114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_2000 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_2000  transport-associated protein  100 
 
 		 185 aa  379  1e-104  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0471437  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2802  transport-associated  39.51 
 
 		 184 aa  109  3e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0366  transport-associated, putative  31.05 
 
 		 191 aa  93.6  2e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.140163  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2204  transport-associated  35.03 
 
 		 176 aa  85.9  3e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0589  phospholipid-binding domain-containing protein  30.43 
 
 		 183 aa  84.3  0.000000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2199  putative transport-associated  29.03 
 
 		 191 aa  80.9  0.000000000000009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1844  transport-associated  32.32 
 
 		 235 aa  76.6  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1193  transport-associated protein  31.31 
 
 		 199 aa  73.6  0.000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3585  periplasmic protein  34.46 
 
 		 218 aa  72  0.000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4917  periplasmic protein  31.94 
 
 		 205 aa  72  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.292031  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4969  periplasmic protein  31.94 
 
 		 205 aa  72  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4815  periplasmic protein  31.94 
 
 		 205 aa  72  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4882  periplasmic protein  31.94 
 
 		 205 aa  72  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0715597  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4976  periplasmic protein  31.94 
 
 		 205 aa  72  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.163142  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5888  periplasmic protein  30.48 
 
 		 201 aa  70.9  0.00000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.223121  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4919  periplasmic protein  29.32 
 
 		 201 aa  70.1  0.00000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.618733  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4973  periplasmic protein  29.95 
 
 		 201 aa  69.3  0.00000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00297721  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04251  periplasmic protein  29.95 
 
 		 201 aa  68.9  0.00000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.368391  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3623  transport-associated  29.95 
 
 		 201 aa  68.9  0.00000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04217  hypothetical protein  29.95 
 
 		 201 aa  68.9  0.00000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.310729  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4610  periplasmic protein  29.95 
 
 		 201 aa  68.9  0.00000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0762495  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3681  periplasmic protein  29.95 
 
 		 201 aa  68.9  0.00000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.261916  hitchhiker  0.00179473 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0073  transport-associated  30.91 
 
 		 196 aa  68.6  0.00000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0552  periplasmic protein  35.14 
 
 		 202 aa  67.8  0.00000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.783524  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0653  periplasmic protein  34.01 
 
 		 204 aa  67  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.335563 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4923  periplasmic protein  29.95 
 
 		 201 aa  66.6  0.0000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.497608  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0454  periplasmic protein  34.46 
 
 		 202 aa  65.9  0.0000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.390695  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0535  periplasmic protein  27.32 
 
 		 205 aa  65.1  0.0000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.388761  hitchhiker  0.00819185 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3465  periplasmic protein  36.24 
 
 		 202 aa  64.7  0.0000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1195  transport-associated protein  33.55 
 
 		 192 aa  64.3  0.0000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0472  hypothetical protein  28.95 
 
 		 191 aa  63.2  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1123  hypothetical protein  28.95 
 
 		 191 aa  63.2  0.000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0536  hypothetical protein  28.95 
 
 		 191 aa  63.2  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.35439  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3525  hypothetical protein  30.73 
 
 		 191 aa  62.4  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.950572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3562  hypothetical protein  30.73 
 
 		 191 aa  62.4  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3456  hypothetical protein  30.73 
 
 		 191 aa  62.4  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3454  hypothetical protein  30.73 
 
 		 191 aa  62.4  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3622  hypothetical protein  30.73 
 
 		 191 aa  62.4  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3587  transport-associated  27.81 
 
 		 191 aa  62.4  0.000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3627  hypothetical protein  29.47 
 
 		 190 aa  59.7  0.00000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3503  periplasmic protein  28.57 
 
 		 204 aa  59.3  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0836  periplasmic protein  28.57 
 
 		 204 aa  59.3  0.00000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3632  periplasmic protein  28.57 
 
 		 204 aa  59.3  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3445  hypothetical protein  28.73 
 
 		 191 aa  59.3  0.00000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3622  hypothetical protein  28.73 
 
 		 191 aa  58.9  0.00000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03017  hypothetical protein  28.73 
 
 		 191 aa  58.5  0.00000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0555  transport-associated  28.73 
 
 		 191 aa  58.5  0.00000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3342  hypothetical protein  28.73 
 
 		 191 aa  58.5  0.00000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3632  hypothetical protein  28.73 
 
 		 191 aa  58.5  0.00000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4339  hypothetical protein  28.11 
 
 		 191 aa  58.5  0.00000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.135394 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02968  hypothetical protein  28.73 
 
