More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_1759 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_1759  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 		 347 aa  688    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1795  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  67.15 
 
 		 346 aa  426  1e-118  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0835992  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2915  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  64.61 
 
 		 350 aa  398  9.999999999999999e-111  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2057  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57.7 
 
 		 352 aa  377  1e-103  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.239018  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3552  ABC dipeptide/oligopeptide/nickel transporter, permease protein  52.58 
 
 		 349 aa  336  2.9999999999999997e-91  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4039  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter permease  52.58 
 
 		 349 aa  336  2.9999999999999997e-91  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3687  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.58 
 
 		 349 aa  336  2.9999999999999997e-91  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3384  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.63 
 
 		 360 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.245336 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1104  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.7 
 
 		 340 aa  327  2.0000000000000001e-88  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2715  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.62 
 
 		 383 aa  315  5e-85  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3866  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.22 
 
 		 346 aa  307  1.0000000000000001e-82  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2045  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.64 
 
 		 351 aa  307  2.0000000000000002e-82  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.100967  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0037  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.69 
 
 		 352 aa  307  2.0000000000000002e-82  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0522734  normal  0.204601 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3370  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.83 
 
 		 352 aa  306  4.0000000000000004e-82  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1249  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.4 
 
 		 352 aa  302  5.000000000000001e-81  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.716878 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0136  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.85 
 
 		 336 aa  302  6.000000000000001e-81  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3887  ABC transporter membrane spanning protein (oligopeptide)  48.47 
 
 		 355 aa  301  1e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0373  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.62 
 
 		 356 aa  300  2e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.112359  normal  0.427552 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1905  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.43 
 
 		 365 aa  300  3e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.074595  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4005  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.92 
 
 		 356 aa  297  1e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4043  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.62 
 
 		 346 aa  297  2e-79  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0196  peptide/opine/nickel ABC transporter inner membrane protein  47.69 
 
 		 356 aa  296  3e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0448682 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0806  ABC dipeptide transporter, inner membrane subunit DppB  48.92 
 
 		 356 aa  295  9e-79  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.557497  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1443  ABC transporter, permease protein  48.62 
 
 		 330 aa  295  9e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2464  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.92 
 
 		 356 aa  293  3e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.314195 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4055  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.61 
 
 		 356 aa  293  4e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.767005 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6302  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.45 
 
 		 356 aa  292  5e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3992  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.48 
 
 		 336 aa  292  7e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4018  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.69 
 
 		 356 aa  290  3e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0210654  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1252  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter inner membrane protein  47.38 
 
 		 356 aa  289  5.0000000000000004e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4480  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.38 
 
 		 356 aa  288  7e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.598069 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5713  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.08 
 
 		 356 aa  287  2e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.076951 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3776  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.77 
 
 		 356 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.642947  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4592  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.77 
 
 		 356 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00157663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3830  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.29 
 
 		 364 aa  285  8e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.592217 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1918  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  46.36 
 
 		 333 aa  281  9e-75  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1693  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.73 
 
 		 342 aa  281  1e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.162218  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1275  ABC transporter, permease protein  48 
 
 		 336 aa  281  1e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.572487  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1391  ABC transporter, permease protein  48 
 
 		 356 aa  281  1e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0350688  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1049  ABC transporter, permease protein  48 
 
 		 356 aa  281  1e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0519  ABC transporter, permease protein  48 
 
 		 356 aa  281  1e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.872577  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0248  ABC transporter, permease protein  48 
 
 		 356 aa  281  1e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1310  ABC transporter, permease protein  48 
 
 		 356 aa  281  1e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.38015  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4179  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.55 
 
 		 355 aa  280  2e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.800769  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2561  ABC transporter, permease protein  47.69 
 
 		 356 aa  280  3e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3851  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.55 
 
 		 355 aa  280  3e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1879  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.15 
 
 		 345 aa  279  5e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.716973 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1879  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.73 
 
 		 342 aa  279  5e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.240236  normal  0.205631 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2325  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.56 
 
 		 347 aa  279  5e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0789045  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7645  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.31 
 
 		 356 aa  279  6e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2705  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.99 
 
 		 345 aa  276  5e-73  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3199  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.23 
 
 		 369 aa  273  4.0000000000000004e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.166157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3536  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.65 
 
