More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_1761 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_1761  ABC transporter related  100 
 
 
274 aa  549  1e-155  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1797  ABC transporter related  65.06 
 
 
282 aa  336  2.9999999999999997e-91  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.169202  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2913  ABC transporter-related protein  60 
 
 
278 aa  302  3.0000000000000004e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2059  ABC transporter related  51.11 
 
 
283 aa  266  2.9999999999999995e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.113348  normal  0.75932 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1102  ABC transporter related  52.08 
 
 
278 aa  251  7e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3554  ABC dipeptide/oligopeptide/nickel transporter, ATP binding protein  47.86 
 
 
292 aa  233  2.0000000000000002e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4037  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter ATP binding protein  47.86 
 
 
292 aa  233  2.0000000000000002e-60  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3689  ABC transporter related  47.86 
 
 
292 aa  233  2.0000000000000002e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2717  ABC transporter related  46.1 
 
 
279 aa  228  1e-58  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3382  ABC transporter related  47.55 
 
 
274 aa  227  2e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.235988 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3201  ABC transporter related  47.37 
 
 
291 aa  218  7.999999999999999e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.776015  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3849  ABC transporter related  43.23 
 
 
277 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.997638 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2323  ABC transporter related  43.77 
 
 
277 aa  214  9.999999999999999e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.936398 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4177  ABC transporter related  42.48 
 
 
277 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3091  ABC transporter related  42.7 
 
 
287 aa  207  2e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3885  ABC transporter  42.32 
 
 
277 aa  207  2e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1027  dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein  40.37 
 
 
291 aa  206  3e-52  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.26315  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2043  ABC transporter related  44.32 
 
 
276 aa  205  6e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.336265  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1903  ABC transporter related  40.75 
 
 
277 aa  205  8e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.264494  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1251  ABC transporter related  43.36 
 
 
284 aa  205  8e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5439  ABC transporter related  40 
 
 
285 aa  203  2e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.476246  hitchhiker  0.0038839 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2462  ABC transporter related  44.4 
 
 
274 aa  203  2e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.612548  normal  0.124723 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0804  ABC dipeptide transporter, ATPase subunit DppD  44.4 
 
 
274 aa  202  6e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.69273  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0375  ABC transporter related  45.69 
 
 
274 aa  202  6e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.157561  normal  0.579699 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0065  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  40 
 
 
371 aa  201  7e-51  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3832  ABC transporter related  45.76 
 
 
280 aa  202  7e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.817561  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3990  ABC transporter related  42.11 
 
 
276 aa  201  8e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1882  ABC transporter related  40.45 
 
 
279 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.573524  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3738  ABC transporter related  40.23 
 
 
276 aa  199  5e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0710924  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3864  ABC transporter related  39.62 
 
 
295 aa  198  7e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5170  ABC transporter related  38.87 
 
 
285 aa  196  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.219608  normal  0.319827 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4041  ABC transporter related protein  39.25 
 
 
295 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0064  ABC transporter related  42.19 
 
 
284 aa  196  3e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.080587  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3368  ABC transporter related  40.75 
 
 
297 aa  195  5.000000000000001e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3317  ABC transporter related  44.02 
 
 
545 aa  194  9e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0279839  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7185  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  42.75 
 
 
332 aa  193  3e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2052  peptide ABC transporter ATP-binding protein  41.33 
 
 
343 aa  192  3e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.618151 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2703  ABC transporter related  42.28 
 
 
287 aa  192  4e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3990  dipeptide transporter ATP-binding subunit  40.47 
 
 
327 aa  192  5e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0393  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  43.49 
 
 
338 aa  192  6e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.207731 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0889  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  43.75 
 
 
334 aa  192  6e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0138  ABC transporter related  40.31 
 
 
276 aa  191  8e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5657  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  45.17 
 
 
333 aa  191  9e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.991753 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5439  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  42.75 
 
 
350 aa  191  1e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1920  ABC transporter component  44.09 
 
 
276 aa  191  1e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.2221  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0425  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  42.54 
 
 
338 aa  191  1e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.167314  normal  0.0389078 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0320  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  40.23 
 
 
322 aa  191  1e-47  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.173398 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4033  dipeptide transporter ATP-binding subunit  40.23 
 
 
327 aa  190  2e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4909  dipeptide transporter ATP-binding subunit  40.23 
 
 
327 aa  190  2e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03392  dipeptide transporter  40.23 
 
