80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_2880 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_2880  hypothetical protein  100 
 
 
121 aa  248  2e-65  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.476591  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0019  hypothetical protein  58.82 
 
 
124 aa  130  3.9999999999999996e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.816073  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0698  hypothetical protein  57.14 
 
 
128 aa  130  5e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000671001  normal  0.0854698 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1412  hypothetical protein  43.8 
 
 
119 aa  96.7  9e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.104355 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7090  hypothetical protein  42.97 
 
 
122 aa  85.9  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0296196  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5064  hypothetical protein  40.68 
 
 
119 aa  85.1  3e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.939937  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3600  hypothetical protein  37.39 
 
 
119 aa  82.4  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.265041  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0363  hypothetical protein  41.38 
 
 
122 aa  80.9  0.000000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07570  hypothetical protein  36.89 
 
 
120 aa  79.7  0.00000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3018  hypothetical protein  39.83 
 
 
123 aa  76.6  0.00000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0560  CoA-binding domain protein  35.96 
 
 
129 aa  69.3  0.00000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.89222  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1777  CoA-binding domain protein  31.3 
 
 
124 aa  63.9  0.0000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2600  CoA-binding domain protein  32.48 
 
 
130 aa  60.5  0.000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00073882  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0652  CoA-binding domain protein  34 
 
 
131 aa  58.2  0.00000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000133994  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2077  CoA-binding protein  26.96 
 
 
126 aa  56.6  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1015  CoA-binding domain protein  28.32 
 
 
131 aa  55.1  0.0000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1330  hypothetical protein  30.84 
 
 
139 aa  53.9  0.0000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0669  hypothetical protein  31.25 
 
 
133 aa  52.8  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1289  CoA-binding domain-containing protein  32.69 
 
 
151 aa  52.4  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.490777  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0653  hypothetical protein  31.18 
 
 
133 aa  51.6  0.000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0607  CoA-binding protein  33.33 
 
 
136 aa  50.8  0.000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2330  CoA-binding domain-containing protein  28.32 
 
 
140 aa  50.4  0.000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0624  CoA-binding domain protein  26.79 
 
 
132 aa  50.1  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2248  CoA-binding domain-containing protein  28.57 
 
 
137 aa  48.1  0.00004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000439003  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0217  CoA-binding protein  27.43 
 
 
134 aa  48.1  0.00004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0658  CoA-binding domain-containing protein  27.12 
 
 
125 aa  47.4  0.00006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00210865  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0758  CoA-binding domain-containing protein  26.32 
 
 
123 aa  47  0.00009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1655  CoA-binding protein  27.43 
 
 
134 aa  46.6  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000297514  normal  0.67582 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2493  CoA-binding domain-containing protein  37.04 
 
 
152 aa  47  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.244493  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0079  CoA-binding domain protein  29.13 
 
 
145 aa  46.2  0.0001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0987  CoA-binding domain-containing protein  28.32 
 
 
143 aa  45.8  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0651  CoA-binding domain-containing protein  26.47 
 
 
145 aa  45.8  0.0002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0196  CoA-binding domain-containing protein  31.25 
 
 
140 aa  45.4  0.0002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0111004  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1445  CoA-binding domain-containing protein  27.12 
 
 
136 aa  45.1  0.0003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2559  CoA-binding domain protein  28.45 
 
 
139 aa  45.1  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2396  CoA-binding  30.38 
 
 
138 aa  44.7  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.972486  normal  0.74538 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2358  CoA-binding domain-containing protein  36.92 
 
 
138 aa  44.7  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1327  CoA-binding domain-containing protein  24.35 
 
 
131 aa  44.7  0.0004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000352253  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1616  CoA-binding domain protein  28.45 
 
 
139 aa  44.7  0.0005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000180037  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3640  CoA-binding domain protein  28.74 
 
 
140 aa  44.3  0.0006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.491101  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3916  putative acetyl-CoA synthetase  36.84 
 
