More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_2856 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_2856  hypothetical protein  100 
 
 
288 aa  563  1e-160  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.566948  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3043  protein of unknown function DUF6 transmembrane  60.79 
 
 
323 aa  325  4.0000000000000003e-88  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.177704 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1985  hypothetical protein  53.41 
 
 
294 aa  282  4.0000000000000003e-75  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.207208 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2908  hypothetical protein  44.88 
 
 
297 aa  227  2e-58  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.903302 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1301  hypothetical protein  45.74 
 
 
294 aa  211  7.999999999999999e-54  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.488706  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0102  protein of unknown function DUF6 transmembrane  45.79 
 
 
289 aa  199  3.9999999999999996e-50  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.734078 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1399  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.08 
 
 
300 aa  183  3e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.420526  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1059  hypothetical protein  28.22 
 
 
317 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.999604  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0348  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.67 
 
 
309 aa  112  8.000000000000001e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0150113 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1464  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.45 
 
 
310 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2001  hypothetical protein  31.1 
 
 
315 aa  107  3e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00115846  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2808  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.18 
 
 
317 aa  106  5e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05410  predicted permease, DMT superfamily  29.64 
 
 
312 aa  98.6  1e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.41466  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0729  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.21 
 
 
295 aa  89.7  5e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0409163  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0574  hypothetical protein  30.43 
 
 
308 aa  85.9  7e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.421422  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0884  transporter  26.6 
 
 
299 aa  82.4  0.000000000000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2849  hypothetical protein  33.62 
 
 
286 aa  81.3  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0935  hypothetical protein  28.09 
 
 
287 aa  81.3  0.00000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0348  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.83 
 
 
299 aa  79.7  0.00000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0039  hypothetical protein  29.2 
 
 
290 aa  79.3  0.00000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3033  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.76 
 
 
286 aa  79.3  0.00000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0835297  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1056  hypothetical protein  29.25 
 
 
287 aa  79  0.0000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.753909  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2596  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.74 
 
 
314 aa  78.2  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000123708  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0926  hypothetical protein  27.24 
 
 
305 aa  78.6  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1095  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.2 
 
 
282 aa  77.4  0.0000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000428638  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_924  transport protein  26.72 
 
 
287 aa  77.4  0.0000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0491784  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0996  hypothetical protein  25.71 
 
 
274 aa  77.4  0.0000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.31188  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2634  DMT family permease  27.69 
 
 
327 aa  77  0.0000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0644823  normal  0.93988 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1502  hypothetical protein  30.43 
 
 
292 aa  76.6  0.0000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.207874  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1215  hypothetical protein  26.77 
 
 
299 aa  75.5  0.0000000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4047  hypothetical protein  28.15 
 
 
312 aa  73.9  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1424  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.67 
 
 
530 aa  73.9  0.000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000539805  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2545  integral membrane protein  31.08 
 
 
308 aa  73.6  0.000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.723869 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1015  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.77 
 
 
297 aa  73.2  0.000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.604771  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1538  hypothetical protein  31.44 
 
 
292 aa  72.4  0.000000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.746506  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0320  hypothetical protein  22.14 
 
 
310 aa  72.4  0.000000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0911  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.35 
 
 
294 aa  72.4  0.000000000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0168694  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0214  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.57 
 
 
311 aa  72  0.00000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2782  hypothetical protein  30.74 
 
 
286 aa  71.6  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0548906  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0035  hypothetical protein  22.26 
 
 
300 aa  72  0.00000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0550  EamA family protein  20.74 
 
 
308 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0581  eama family protein  20.74 
 
 
308 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23190  predicted permease  28.96 
 
 
287 aa  70.5  0.00000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0147782 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2185  hypothetical protein  27.76 
 
 
291 aa  70.5  0.00000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3346  hypothetical protein  28.16 
 
 
331 aa  69.7  0.00000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1515  hypothetical protein  26.39 
 
 
273 aa  69.7  0.00000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.910638  normal  0.799854 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2939  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.76 
 
 
286 aa  70.1  0.00000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.734592  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1107  hypothetical protein  32.02 
 
