33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0979 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_0979  DoxX family protein  100 
 
 
159 aa  317  5e-86  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1514  DoxX family protein  47.26 
 
 
167 aa  139  1.9999999999999998e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0337781  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0575  DoxX family protein  39.53 
 
 
145 aa  94  7e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000405751  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0588  DoxX family protein  38.28 
 
 
145 aa  91.7  4e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000825958 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0506  methylamine utilization protein MauE, putative  39.68 
 
 
138 aa  91.7  4e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3019  methylamine utilization protein MauE, putative  38.1 
 
 
138 aa  88.2  4e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000103678  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3921  DoxX family protein  41.35 
 
 
146 aa  87  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.191374  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1657  DoxX family protein  32.45 
 
 
153 aa  76.6  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.223819 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2522  methylamine utilization protein MauE, putative  36.59 
 
 
140 aa  75.5  0.0000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000286743  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3388  DoxX family protein  36.21 
 
 
140 aa  73.9  0.0000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0577115 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0032  DoxX  38.46 
 
 
151 aa  67.4  0.00000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0381  DoxX family protein  36.13 
 
 
142 aa  65.5  0.0000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0203292  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0564  methylamine utilisation MauE  33.33 
 
 
186 aa  63.5  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0914  DoxX  31.73 
 
 
188 aa  61.6  0.000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.491535  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2885  DoxX family protein  36.73 
 
 
161 aa  59.7  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1352  DoxX family protein  29.61 
 
 
161 aa  58.2  0.00000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1352  DoxX family protein  39.82 
 
 
154 aa  58.2  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.438565  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2942  hypothetical protein  29.63 
 
 
192 aa  56.2  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.161849  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1173  hypothetical protein  32.9 
 
 
158 aa  54.7  0.0000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.744688 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1453  DoxX family protein  30.08 
 
 
188 aa  54.7  0.0000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0549  methylamine utilisation MauE  26.32 
 
 
188 aa  52.8  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.340856  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2339  putative methylamine utilization protein MauE  31.62 
 
 
179 aa  50.1  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5633  DoxX family protein  28.16 
 
 
228 aa  49.3  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2872  DoxX family protein  33.04 
 
 
228 aa  49.3  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000635517  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1011  DoxX family protein  30.71 
 
 
174 aa  48.9  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.108746  normal  0.342339 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1059  DoxX family protein  28.57 
 
 
173 aa  47.8  0.00006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0275169 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1121  DoxX family protein  28.57 
 
 
174 aa  45.1  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.899235 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1676  DoxX family protein  31.06 
 
 
167 aa  45.1  0.0004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5464  DoxX family protein  28.68 
 
 
362 aa  44.7  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000243236  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4185  hypothetical protein  30.09 
 
 
178 aa  42.4  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00204807 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0556  DoxX family protein  36.61 
 
 
166 aa  42  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.248301  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2785  hypothetical protein  33.33 
 
 
97 aa  42.4  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0310206  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3819  hypothetical protein  31.19 
 
 
180 aa  40.8  0.008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.931026  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>