164  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.32 
 
 
476 aa  276  7e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1432  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.88 
 
 
476 aa  276  7e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.21637  normal  0.141964 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1496  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.32 
 
 
476 aa  276  7e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1911  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.8 
 
 
603 aa  275  1.0000000000000001e-72  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00687521  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2542  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.34 
 
 
474 aa  275  1.0000000000000001e-72  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.167426  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1642  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.68 
 
 
476 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.370947  normal  0.099089 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1156  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.36 
 
 
468 aa  275  1.0000000000000001e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00928669  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1178  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.36 
 
 
468 aa  275  1.0000000000000001e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000305556  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1745  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.67 
 
 
476 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00176702 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3234  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.58 
 
 
475 aa  274  2.0000000000000002e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.056831  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1532  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.39 
 
 
460 aa  274  2.0000000000000002e-72  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.631051 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2502  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.71 
 
 
459 aa  274  3e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4651  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.11 
 
 
476 aa  273  3e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.183592  normal  0.254899 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0398  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.93 
 
 
467 aa  273  5.000000000000001e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.175439 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1981  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.7 
 
 
603 aa  273  6e-72  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.01171  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1486  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.88 
 
 
476 aa  273  7e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.975022  hitchhiker  0.00623097 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3984  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.96 
 
 
470 aa  272  9e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3880  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.96 
 
 
470 aa  272  9e-72  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4181  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.96 
 
 
470 aa  272  9e-72  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.321449  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1451  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.51 
 
 
466 aa  271  1e-71  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0347  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.91 
 
 
470 aa  271  1e-71  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3712  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.73 
 
 
470 aa  271  2e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7193  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.16 
 
 
619 aa  271  2e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3710  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.09 
 
 
467 aa  271  2e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0274  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.96 
 
 
467 aa  271  2e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.499041  normal  0.530597 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1168  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.73 
 
 
470 aa  271  2e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1030  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.46 
 
 
476 aa  271  2e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.784148  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4072  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.73 
 
 
470 aa  271  2e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1510  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.46 
 
 
476 aa  271  2e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.647996  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0683  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.14 
 
 
468 aa  270  2.9999999999999997e-71  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2671  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.16 
 
 
470 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000595879  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1648  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.8 
 
 
467 aa  270  4e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4018  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.73 
 
 
470 aa  270  4e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.761112  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4088  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.73 
 
 
470 aa  270  4e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000285775  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3728  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.73 
 
 
470 aa  270  4e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2965  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.51 
 
 
680 aa  270  4e-71  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.155449  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1271  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.96 
 
 
478 aa  270  5e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.547338 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0425  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.09 
 
 
467 aa  270  5e-71  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2810  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.18 
 
 
476 aa  270  5e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0361111  normal  0.13581 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1621  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.17 
 
 
463 aa  270  5e-71  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.785994  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1797  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.34 
 
 
474 aa  270  5e-71  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1930  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.8 
 
 
467 aa  269  5.9999999999999995e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6299  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.42 
 
 
625 aa  270  5.9999999999999995e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0179219 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3609  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.57 
 
 
469 aa  269  7e-71  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.40318  normal  0.0347499 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0353  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.87 
 
 
468 aa  269  7e-71  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.22335 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43970  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.19 
 
 
478 aa  269  7e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0508378  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3687  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.19 
 
 
478 aa  269  7e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.338346  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1132  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.34 
 
 
464 aa  269  8e-71  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.487543 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06220  Dihydrolipoyl dehydrogenase  33.91 
 
 
468 aa  268  1e-70  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1524  lipoamide dehydrogenase  37.69 
 
 
474 aa  268  1e-70  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2179  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.78 
 
 
468 aa  268  1e-70  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29750  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.33 
 
 
477 aa  268  1e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.913625  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3758  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.55 
 
 
478 aa  268  1e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1667  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.12 
 
 
478 aa  267  2e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.164593  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1616  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.33 
 
 
478 aa  268  2e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.3772  normal  0.120385 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2936  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.58 
 
 
468 aa  268  2e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>