36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_3710 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_3710  acidic cytochrome c3  100 
 
 		 128 aa  266  5e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2715  acidic cytochrome c3  65.96 
 
 		 126 aa  124  4.0000000000000003e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.605139 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2554  acidic cytochrome c3  53.51 
 
 		 154 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0567  cytochrome c class III  43.09 
 
 		 129 aa  110  5e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1027  cytochrome c class III  43.55 
 
 		 126 aa  103  1e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0462  cytochrome c class III  38.54 
 
 		 135 aa  56.2  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000017841  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3170  cytochrome c, class III  31.94 
 
 		 160 aa  55.1  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000276293  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2250  cytochrome c class III  34.83 
 
 		 538 aa  50.8  0.000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000197158  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0760  cytochrome c, class III  34.51 
 
 		 581 aa  49.7  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.085128  normal  0.192242 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2598  cytochrome c class III  35.48 
 
 		 556 aa  48.1  0.00004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1706  hypothetical protein  29.8 
 
 		 176 aa  47.4  0.00006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0507896  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4047  cytochrome c, class III  27.4 
 
 		 149 aa  45.8  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000000990135  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2405  cytochrome c, class III  36 
 
 		 545 aa  44.7  0.0004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0444659 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3652  hypothetical protein  34.88 
 
 		 176 aa  44.7  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00511438  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3843  hypothetical protein  28.81 
 
 		 90 aa  44.3  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000284189  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3754  cytochrome c3, putative  30.7 
 
 		 134 aa  44.7  0.0005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1024  cytochrome c3  43.48 
 
 		 92 aa  44.3  0.0006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0305  cytochrome c class III  30.77 
 
 		 225 aa  44.3  0.0006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.936992  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2831  hypothetical protein  26.26 
 
 		 184 aa  43.9  0.0008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000373636  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4134  cytochrome c3  43.48 
 
 		 94 aa  43.5  0.0009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0580  cytochrome c family protein  30.26 
 
 		 252 aa  43.5  0.0009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4043  cytochrome c3  43.48 
 
 		 94 aa  43.5  0.0009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0267  hypothetical protein  27.12 
 
 		 202 aa  43.1  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000377506  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1237  cytochrome c family protein  48.89 
 
 		 247 aa  43.5  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0413  cytochrome c class III  28.37 
 
 		 133 aa  42.7  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.168464 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2038  cytochrome c class III  31.58 
 
 		 326 aa  42.4  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1266  cytochrome c class III  33.72 
 
 		 224 aa  42.4  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.113202  normal  0.0397908 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0679  hypothetical protein  27.45 
 
 		 175 aa  42  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000135984 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0653  high-molecular-weight cytochrome c  37.5 
 
 		 555 aa  42  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4139  hypothetical protein  25.89 
 
 		 90 aa  41.2  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0720  cytochrome c, class III  27.61 
 
 		 137 aa  40.8  0.006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.741108 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2108  cytochrome c class III  40 
 
 		 93 aa  40.8  0.007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.475879  normal  0.0343945 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2248  cytochrome c class III  41.18 
 
 		 92 aa  40.8  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0482879  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1697  cytochrome c, class III  41.18 
 
 		 92 aa  40.4  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.464908  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2158  cytochrome c class III  41.18 
 
 		 92 aa  40.4  0.008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0851587  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1731  cytochrome c class III  31.58 
 
 		 134 aa  40.4  0.009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>