More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_1685 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010424  Daud_1685  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  100 
 
 		 342 aa  696    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0260  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  64.71 
 
 		 327 aa  441  1e-123  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0305  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  60.77 
 
 		 342 aa  442  1e-123  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2182  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  62.94 
 
 		 340 aa  439  9.999999999999999e-123  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4443  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  64.67 
 
 		 336 aa  433  1e-120  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0141  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  64.41 
 
 		 340 aa  431  1e-120  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.215848 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4443  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  62.57 
 
 		 336 aa  425  1e-118  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4288  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  62.28 
 
 		 336 aa  422  1e-117  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.954612  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4138  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  60.24 
 
 		 330 aa  422  1e-117  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000244942 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4425  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  62.28 
 
 		 336 aa  423  1e-117  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1704  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  62.65 
 
 		 340 aa  419  1e-116  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00817913  normal  0.680282 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0307  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  61.18 
 
 		 339 aa  417  9.999999999999999e-116  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2884  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  60.88 
 
 		 341 aa  412  1e-114  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.543075  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3680  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  58.11 
 
 		 341 aa  412  1e-114  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00834015  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4468  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  57.52 
 
 		 337 aa  410  1e-113  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3035  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  53.45 
 
 		 362 aa  410  1e-113  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0956  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  61.34 
 
 		 344 aa  404  1.0000000000000001e-112  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.417373  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3346  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  59.65 
 
 		 355 aa  404  1.0000000000000001e-112  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0056  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  57.93 
 
 		 318 aa  402  1e-111  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3273  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  59.89 
 
 		 357 aa  402  1e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0899  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  59.08 
 
 		 355 aa  402  1e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.4439400000000002e-32 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2317  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  58.92 
 
 		 367 aa  399  9.999999999999999e-111  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.150256 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4128  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  52.16 
 
 		 352 aa  400  9.999999999999999e-111  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0972084  hitchhiker  0.00000000618238 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1658  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  56.94 
 
 		 359 aa  397  1e-109  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.548961  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1780  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  58.24 
 
 		 355 aa  397  1e-109  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.629198  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1005  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  55.84 
 
 		 355 aa  394  1e-109  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.610294  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2098  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  57.8 
 
 		 356 aa  395  1e-109  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1375  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  56.47 
 
 		 322 aa  391  1e-108  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2319  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  58.24 
 
 		 353 aa  392  1e-108  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.251448 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1337  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  55.84 
 
 		 322 aa  389  1e-107  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.120656  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1111  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  56.15 
 
 		 322 aa  389  1e-107  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1990  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  57.39 
 
 		 353 aa  389  1e-107  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0338476  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3163  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  57.39 
 
 		 400 aa  390  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4072  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  54.18 
 
 		 323 aa  388  1e-107  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.416009  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2473  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  58.67 
 
 		 358 aa  390  1e-107  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0264  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  57.1 
 
 		 353 aa  390  1e-107  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.850535  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1072  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  53.85 
 
 		 352 aa  389  1e-107  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1852  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  57.39 
 
 		 353 aa  389  1e-107  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.677884  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2753  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  57.39 
 
 		 400 aa  389  1e-107  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.419146  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3105  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  57.39 
 
 		 353 aa  388  1e-107  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.311481  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1269  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  54.49 
 
 		 323 aa  389  1e-107  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.281724  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3141  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  57.39 
 
 		 353 aa  389  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0923  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  57.39 
 
 		 400 aa  389  1e-107  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1911  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  54.44 
 
 		 355 aa  385  1e-106  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0259449 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15920  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  56.82 
 
 		 351 aa  385  1e-106  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0419  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  55.71 
 
 		 350 aa  387  1e-106  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1469  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  56.82 
 
 		 397 aa  387  1e-106  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.793194  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0878  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  56.82 
 
 		 353 aa  385  1e-106  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1298  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  55.52 
 
 		 322 aa  385  1e-106  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000895742 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1136  dTDP-D-glucose 4,6-dehydratase  56.14 
 
 		 360 aa  386  1e-106  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.0311464 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2264  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  58 
 
