42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_2250 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_2250  hypothetical protein  100 
 
 		 219 aa  434  1e-121  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.599567  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1394  hypothetical protein  56.64 
 
 		 325 aa  130  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2706  hypothetical protein  50.3 
 
 		 208 aa  129  4.0000000000000003e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.5213  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2072  hypothetical protein  45.64 
 
 		 214 aa  119  3e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0631434 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0697  hypothetical protein  38.46 
 
 		 439 aa  90.1  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.261572  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0574  hypothetical protein  36.44 
 
 		 176 aa  76.6  0.0000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1187  hypothetical protein  37.17 
 
 		 169 aa  69.3  0.00000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2646  hypothetical protein  35.4 
 
 		 180 aa  62  0.000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.549676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3107  hypothetical protein  30.22 
 
 		 182 aa  60.5  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1511  hypothetical protein  31.4 
 
 		 255 aa  58.5  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2566  hypothetical protein  29.7 
 
 		 253 aa  56.6  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.348776 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1126  hypothetical protein  28.21 
 
 		 267 aa  56.6  0.0000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.577564  normal  0.803766 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2838  hypothetical protein  26.72 
 
 		 238 aa  55.8  0.0000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1388  hypothetical protein  26.89 
 
 		 266 aa  54.7  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0881994  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3782  hypothetical protein  27.12 
 
 		 259 aa  53.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4418  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  26.89 
 
 		 254 aa  53.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1942  FlaA locus 229 kDa protein  31.25 
 
 		 243 aa  52.8  0.000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0030  hypothetical protein  28.38 
 
 		 177 aa  52.4  0.000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1688  hypothetical protein  31.5 
 
 		 192 aa  52.4  0.000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1688  hypothetical protein  26.55 
 
 		 255 aa  50.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0687483  normal  0.086166 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0415  hypothetical protein  30.77 
 
 		 169 aa  49.7  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0058  hypothetical protein  32.73 
 
 		 170 aa  48.5  0.00008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.202005 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2950  hypothetical protein  29.12 
 
 		 205 aa  48.5  0.00009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.283763 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16840  hypothetical protein  32.29 
 
 		 176 aa  48.5  0.00009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4183  hypothetical protein  27.52 
 
 		 205 aa  47.8  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1436  hypothetical protein  29.31 
 
 		 258 aa  47  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.860283 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0818  hypothetical protein  30.47 
 
 		 286 aa  47  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0307205 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0261  hypothetical protein  28.85 
 
 		 179 aa  46.2  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.74612  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0355  putative exported flagella related protein  25.23 
 
 		 180 aa  46.2  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.900636  normal  0.0456506 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2113  hypothetical protein  26.36 
 
 		 207 aa  45.8  0.0005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.517967  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3431  hypothetical protein  27.66 
 
 		 179 aa  45.4  0.0006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3650  hypothetical protein  32.32 
 
 		 194 aa  45.8  0.0006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.122164  normal  0.805453 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0743  hypothetical protein  25.93 
 
 		 189 aa  45.4  0.0006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.634607  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4202  hypothetical protein  29.46 
 
 		 310 aa  45.4  0.0007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0193396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1100  hypothetical protein  29.27 
 
 		 241 aa  45.1  0.0009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.370505  normal  0.545096 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1669  hypothetical protein  31.9 
 
 		 172 aa  44.7  0.001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1488  hypothetical protein  31.9 
 
 		 172 aa  44.7  0.001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4717  hypothetical protein  26.05 
 
 		 295 aa  43.1  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0194174  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3917  hypothetical protein  31.73 
 
 		 164 aa  42.4  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0470843 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1844  hypothetical protein  31.03 
 
 		 172 aa  42.4  0.006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0323  putative exported flagella related protein  24.82 
 
 		 179 aa  42  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.547505  normal  0.420326 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3833  hypothetical protein  29.17 
 
 		 164 aa  41.6  0.008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>