 
327 aa  190  2e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0171  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  40.23 
 
 
327 aa  190  2e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0818  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  43.36 
 
 
334 aa  191  2e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3251  dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein  40.41 
 
 
279 aa  190  2e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0275021  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3860  dipeptide transporter ATP-binding subunit  40.23 
 
 
327 aa  190  2e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3740  dipeptide transporter ATP-binding subunit  40.23 
 
 
327 aa  190  2e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03343  hypothetical protein  40.23 
 
 
327 aa  190  2e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.837106  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0174  dipeptide transporter ATP-binding subunit  40.23 
 
 
327 aa  190  2e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3235  ABC peptide transporter, ATPase subunit  40.45 
 
 
282 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3600  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  41.26 
 
 
331 aa  189  2.9999999999999997e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3972  ABC transporter related  40.45 
 
 
282 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4007  ABC transporter related  42.91 
 
 
297 aa  189  4e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0035  ABC transporter related  40 
 
 
285 aa  189  5e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00363386  normal  0.320006 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3534  ABC transporter related  40.15 
 
 
295 aa  188  9e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.463988 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6474  putative oligopeptide ABC transporter (ATP binding protein)  41.26 
 
 
336 aa  187  2e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0774668  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3839  dipeptide transporter ATP-binding subunit  40.47 
 
 
327 aa  187  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3947  dipeptide transporter ATP-binding subunit  40.47 
 
 
327 aa  187  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.301836  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3854  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  38.78 
 
 
346 aa  187  2e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.403514  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3825  dipeptide transporter ATP-binding subunit  40.47 
 
 
327 aa  187  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3903  dipeptide transporter ATP-binding subunit  40.47 
 
 
327 aa  187  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.721357  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3115  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  41.02 
 
 
671 aa  187  2e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.426861  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5119  ABC transporter ATP-binding protein  43.36 
 
 
324 aa  186  2e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58470  ABC transporter ATP-binding protein  43.36 
 
 
324 aa  186  2e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.868458  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3616  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  43.85 
 
 
356 aa  187  2e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4007  dipeptide transporter ATP-binding subunit  40.47 
 
 
327 aa  187  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4059  dipeptide transporter ATP-binding subunit  40.23 
 
 
326 aa  186  4e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2764  ABC transporter related  44.49 
 
 
631 aa  186  4e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.651768 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0091  dipeptide transporter ATP-binding subunit  40.23 
 
 
326 aa  186  4e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.887805  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4072  dipeptide transporter ATP-binding subunit  40.23 
 
 
326 aa  186  4e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0671  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  41.94 
 
 
321 aa  186  4e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.642349  normal 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3883  ABC di/oligopeptide transporter, ATPase subunit  40.39 
 
 
338 aa  186  4e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0487  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  43.58 
 
 
340 aa  186  4e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0141  dipeptide transporter ATP-binding subunit  41.25 
 
 
326 aa  186  5e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4053  ABC transporter related  44.13 
 
 
301 aa  186  5e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.149041  normal  0.435082 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1870  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like protein  38.11 
 
 
333 aa  185  6e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0687438  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4080  ABC transporter related  43.19 
 
 
542 aa  185  6e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1185  ABC transporter related  41.41 
 
 
547 aa  185  7e-46  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4157  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  40.39 
 
 
338 aa  185  8e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.55271 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0187  dipeptide transporter ATP-binding subunit  39.45 
 
 
327 aa  185  8e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0235094  normal  0.710337 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0111  dipeptide transporter ATP-binding subunit  40.78 
 
 
322 aa  185  9e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3504  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  39.93 
 
 
339 aa  184  9e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.307632  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05094  hypothetical protein  38.01 
 
 
543 aa  184  1.0000000000000001e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0234  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  41 
 
 
351 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2636  ABC transporter related  43.13 
 
 
547 aa  184  1.0000000000000001e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.723017  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0194  peptide/opine/nickel ABC transporter ATPase  42.91 
 
 
296 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0233708 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0477  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  36.6 
 
 
341 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000893655  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4781  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  43.56 
 
 
703 aa  184  1.0000000000000001e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000215564 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0890  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  41.31 
 
 
690 aa  184  1.0000000000000001e-45  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1478  ABC oligopeptide transporter, fused ATPase subunits  40.74 
 
 
539 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0559812  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0129  ABC transporter related  40.74 
 
 
539 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2887  ABC transporter related  41.11 
 
 
539 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.873295  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>