 		 355 aa  385  1e-106  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4166  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  56.82 
 
 		 361 aa  384  1e-106  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.167438  normal  0.0625555 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2291  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  53.71 
 
 		 349 aa  381  1e-105  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.494545  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2366  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  58.09 
 
 		 358 aa  383  1e-105  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.501885  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14390  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  53.98 
 
 		 356 aa  383  1e-105  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.449381  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1137  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  55.21 
 
 		 322 aa  384  1e-105  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1117  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  54.89 
 
 		 322 aa  382  1e-105  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0565824  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0712  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  57.14 
 
 		 354 aa  383  1e-105  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1230  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  55.21 
 
 		 322 aa  384  1e-105  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2139  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  58.19 
 
 		 356 aa  383  1e-105  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2596  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  56.82 
 
 		 353 aa  384  1e-105  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0389  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  56.66 
 
 		 353 aa  381  1e-105  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0939  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  52.16 
 
 		 348 aa  384  1e-105  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0751  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  57.34 
 
 		 353 aa  384  1e-105  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.143791  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0871  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  56.66 
 
 		 353 aa  381  1e-105  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.83298  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0537  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  56.98 
 
 		 353 aa  383  1e-105  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.433038  normal  0.0400591 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1917  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  53.62 
 
 		 354 aa  379  1e-104  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.20541 
 
 
-
 
NC_002950  PG1560  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  51.86 
 
 		 354 aa  379  1e-104  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0761  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  56.53 
 
 		 353 aa  378  1e-104  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0640  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  57.95 
 
 		 353 aa  380  1e-104  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.151017 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0842  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  56.37 
 
 		 353 aa  380  1e-104  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0136971 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3803  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  56.45 
 
 		 350 aa  379  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1380  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  55.62 
 
 		 356 aa  378  1e-104  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.724349  hitchhiker  0.000724393 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0512  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  53.55 
 
 		 339 aa  375  1e-103  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0682  dTDP-glucose 4,6-dehydratase protein  56.57 
 
 		 354 aa  375  1e-103  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1237  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  55.77 
 
 		 354 aa  377  1e-103  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0516  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  53.14 
 
 		 349 aa  377  1e-103  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2008  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  54.7 
 
 		 366 aa  376  1e-103  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4022  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  55.56 
 
 		 360 aa  377  1e-103  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.535733 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3727  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  55.97 
 
 		 353 aa  376  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1714  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  55.97 
 
 		 353 aa  376  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0619  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  55.97 
 
 		 355 aa  375  1e-103  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.129356 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2232  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  54.35 
 
 		 318 aa  376  1e-103  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2735  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  56.57 
 
 		 354 aa  377  1e-103  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68170  dTDP-D-glucose 4,6-dehydratase  55.65 
 
 		 352 aa  375  1e-103  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0640014  decreased coverage  0.00283529 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5900  dTDP-D-glucose 4,6-dehydratase  55.65 
 
 		 352 aa  375  1e-103  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0553  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  56.13 
 
 		 355 aa  374  1e-102  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1511  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  51.72 
 
 		 351 aa  373  1e-102  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1124  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  54.18 
 
 		 323 aa  371  1e-102  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0644506  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0540  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  55.62 
 
 		 363 aa  372  1e-102  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3969  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  56.09 
 
 		 353 aa  373  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00429727  normal  0.623158 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2653  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  51.8 
 
 		 360 aa  373  1e-102  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0715  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  54.83 
 
 		 353 aa  374  1e-102  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.256455  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1758  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  53.91 
 
 		 355 aa  373  1e-102  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0506683 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4335  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  58.19 
 
 		 349 aa  368  1e-101  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.796314  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0354  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  52.02 
 
 		 348 aa  370  1e-101  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2719  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  55.81 
 
 		 358 aa  370  1e-101  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.719616  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1275  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  55.68 
 
 		 356 aa  370  1e-101  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0752  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  54.99 
 
 		 360 aa  371  1e-101  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3491  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  55.65 
 
 		 354 aa  371  1e-101  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.370229 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>