 
703 aa  44.3  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.991862 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4017  CoA-binding domain-containing protein  27.43 
 
 
132 aa  43.9  0.0007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00796943  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3784  CoA-binding domain-containing protein  33.75 
 
 
144 aa  43.9  0.0007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0803  CoA-binding domain protein  35 
 
 
139 aa  43.1  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.628448 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1479  CoA-binding domain protein  34.33 
 
 
134 aa  43.5  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.338285 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3421  CoA-binding domain protein  29.49 
 
 
690 aa  42.4  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.678339  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2934  CoA-binding domain-containing protein  34.18 
 
 
139 aa  42.7  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00216233 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1687  hypothetical protein  34.57 
 
 
150 aa  42.4  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.863027  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0725  CoA-binding domain-containing protein  27.5 
 
 
139 aa  42.4  0.002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000000455945 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2827  hypothetical protein  30.77 
 
 
133 aa  42.7  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0856697 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1630  CoA-binding domain protein  27.97 
 
 
137 aa  42.7  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2421  CoA-binding  35.8 
 
 
130 aa  42.7  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000330878  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0272  CoA-binding domain protein  28.85 
 
 
136 aa  42  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3618  CoA-binding domain-containing protein  29.75 
 
 
137 aa  41.6  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000227272  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3625  CoA binding domain family protein  29.75 
 
 
137 aa  41.6  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000648968  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3286  CoA-binding domain-containing protein  36.84 
 
 
137 aa  41.6  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.120452  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1988  CoA-binding domain-containing protein  29.66 
 
 
140 aa  42  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.370858  normal  0.185314 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1359  CoA-binding domain-containing protein  27.55 
 
 
131 aa  42  0.003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00343617  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1608  CoA binding domain family protein  37.68 
 
 
137 aa  41.2  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000441527  hitchhiker  0.00000000000716402 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1097  CoA-binding domain-containing protein  32.05 
 
 
702 aa  41.2  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0866  CoA-binding domain-containing protein  34.48 
 
 
144 aa  41.6  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.226245  normal  0.636529 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3610  CoA binding domain family protein  38.46 
 
 
137 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5882599999999998e-27 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3356  CoA-binding domain-containing protein  38.46 
 
 
137 aa  41.2  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000642937  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3306  CoA-binding domain-containing protein  38.46 
 
 
137 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.007751  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1828  hypothetical protein  23.01 
 
 
122 aa  41.2  0.005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3507  CoA-binding domain-containing protein  26.79 
 
 
134 aa  41.2  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000684153  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3707  CoA binding domain family protein  38.46 
 
 
137 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000701886  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2868  CoA-binding domain-containing protein  27.72 
 
 
149 aa  40.8  0.006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000106484  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3341  CoA-binding domain-containing protein  26.85 
 
 
140 aa  40.8  0.006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.125699  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2052  CoA-binding  33.75 
 
 
154 aa  40.8  0.006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1477  CoA-binding domain-containing protein  34.33 
 
 
137 aa  40.4  0.007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3659  CoA-binding domain-containing protein  36.23 
 
 
137 aa  40.8  0.007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000120048  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3103  hypothetical protein  30.49 
 
 
194 aa  40.4  0.007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.210422  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3394  CoA-binding domain-containing protein  36.23 
 
 
137 aa  40.8  0.007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0763288  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4331  CoA-binding domain-containing protein  26.83 
 
 
182 aa  40.4  0.008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.282355 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0937  CoA-binding domain-containing protein  31.17 
 
 
153 aa  40.4  0.008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.962686  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4367  pimeloyl-CoA synthetase  29.41 
 
 
715 aa  40  0.01  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.589266  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00976  hypothetical protein  33.33 
 
 
137 aa  40  0.01  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.688177  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2153  putative CoA-binding protein  34.33 
 
 
137 aa  40  0.01  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.191615  normal  0.321485 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00969  predicted CoA-binding protein with NAD(P)-binding Rossmann-fold domain  33.33 
 
 
137 aa  40  0.01  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.480259  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>