More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_4258 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_4258  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 
93 aa  188  2e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2266  transposase IS3/IS911 family protein  66.67 
 
 
92 aa  127  4.0000000000000003e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.101056  hitchhiker  0.00760837 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4160  transposase IS3/IS911 family protein  66.67 
 
 
92 aa  127  4.0000000000000003e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3134  transposase IS3/IS911 family protein  66.67 
 
 
92 aa  127  4.0000000000000003e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0388  transposase IS3/IS911 family protein  66.67 
 
 
92 aa  127  4.0000000000000003e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2029  transposase IS3/IS911 family protein  66.67 
 
 
92 aa  127  4.0000000000000003e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0100049  normal  0.0526351 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0609  transposase IS3/IS911 family protein  66.67 
 
 
92 aa  127  4.0000000000000003e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02980  ISxac3 transposase  65.12 
 
 
90 aa  122  2e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02989  ISxac3 transposase  65.12 
 
 
90 aa  122  2e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5456  transposase DNA binding site ISRme11  65.12 
 
 
90 aa  121  3e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0552744  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5496  transposase DNA binding site ISRme11  65.12 
 
 
90 aa  121  3e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2065  ISEhe3, transposase orfA  65.91 
 
 
92 aa  119  9.999999999999999e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000139393  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1785  transposase IS3/IS911 family protein  63.95 
 
 
90 aa  118  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.496155 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1845  transposase IS3/IS911 family protein  64.52 
 
 
92 aa  119  1.9999999999999998e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1532  transposase IS3/IS911 family protein  67.74 
 
 
92 aa  117  4.9999999999999996e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3180  transposase IS3/IS911 family protein  67.74 
 
 
92 aa  117  4.9999999999999996e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2219  transposase IS3/IS911 family protein  67.74 
 
 
92 aa  117  4.9999999999999996e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0280  ISEhe3, transposase orfA  64.77 
 
 
92 aa  117  7.999999999999999e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0142  ISEhe3, transposase orfA  64.77 
 
 
92 aa  117  7.999999999999999e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000709796  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1261  ISEhe3, transposase orfA  64.77 
 
 
92 aa  117  7.999999999999999e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.046815  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2789  ISEhe3, transposase orfA  64.77 
 
 
92 aa  117  7.999999999999999e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.013431  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0346  ISEhe3, transposase orfA  64.77 
 
 
92 aa  117  7.999999999999999e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0509042  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0325  ISEhe3, transposase orfA  64.77 
 
 
92 aa  117  7.999999999999999e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.196335  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1990  ISEhe3, transposase orfA  64.77 
 
 
92 aa  117  7.999999999999999e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000327529  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0436  ISEhe3, transposase orfA  64.77 
 
 
92 aa  117  7.999999999999999e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3022  ISEhe3, transposase orfA  64.77 
 
 
92 aa  117  7.999999999999999e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00292237  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4530  ISEhe3, transposase orfA  64.77 
 
 
92 aa  117  7.999999999999999e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.66022  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3971  ISEhe3, transposase orfA  64.77 
 
 
92 aa  117  7.999999999999999e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000376066  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1348  transposase and inactivated derivatives  65.91 
 
 
92 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2340  transposase IS3/IS911 family protein  62.5 
 
 
92 aa  114  3e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2972  transposase IS3/IS911 family protein  70.11 
 
 
92 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.908697  normal  0.454882 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1613  transposase IS3/IS911 family protein  70.11 
 
 
92 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.354884 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5424  transposase IS3/IS911 family protein  70.11 
 
 
92 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.175663  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3805  transposase IS3/IS911 family protein  70.11 
 
 
92 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4424  transposase IS3/IS911 family protein  60.47 
 
 
97 aa  114  5e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0891  transposase IS3/IS911 family protein  60.47 
 
 
97 aa  114  5e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.444213  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4708  transposase IS3/IS911 family protein  60.47 
 
 
90 aa  114  6e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.879601  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2664  transposase IS3/IS911 family protein  67.86 
 
 
91 aa  111  3e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.916109  normal  0.368485 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0684  transposase IS3/IS911 family protein  67.86 
 
 
91 aa  111  3e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0860261  normal  0.453264 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0563  transposase IS3/IS911 family protein  67.86 
 
 
91 aa  111  3e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0378467  normal  0.24313 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2459  ISxac3 transposase  61.18 
 
 
97 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.687563  normal  0.393971 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0645  ISxac3 transposase  61.18 
 
 
97 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1672  transposase IS3/IS911 family protein  58.62 
 
 
383 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1877  transposase, putative  59.3 
 
 
92 aa  106  1e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.350595  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3407  transposase IS3/IS911 family protein  61.73 
 
 
118 aa  103  7e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1548  transposase  63.95 
 
 
95 aa  103  9e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.34059 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03535  predicted IS protein  59.76 
 
 
118 aa  102  1e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.924615  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4444  transposase family protein  69.62 
 
