164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_0678 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_0678  MmgE/PrpD family protein  100 
 
 
444 aa  888    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.367864  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0638  MmgE/PrpD family protein  74.15 
 
 
443 aa  632  1e-180  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3745  MmgE/PrpD family protein  64.17 
 
 
442 aa  545  1e-154  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3559  MmgE/PrpD family protein  65.07 
 
 
442 aa  535  1e-151  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.595946  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2365  MmgE/PrpD family protein  56.75 
 
 
439 aa  460  9.999999999999999e-129  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5175  hypothetical protein  45.11 
 
 
453 aa  299  8e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3582  MmgE/PrpD family protein  36.87 
 
 
451 aa  176  5e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0594439 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0108  propionate catabolism protein  31.09 
 
 
444 aa  168  2e-40  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3581  MmgE/PrpD family protein  36.82 
 
 
453 aa  160  4e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.604157  normal  0.0576732 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0284  putative MmgE/Prp family protein  37.27 
 
 
500 aa  158  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6636  MmgE/PrpD family protein  34.38 
 
 
457 aa  156  6e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.29162 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1004  putative MmgE/Prp family protein  41.04 
 
 
458 aa  150  6e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.451747 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1585  MmgE/PrpD family protein  40.53 
 
 
482 aa  141  3e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0449825  hitchhiker  0.00338638 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4268  MmgE/PrpD family protein  37.12 
 
 
454 aa  134  1.9999999999999998e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21260  MmgE/PrpD family protein  34.25 
 
 
456 aa  134  3.9999999999999996e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3457  MmgE/PrpD family protein  35.12 
 
 
462 aa  128  2.0000000000000002e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0718329  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1360  MmgE/PrpD family protein  30.55 
 
 
483 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.737608  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3094  MmgE/PrpD family protein  30.42 
 
 
453 aa  127  6e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1268  MmgE/PrpD family protein  29.31 
 
 
455 aa  124  2e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0113  MmgE/PrpD family protein  37.91 
 
 
465 aa  123  6e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1226  hypothetical protein  30.06 
 
 
490 aa  121  3e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3986  MmgE/PrpD family protein  35.94 
 
 
441 aa  121  3e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3583  MmgE/PrpD family protein  37.59 
 
 
462 aa  121  3e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0329422 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4513  MmgE/PrpD family protein  34.77 
 
 
463 aa  121  3e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2141  MmgE/PrpD family protein  29.81 
 
 
488 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.628932 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1269  MmgE/PrpD  32.93 
 
 
463 aa  120  4.9999999999999996e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0407  MmgE/PrpD family protein  32.64 
 
 
456 aa  120  4.9999999999999996e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.544537 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0206  MmgE/PrpD family protein  30.64 
 
 
449 aa  120  4.9999999999999996e-26  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0883  MmgE/PrpD family protein  32.39 
 
 
481 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.585439  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4177  MmgE/PrpD family protein  35.46 
 
 
441 aa  118  3e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1204  MmgE/PrpD family protein  28.85 
 
 
449 aa  117  6e-25  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2745  hypothetical protein  30.73 
 
 
482 aa  116  6.9999999999999995e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.183054 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2858  MmgE/PrpD  34.94 
 
 
450 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.428685 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1347  MmgE/PrpD family protein  38.16 
 
 
458 aa  113  8.000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_43263  hypothetical protein  29.73 
 
 
481 aa  112  9e-24  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0482  MmgE/PrpD family protein  29.54 
 
 
457 aa  112  1.0000000000000001e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3107  MmgE/PrpD family protein  32.26 
 
 
447 aa  110  5e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.367847  normal  0.515928 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1583  MmgE/PrpD family protein  26.95 
 
 
446 aa  109  9.000000000000001e-23  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0286  putative MmgE/PrpD family protein  29.7 
 
 
481 aa  109  9.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.522372  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1394  MmgE/PrpD family protein  27 
 
 
446 aa  109  1e-22  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0615722  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1760  MmgE/PrpD family protein  34.11 
 
 
445 aa  107  5e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0281  MmgE/PrpD family protein  27.57 
 
 
446 aa  107  6e-22  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6206  MmgE/PrpD family protein  30.95 
 
 
451 aa  105  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4091  hypothetical protein  31.48 
 
 
451 aa  105  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.42622  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0564  MmgE/PrpD family protein  35.76 
 
 
454 aa  103  6e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.626803  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1932  MmgE/PrpD family protein  32.84 
 
 
467 aa  102  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1510  MmgE/PrpD  30.71 
 
 
449 aa  102  1e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6463  MmgE/PrpD family protein  31.09 
 
 
458 aa  102  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.672209  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6170  MmgE/PrpD family protein  30.83 
 
 
458 aa  102  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0705  MmgE/PrpD  34.67 
 