 		 191 aa  58.5  0.00000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0548  hypothetical protein  28.73 
 
 		 191 aa  58.5  0.00000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.496742  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0305  hypothetical protein  29.19 
 
 		 190 aa  58.5  0.00000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0106896  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3785  hypothetical protein  29.83 
 
 		 191 aa  58.5  0.00000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00453791  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4469  hypothetical protein  28.73 
 
 		 191 aa  58.5  0.00000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3015  transport-associated  27.32 
 
 		 230 aa  57  0.0000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3587  hypothetical protein  29.03 
 
 		 191 aa  57.4  0.0000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.666559  normal  0.189864 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0311  hypothetical protein  28.65 
 
 		 190 aa  57  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.716428  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3691  transport-associated protein  24.54 
 
 		 211 aa  53.9  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.310052  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3297  transport-associated  26.4 
 
 		 201 aa  54.3  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.173268  normal  0.854509 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0335  putative osmotically inducible protein  24.73 
 
 		 202 aa  50.8  0.00001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.161455  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0477  transport-associated  31.63 
 
 		 103 aa  49.7  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2799  transporter, putative  32.73 
 
 		 266 aa  49.3  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00116321  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0039  phospholipid-binding domain-containing protein  32.73 
 
 		 266 aa  49.3  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0022  putative phospholipid-binding protein  32.73 
 
 		 266 aa  49.3  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0386174  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1744  putative phospholipid-binding protein  32.73 
 
 		 256 aa  49.7  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3817  putative phospholipid-binding protein  32.73 
 
 		 266 aa  49.3  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.262069  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3898  putative phospholipid-binding protein  32.73 
 
 		 266 aa  49.3  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3178  putative phospholipid-binding protein  32.73 
 
 		 256 aa  49.7  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1939  phospholipid-binding domain-containing protein  33.77 
 
 		 104 aa  49.3  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.315443  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2319  phospholipid-binding domain-containing protein  33.77 
 
 		 104 aa  49.3  0.00003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2048  transport-associated  33.77 
 
 		 104 aa  49.3  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0632  transport-associated  28.57 
 
 		 218 aa  48.9  0.00004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00888  hypothetical protein  26.63 
 
 		 219 aa  49.3  0.00004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0199  transport-associated protein  30.91 
 
 		 265 aa  48.9  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.89233  unclonable  0.00000000000748386 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3146  transporter, putative  31.82 
 
 		 266 aa  48.5  0.00005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0204  transport-associated  31.82 
 
 		 265 aa  48.5  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1642  putative periplasmic protein  41.54 
 
 		 144 aa  48.1  0.00006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0830703  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0321  hypothetical protein  31.03 
 
 		 198 aa  48.1  0.00007  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0416  transport-associated  32.53 
 
 		 224 aa  48.1  0.00007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0408  transport-associated  32.53 
 
 		 224 aa  47.8  0.00009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3393  periplasmic or secreted lipoprotein  31.82 
 
 		 265 aa  47  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2285  transport-associated  32.17 
 
 		 194 aa  47.4  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.590876 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2814  transport-associated  31.82 
 
 		 266 aa  47  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0292  transport-associated  31.82 
 
 		 266 aa  47  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004504  putative hemolysin  25.43 
 
 		 221 aa  47.4  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000000407403  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0950  transport-associated  34.18 
 
 		 171 aa  47  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.239728  normal  0.788848 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1094  transport-associated  34.18 
 
 		 171 aa  47  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3696  transport-associated  27.15 
 
 		 192 aa  46.6  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.148519  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0273  transport-associated  31.82 
 
 		 266 aa  46.6  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0122562 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3695  transport-associated  23.3 
 
 		 188 aa  45.8  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.904296  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0218  transport-associated  30.91 
 
 		 265 aa  45.8  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.011843 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0055  putative osmotically inducible protein  24.61 
 
 		 219 aa  45.8  0.0004  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4102  transport-associated  23.86 
 
 		 188 aa  45.4  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4072  transport-associated  23.86 
 
 		 188 aa  45.4  0.0004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4190  transport-associated  23.86 
 
 		 188 aa  45.4  0.0004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3992  transport-associated  23.86 
 
 		 188 aa  45.4  0.0004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4311  periplasmic phospholipid binding protein  31.07 
 
 		 264 aa  45.4  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3687  transport-associated  22.73 
 
 		 188 aa  45.1  0.0005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0258  transport-associated  22.73 
 
 		 188 aa  45.1  0.0005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>