24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2554 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_2554  acidic cytochrome c3  100 
 
 		 154 aa  309  9e-84  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3710  acidic cytochrome c3  51.13 
 
 		 128 aa  122  1e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2715  acidic cytochrome c3  56.36 
 
 		 126 aa  114  5e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.605139 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1027  cytochrome c class III  43.7 
 
 		 126 aa  100  5e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0567  cytochrome c class III  36.76 
 
 		 129 aa  86.7  1e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0462  cytochrome c class III  31.21 
 
 		 135 aa  57.4  0.00000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000017841  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0760  cytochrome c, class III  35.58 
 
 		 581 aa  48.9  0.00003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.085128  normal  0.192242 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3652  hypothetical protein  29.49 
 
 		 176 aa  47.4  0.00008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00511438  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2831  hypothetical protein  32.98 
 
 		 184 aa  47.4  0.00008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000373636  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2250  cytochrome c class III  31.25 
 
 		 538 aa  46.2  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000197158  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3004  cytochrome c class III  31.51 
 
 		 142 aa  46.2  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2420  cytochrome c class III  28.28 
 
 		 136 aa  45.1  0.0003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000311194 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3170  cytochrome c, class III  26.62 
 
 		 160 aa  45.1  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000276293  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0305  cytochrome c class III  29.46 
 
 		 225 aa  44.7  0.0005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.936992  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1024  cytochrome c3  46.3 
 
 		 92 aa  43.5  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4043  cytochrome c3  42.31 
 
 		 94 aa  42.4  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4134  cytochrome c3  42.31 
 
 		 94 aa  42.7  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2598  cytochrome c class III  32.53 
 
 		 556 aa  42.4  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4049  hypothetical protein  44 
 
 		 90 aa  42  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4139  hypothetical protein  42 
 
 		 90 aa  41.2  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0568  cytochrome c class III  30.09 
 
 		 514 aa  41.2  0.005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0877  cytochrome c class III  34.88 
 
 		 557 aa  41.2  0.006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.934871  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0612  cytochrome c3  46 
 
 		 91 aa  41.2  0.006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.000139054  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0364  cytochrome c3  46.15 
 
 		 91 aa  40.4  0.009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0118878  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>