 
316 aa  69.7  0.00000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0442  hypothetical protein  27.53 
 
 
302 aa  69.3  0.00000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0637  transporter, EamA family  21.59 
 
 
308 aa  69.3  0.00000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0492  DMT family permease  20.74 
 
 
308 aa  69.3  0.00000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.348836  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0949  hypothetical protein  33.33 
 
 
397 aa  68.9  0.00000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.217606  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1818  hypothetical protein  27.23 
 
 
283 aa  68.9  0.00000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.264733  normal  0.803156 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2194  hypothetical protein  29.33 
 
 
305 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00374881 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1008  hypothetical protein  32.02 
 
 
312 aa  68.6  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.508617 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4486  DMT family permease  27.78 
 
 
304 aa  68.2  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1916  hypothetical protein  30.15 
 
 
317 aa  68.6  0.0000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.594708  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2730  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.42 
 
 
310 aa  68.6  0.0000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0259  drug/metabolite exporter  25.87 
 
 
292 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0455861  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1024  ribosomal protein S6  27.8 
 
 
293 aa  67  0.0000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1128  phosphate acetyltransferase (phosphotransacetylase)  25.59 
 
 
300 aa  66.6  0.0000000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00496781  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0548  DMT family permease  25.18 
 
 
306 aa  66.6  0.0000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.956641  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0347  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.57 
 
 
293 aa  65.9  0.0000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0149413 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0438  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.9 
 
 
316 aa  65.9  0.0000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0494  DMT family permease  21.89 
 
 
308 aa  65.9  0.0000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0619  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  21.26 
 
 
308 aa  65.9  0.0000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1374  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.31 
 
 
289 aa  65.5  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0209968 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1098  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  24.89 
 
 
312 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.15622  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2247  hypothetical protein  30.92 
 
 
309 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.654485 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2885  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.92 
 
 
325 aa  64.3  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0495  hypothetical protein  21.26 
 
 
310 aa  64.7  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1633  hypothetical protein  21.93 
 
 
321 aa  64.3  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.614704  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4207  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  24.89 
 
 
313 aa  63.9  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1044  hypothetical protein  30.54 
 
 
308 aa  63.9  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1563  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.32 
 
 
305 aa  63.9  0.000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.324691  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0292  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.09 
 
 
292 aa  63.2  0.000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2677  hypothetical protein  29.09 
 
 
302 aa  62.8  0.000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0933  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.04 
 
 
311 aa  62.8  0.000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.273134 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0078  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.31 
 
 
301 aa  62.8  0.000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.138345  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2351  hypothetical protein  31.62 
 
 
309 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.240563 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2367  hypothetical protein  30.43 
 
 
309 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.169121  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0129  protein of unknown function DUF6 transmembrane  20.71 
 
 
283 aa  62.4  0.000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5670  hypothetical protein  29.66 
 
 
309 aa  62.4  0.000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.846294 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2450  drug/metabolite exporter family protein  23.72 
 
 
303 aa  62  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000213459  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27470  predicted membrane protein  28.79 
 
 
289 aa  62  0.00000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1849  hypothetical protein  29.18 
 
 
319 aa  62  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1055  hypothetical protein  30.05 
 
 
296 aa  62  0.00000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1892  transporter, EamA family  22.3 
 
 
322 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0271761  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0707  transporter, EamA family  20.27 
 
 
308 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2328  hypothetical protein  31.62 
 
 
309 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1716  hypothetical protein  31.62 
 
 
309 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.131137  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3388  hypothetical protein  28.67 
 
 
321 aa  60.8  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0645  EamA family protein  20.13 
 
 
308 aa  60.8  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1343  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.13 
 
 
294 aa  60.8  0.00000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1341  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.96 
 
 
321 aa  60.5  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000917632 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4720  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  20.6 
 
 
308 aa  60.5  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2468  hypothetical protein  26.38 
 
 
303 aa  60.5  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0312814  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0644  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.86 
 
 
287 aa  60.5  0.00000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000380606  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0792  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.42 
 
 
296 aa  60.8  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.90814  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7788  hypothetical protein  32.37 
 
 
296 aa  60.1  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.847344  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>