 		 355 aa  272  6e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.857231 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0800  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  49.04 
 
 		 356 aa  271  1e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3089  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.69 
 
 		 358 aa  271  1e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3740  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.27 
 
 		 337 aa  271  2e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3249  dipeptide ABC transporter, permease protein DppB, putative  46.58 
 
 		 345 aa  265  8e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0957202  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1029  dipeptide ABC transporter, permease protein  41.95 
 
 		 357 aa  265  8e-70  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.234633  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5172  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.38 
 
 		 365 aa  257  2e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.285903  normal  0.173747 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2348  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.2 
 
 		 338 aa  254  2.0000000000000002e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5441  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.72 
 
 		 364 aa  249  6e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.582701  hitchhiker  0.00744073 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1670  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.54 
 
 		 335 aa  235  9e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.851486 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0454  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.48 
 
 		 335 aa  235  1.0000000000000001e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.948745  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1081  peptide ABC transporter, permease protein  40.65 
 
 		 337 aa  234  1.0000000000000001e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.446829  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1223  Nickel-transporting ATPase  37.76 
 
 		 339 aa  233  3e-60  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0308435 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2357  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  40.48 
 
 		 336 aa  232  7.000000000000001e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0452163  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0113  nickel-transporting ATPase  38.6 
 
 		 336 aa  231  1e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3039  nickel-transporting ATPase  41.39 
 
 		 336 aa  231  1e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.408808 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3841  dipeptide transporter permease DppB  38.64 
 
 		 339 aa  229  5e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4097  dipeptide transporter permease DppB  38.55 
 
 		 339 aa  229  5e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.710265  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4009  dipeptide transporter permease DppB  38.64 
 
 		 339 aa  229  5e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3827  dipeptide transporter permease DppB  38.64 
 
 		 339 aa  229  5e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3949  dipeptide transporter permease DppB  38.64 
 
 		 339 aa  229  5e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.788898  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3905  dipeptide transporter permease DppB  38.64 
 
 		 339 aa  229  6e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2453  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.3 
 
 		 334 aa  229  7e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.17389  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0045  dipeptide transporter permease DppB  37.95 
 
 		 339 aa  228  2e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03394  dipeptide transporter  38.02 
 
 		 339 aa  227  3e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0169  Alkaline phosphatase  38.02 
 
 		 339 aa  227  3e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3906  dipeptide transporter permease DppB  37.95 
 
 		 339 aa  226  3e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6391  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, inner membrane subunit  40.79 
 
 		 336 aa  226  3e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.314486  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03345  hypothetical protein  38.02 
 
 		 339 aa  227  3e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4035  dipeptide transporter permease DppB  38.02 
 
 		 339 aa  227  3e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3988  dipeptide transporter permease DppB  38.02 
 
 		 339 aa  227  3e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0066  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.04 
 
 		 334 aa  227  3e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3742  dipeptide transporter permease DppB  38.02 
 
 		 339 aa  227  3e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0172  dipeptide transporter permease DppB  38.02 
 
 		 339 aa  227  3e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4911  dipeptide transporter permease DppB  38.02 
 
 		 381 aa  226  3e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3862  dipeptide transporter permease DppB  38.02 
 
 		 339 aa  227  3e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0859  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.86 
 
 		 333 aa  226  4e-58  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000322853  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0050  dipeptide transporter permease DppB  37.95 
 
 		 339 aa  226  4e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.969756  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2430  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.18 
 
 		 336 aa  226  4e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3044  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.18 
 
 		 336 aa  226  4e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3063  alkaline phosphatase  40.18 
 
 		 336 aa  226  6e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.273839 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2955  alkaline phosphatase  40.48 
 
 		 336 aa  225  8e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1583  alkaline phosphatase  37.84 
 
 		 335 aa  224  1e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.354079  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0221  dipeptide ABC transporter, permease protein  39.94 
 
 		 336 aa  225  1e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0185  dipeptide transporter permease DppB  37.95 
 
 		 339 aa  224  1e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.446355  normal  0.432086 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2054  peptide ABC transporter permease  40.3 
 
 		 336 aa  224  1e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0359637  normal  0.365039 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3753  Alkaline phosphatase  39.94 
 
 		 336 aa  224  2e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.634321 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3089  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.18 
 
 		 336 aa  224  2e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>