 
84 aa  102  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.327316  hitchhiker  0.0000409011 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03480  hypothetical protein  59.76 
 
 
118 aa  102  1e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.707856  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3340  transposase IS3/IS911 family protein  59.76 
 
 
112 aa  100  6e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0763009  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4074  transposase IS3/IS911 family protein  59.3 
 
 
90 aa  99  2e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.96414  normal  0.0736148 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00503  hypothetical protein  61.11 
 
 
73 aa  99.4  2e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00509  hypothetical protein  61.11 
 
 
73 aa  99.4  2e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0581653  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2465  transposase IS3/IS911 family protein  60.49 
 
 
78 aa  92.8  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.208677  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3405  transposase IS3/IS911 family protein  54.55 
 
 
94 aa  92.4  2e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0733  transposase IS3/IS911 family protein  54.55 
 
 
94 aa  92.4  2e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.903269  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0361  transposase IS3/IS911 family protein  54.55 
 
 
94 aa  92.4  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0158  transposase IS3/IS911 family protein  54.55 
 
 
94 aa  92.4  2e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0419  transposase IS3/IS911 family protein  64.86 
 
 
78 aa  88.6  3e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2359  transposase IS3/IS911 family protein  53.09 
 
 
81 aa  87.4  5e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000764898  decreased coverage  0.000016732 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3390  transposase IS3/IS911 family protein  50 
 
 
94 aa  80.9  0.000000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3919  transposase IS3/IS911 family protein  51.95 
 
 
122 aa  76.6  0.0000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.663613 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0569  hypothetical protein  41.41 
 
 
97 aa  76.3  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0185  hypothetical protein  41.41 
 
 
97 aa  73.9  0.0000000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0197  hypothetical protein  41.41 
 
 
97 aa  73.9  0.0000000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1110  hypothetical protein  41.41 
 
 
97 aa  73.9  0.0000000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1577  hypothetical protein  41.41 
 
 
97 aa  73.9  0.0000000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1584  hypothetical protein  41.41 
 
 
97 aa  73.9  0.0000000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2846  transposase IS3/IS911 family protein  43.33 
 
 
96 aa  73.6  0.000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01552  transposase, IS911  41.24 
 
 
97 aa  71.6  0.000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.617213  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03752  transposase, IS911  41.24 
 
 
97 aa  71.6  0.000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02080  transposase, IS911  41.24 
 
 
97 aa  71.6  0.000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0106  transposase IS3/IS911  46.67 
 
 
99 aa  70.5  0.000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3811  transposase IS3/IS911  46.67 
 
 
99 aa  70.5  0.000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000498909 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3713  transposase IS3/IS911 family protein  43.62 
 
 
102 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal  0.0736019 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2893  transposase IS3/IS911 family protein  43.62 
 
 
102 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1847  putative transposase  47.19 
 
 
95 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.618339  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2086  putative transposase  47.19 
 
 
95 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.359957  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2543  putative transposase  47.19 
 
 
95 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.379172  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2734  putative IS3 transposase OrfA  47.19 
 
 
95 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0333986 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3566  putative transposase  47.19 
 
 
95 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0132  transposase  47.19 
 
 
95 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0635  putative transposase  47.19 
 
 
95 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0996397  normal  0.0589487 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0401  transposase IS3/IS911 family protein  45.16 
 
 
100 aa  68.2  0.00000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4363  transposase IS3/IS911 family protein  45.56 
 
 
97 aa  66.6  0.0000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2066  transposase IS3/IS911 family protein  42.27 
 
 
97 aa  66.2  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0227853  normal  0.584452 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3814  transposase IS3/IS911 family protein  43.48 
 
 
98 aa  65.1  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.339406 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5317  transposase IS3/IS911 family protein  43.48 
 
 
98 aa  65.1  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3927  transposase IS3/IS911 family protein  43.48 
 
 
98 aa  65.1  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.180463 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5972  transposase DNA binding site ISRme3  43.48 
 
 
98 aa  65.1  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.263153  normal  0.0380102 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6073  transposase DNA binding site ISRme3  43.48 
 
 
98 aa  65.1  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.391676 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0030  transposase IS3/IS911  43.48 
 
 
99 aa  65.1  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1613  transposase IS3/IS911  43.48 
 
 
98 aa  65.1  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.322008  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3349  transposase IS3/IS911  43.48 
 
 
98 aa  65.1  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3770  transposase DNA binding site ISRme3  43.48 
 
 
98 aa  65.1  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3943  transposase DNA binding site ISRme3  43.48 
 
 
98 aa  65.1  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.352485 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4658  transposase DNA binding site ISRme3  43.48 
 
 
98 aa  65.1  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5453  transposase DNA binding site ISRme3  43.48 
 
 
98 aa  65.1  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5680  transposase DNA binding site ISRme3  43.48 
 
 
98 aa  65.1  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1297  hypothetical protein  41.3 
 
 
95 aa  64.7  0.0000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>