 
458 aa  97.4  4e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0496  MmgE/PrpD family protein  31.79 
 
 
461 aa  97.8  4e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01619  conserved hypothetical protein  29.04 
 
 
501 aa  97.1  6e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.17235 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1168  MmgE/PrpD family protein  28.76 
 
 
456 aa  97.1  6e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.171281 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5368  hypothetical protein  35.88 
 
 
451 aa  96.7  8e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.775637  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4085  MmgE/PrpD family protein  32.49 
 
 
476 aa  96.3  9e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3512  MmgE/PrpD family protein  31.65 
 
 
453 aa  95.9  1e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.208219  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0146  MmgE/PrpD  34.55 
 
 
457 aa  96.3  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0614  MmgE/PrpD family protein  29.82 
 
 
470 aa  95.5  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.708965  normal  0.0263157 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0971  hypothetical protein  30.77 
 
 
471 aa  95.5  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.226989  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5792  MmgE/PrpD family protein  28.43 
 
 
461 aa  95.5  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.205473  normal  0.299026 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4443  MmgE/PrpD family protein  31.28 
 
 
464 aa  95.5  2e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.945637 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3047  MmgE/PrpD family protein  29.79 
 
 
449 aa  94.7  3e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.110565  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1882  MmgE/PrpD family protein  34.45 
 
 
443 aa  94  4e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0367  MmgE/PrpD  34.43 
 
 
455 aa  94  5e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.559091  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4983  MmgE/PrpD family protein  32.26 
 
 
486 aa  93.2  9e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.33687  normal  0.0207357 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1260  putative MmgE/Prp family protein  32.84 
 
 
503 aa  91.7  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2428  MmgE/PrpD  32.42 
 
 
404 aa  91.7  2e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0639632  normal  0.19006 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5808  MmgE/PrpD  32.73 
 
 
463 aa  92  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6172  MmgE/PrpD family protein  32.73 
 
 
464 aa  92.4  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.661576  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4958  MmgE/PrpD family protein  30.34 
 
 
464 aa  91.7  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0016  hypothetical protein  33.89 
 
 
456 aa  92  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3028  MmgE/PrpD family protein  32.84 
 
 
503 aa  91.7  3e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6849  MmgE/PrpD family protein  24.63 
 
 
460 aa  90.9  4e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6625  MmgE/PrpD family protein  34.68 
 
 
447 aa  91.3  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.977782 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2225  MmgE/PrpD family protein  32.46 
 
 
503 aa  90.5  6e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3985  MmgE/PrpD family protein  31.94 
 
 
450 aa  90.1  7e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52880  hypothetical protein  31.56 
 
 
450 aa  90.1  7e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4633  hypothetical protein  31.89 
 
 
450 aa  90.1  8e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.992935  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4189  MmgE/PrpD  30.09 
 
 
481 aa  89  1e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.127966  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0172  MmgE/PrpD family protein  32.51 
 
 
451 aa  89  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18590  uncharacterized protein involved in propionate catabolism  33.24 
 
 
465 aa  89  2e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4086  hypothetical protein  29.08 
 
 
470 aa  88.2  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0200  MmgE/PrpD family protein  33.33 
 
 
454 aa  87.8  3e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2736  MmgE/PrpD  33.13 
 
 
460 aa  86.7  8e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0581  MmgE/PrpD  32.82 
 
 
462 aa  85.9  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6810  MmgE/PrpD family protein  25.06 
 
 
460 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0134  MmgE/PrpD family protein  32.4 
 
 
454 aa  85.5  0.000000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.99136  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3608  MmgE/PrpD family protein  29.43 
 
 
468 aa  85.1  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.351268  normal  0.839729 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6148  MmgE/PrpD family protein  32.52 
 
 
442 aa  84.3  0.000000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.984063  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6631  MmgE/PrpD family protein  31.86 
 
 
468 aa  84  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0359328  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1910  hypothetical protein  30.07 
 
 
451 aa  84.3  0.000000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6601  MmgE/PrpD family protein  30.2 
 
 
462 aa  83.6  0.000000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.148689 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1242  MmgE/PrpD family protein  33.9 
 
 
458 aa  83.2  0.000000000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.424636  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3540  MmgE/PrpD  32.23 
 
 
457 aa  82.4  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.10861  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3898  hypothetical protein  33.04 
 
 
459 aa  82.8  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.125384  normal  0.388647 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1311  MmgE/PrpD family protein  29.76 
 
 
454 aa  82.4  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001534  MmgE/PrpD family protein  26.18 
 
 
453 aa  82  0.00000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7303  MmgE/PrpD  35.17 
 
 
474 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.148027  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4513  MmgE/PrpD family protein  27.72 
 
 
460 aa  80.9  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0208736  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2657  MmgE/PrpD  30.56 
 
 
504 aa  81.3  0.00000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>