49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_1155 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_1155  cell envelope integrity inner membrane protein TolA  100 
 
 		 389 aa  737    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2903  cell envelope integrity inner membrane protein TolA  93.18 
 
 		 399 aa  218  1e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0610651  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0842  cell envelope integrity inner membrane protein TolA  65.6 
 
 		 424 aa  175  9.999999999999999e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000389137  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1248  cell envelope integrity inner membrane protein TolA  78.91 
 
 		 395 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000169991  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1237  cell envelope integrity inner membrane protein TolA  71.21 
 
 		 406 aa  147  3e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0261791  normal  0.0695422 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3088  cell envelope integrity inner membrane protein TolA  77.86 
 
 		 386 aa  144  2e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00644238  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1278  cell envelope integrity inner membrane protein TolA  66.94 
 
 		 412 aa  135  1.9999999999999998e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000166753  hitchhiker  0.0000389021 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2896  protein TolA  59.42 
 
 		 421 aa  134  3e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000491333  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00688  hypothetical protein  59.42 
 
 		 421 aa  134  3e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000128446  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0661  cell envelope integrity inner membrane protein TolA  59.42 
 
 		 395 aa  134  3e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000498099  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0762  cell envelope integrity inner membrane protein TolA  59.42 
 
 		 426 aa  134  3e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000171784  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2916  cell envelope integrity inner membrane protein TolA  59.42 
 
 		 423 aa  134  3e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000145417  normal  0.52602 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0768  cell envelope integrity inner membrane protein TolA  59.42 
 
 		 432 aa  134  3e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000263681  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0792  cell envelope integrity inner membrane protein TolA  59.42 
 
 		 421 aa  134  3e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000022577  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00699  cell envelope integrity inner membrane protein TolA  59.42 
 
 		 421 aa  134  3e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00012175  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2869  cell envelope integrity inner membrane protein TolA  67.91 
 
 		 388 aa  123  6e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000082663  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1396  cell envelope integrity inner membrane protein TolA  67.91 
 
 		 388 aa  123  6e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000130996  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2957  cell envelope integrity inner membrane protein TolA  68.18 
 
 		 393 aa  122  9.999999999999999e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0300934  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0843  cell envelope integrity inner membrane protein TolA  63.04 
 
 		 392 aa  113  7.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0151621  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0783  cell envelope integrity inner membrane protein TolA  63.04 
 
 		 392 aa  113  7.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000209299  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0874  cell envelope integrity inner membrane protein TolA  63.04 
 
 		 392 aa  113  7.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.214634  normal  0.358467 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0810  cell envelope integrity inner membrane protein TolA  63.04 
 
 		 392 aa  113  7.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.144537  normal  0.789068 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2049  colicin uptake-like protein  51.06 
 
 		 146 aa  112  1.0000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1393  hypothetical protein  31.15 
 
 		 328 aa  98.2  2e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000536616  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0261  cell envelope integrity inner membrane protein TolA  28.29 
 
 		 351 aa  87.4  3e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00647443  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2940  hypothetical protein  29.06 
 
 		 298 aa  84.7  0.000000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000421874  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1897  TolA protein, membrane component  31.82 
 
 		 335 aa  70.1  0.00000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1430  tolA protein  29.82 
 
 		 356 aa  65.5  0.000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000458161  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1461  TolA family protein  34.48 
 
 		 320 aa  62  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00341972  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02685  TolA-like protein  30.69 
 
 		 293 aa  59.3  0.0000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00715679  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1856  TolA family protein  26.71 
 
 		 319 aa  58.2  0.0000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0299684  normal  0.827846 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2565  Tol-Pal system TolA  30.73 
 
 		 311 aa  48.9  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000197392  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5487  cell wall anchor domain-containing protein  31.71 
 
 		 3242 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1730  putative tolA protein  30.59 
 
 		 304 aa  48.9  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010182  BcerKBAB4_5328  phage minor structural protein  47.2 
 
 		 2196 aa  48.5  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_24245  NCS1 family transporter: cytosine/purines/uracil/thiamine/allantoin  34.5 
 
 		 2378 aa  48.1  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.175257  decreased coverage  0.00602767 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1745  TolA family protein  33.55 
 
 		 342 aa  47.8  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000294178  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1741  Tol-Pal system TolA  33.55 
 
 		 340 aa  47.8  0.0004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000057982  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2539  protein TolA  33.55 
 
 		 340 aa  47.8  0.0004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000102859  hitchhiker  0.00000353705 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1784  protein TolA  33.55 
 
 		 341 aa  47.4  0.0005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000349437  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3565  protein of unknown function DUF323  26.58 
 
 		 925 aa  47  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.233339 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2398  accumulation associated protein  23.39 
 
 		 2397 aa  47  0.0006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.53067  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2019c  TolA  34.85 
 
 		 271 aa  45.4  0.002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.957522  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2039  ribonuclease E  40 
 
 		 926 aa  45.1  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000375144  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0174  protein TolA  34.85 
 
 		 273 aa  45.4  0.002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.877426  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1453  hypothetical protein  29.15 
 
 		 332 aa  44.3  0.004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3319  lytic transglycosylase, catalytic  39.9 
 
 		 718 aa  43.9  0.004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2296  hypothetical protein  31.14 
 
 		 331 aa  43.9  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.396677  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1474  1A family penicillin-binding protein  59.09 
 
 		 914 aa  43.1  0.008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>