More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_0145 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_0145  response regulator receiver:tetratricopeptide TPR_4  100 
 
 		 449 aa  918    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4101  response regulator receiver:tetratricopeptide TPR_4  33.75 
 
 		 572 aa  191  2e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1169  two component transcriptional regulator, AraC family  33.43 
 
 		 549 aa  169  8e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0897  response regulator receiver protein  31.53 
 
 		 546 aa  164  4.0000000000000004e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0359  putative PAS/PAC sensor protein  29.57 
 
 		 560 aa  159  8e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0477  response regulator receiver domain-containing protein  31.93 
 
 		 537 aa  158  2e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1854  response regulator receiver domain-containing protein  29.68 
 
 		 549 aa  143  5e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.274781 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2318  response regulator receiver protein  32.2 
 
 		 403 aa  141  3e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4261  response regulator receiver domain-containing protein  30.19 
 
 		 534 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.143411  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1911  response regulator/TPR domain protein  29.1 
 
 		 533 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.014975  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3496  TPR repeat-containing response regulator  29.1 
 
 		 533 aa  131  3e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1458  response regulator receiver protein  31.65 
 
 		 416 aa  129  8.000000000000001e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.893415  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2074  response regulator receiver domain-containing protein  27.73 
 
 		 551 aa  129  2.0000000000000002e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1257  response regulator VieB  30.14 
 
 		 553 aa  123  8e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00784807  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1176  response regulator receiver protein  29.18 
 
 		 540 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4421  response regulator receiver protein  29.97 
 
 		 535 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.763745  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0768  response regulator/TPR domain-containing protein  29.27 
 
 		 535 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1457  response regulator receiver protein  28.67 
 
 		 421 aa  115  2.0000000000000002e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0795  response regulator receiver protein  29.27 
 
 		 535 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.184844 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0809  response regulator receiver protein  29.27 
 
 		 535 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1420  response regulator receiver domain-containing protein  30.14 
 
 		 561 aa  113  8.000000000000001e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3634  response regulator receiver  29.81 
 
 		 587 aa  110  4.0000000000000004e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.351597  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01769  response regulator receiver protein  28.3 
 
 		 561 aa  110  5e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.4688  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2920  response regulator receiver protein  25.4 
 
 		 538 aa  108  2e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0284416  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2578  response regulator receiver protein  29.1 
 
 		 577 aa  108  2e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000176794 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06171  hypothetical protein  29.53 
 
 		 555 aa  107  4e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2579  response regulator receiver protein  28.18 
 
 		 547 aa  107  5e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02197  response regulator receiver protein  26.03 
 
 		 540 aa  101  3e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00179351  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1268  response regulator receiver protein  26.5 
 
 		 513 aa  94.4  4e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01935  Response regulator with TPR repeat  25 
 
 		 546 aa  90.1  7e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0041  response regulator  26.1 
 
 		 535 aa  88.2  3e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01904  CheY-like receiver protein  23.53 
 
 		 533 aa  82.4  0.00000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.466885  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1860  putative response regulator  24.12 
 
 		 432 aa  75.1  0.000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.436307  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3838  response regulator receiver domain-containing protein  37.3 
 
 		 234 aa  73.6  0.000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000539223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2160  two component signal transduction response regulator  28.91 
 
 		 451 aa  69.7  0.00000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000278347  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1377  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  31.37 
 
 		 462 aa  68.9  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.244526  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01026  response regulator  34.15 
 
 		 229 aa  67.4  0.0000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2825  Fis family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 589 aa  67.4  0.0000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.208492  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3106  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  33.33 
 
 		 229 aa  67  0.0000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0954  two component transcriptional regulator  30.71 
 
 		 243 aa  67  0.0000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0817018 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004385  phosphate regulon transcriptional regulatory protein PhoB  34.15 
 
 		 229 aa  67  0.0000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0253  DNA-binding response regulator PhoB  34.15 
 
 		 229 aa  67  0.0000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3269  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  36 
 
 		 467 aa  67  0.0000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.382263 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1041  two component transcriptional regulator  32.52 
 
 		 229 aa  66.6  0.0000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.194422 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3136  phosphate regulon transcriptional regulatory protein PhoB  33.33 
 
 		 229 aa  66.6  0.0000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3276  two component transcriptional regulator  33.33 
 
 		 229 aa  66.6  0.0000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1595  two component transcriptional regulator  30.46 
 
 		 227 aa  66.6  0.0000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.526383  normal  0.570373 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0435  transcriptional regulator PhoB  34.15 
 
 		 229 aa  66.6  0.0000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3302  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  33.33 
 
 		 229 aa  66.6  0.0000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3286  phosphate regulon transcriptional regulatory protein  33.33 
 
 		 230 aa  66.6  0.0000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0413143 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1008  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  33.33 
 
 		 229 aa  66.6  0.0000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00347  DNA-binding response regulator in two-component regulatory system with PhoR (or CreC)  33.33 
 
 		 229 aa  66.2  0.000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3210  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  33.33 
 
 		 229 aa  66.2  0.000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.146413  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0427  transcriptional regulator PhoB  33.33 
 
 		 229 aa  66.2  0.000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3234  transcriptional regulator PhoB  33.33 
 
 		 229 aa  66.2  0.000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.456974  unclonable  0.00000000819474 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0475  transcriptional regulator PhoB  33.33 
 
 		 229 aa  66.2  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1860  two component LuxR family transcriptional regulator  30 
 
 		 235 aa  66.2  0.000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00351  hypothetical protein  33.33 
 
 		 229 aa  66.2  0.000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0318  transcriptional regulator PhoB  33.33 
 
 		 229 aa  66.2  0.000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0429  transcriptional regulator PhoB  33.33 
 
 		 229 aa  66.2  0.000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.283039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0467  transcriptional regulator PhoB  33.33 
 
 		 229 aa  66.2  0.000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2232  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  33.87 
 
 		 227 aa  65.9  0.000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.326614  normal  0.43086 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0454  transcriptional regulator PhoB  33.33 
 
 		 229 aa  65.5  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2915  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  33.33 
 
 		 229 aa  65.9  0.000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0441  transcriptional regulator PhoB  33.33 
 
 		 229 aa  65.9  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.244741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4445  two component transcriptional regulator  30.08 
 
 		 229 aa  65.5  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.14031 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4408  two component transcriptional regulator  35.54 
 
 		 229 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0897949 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0435  transcriptional regulator PhoB  33.33 
 
 		 229 aa  65.5  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.464381  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0947  response regulator receiver protein  20 
 
 		 539 aa  65.5  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00824863  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70790  putative two-component response regulator  32.43 
 
 		 300 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.864147 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0496  transcriptional regulator PhoB  33.33 
 
 		 229 aa  65.5  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05760  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  34.07 
 
 		 235 aa  64.7  0.000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.184852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6138  two-component response regulator PhoB  34.4 
 
 		 229 aa  64.3  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5032  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  34.15 
 
 		 229 aa  64.3  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.330128 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6143  putative two-component response regulator  32.43 
 
 		 300 aa  64.3  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70750  two-component response regulator PhoB  34.4 
 
 		 229 aa  64.3  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1367  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.25 
 
 		 230 aa  63.9  0.000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000177207  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5477  phosphate regulon transcriptional regulatory protein PhoB  34.15 
 
 		 229 aa  63.9  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5320  winged helix family two component transcriptional regulator  33.6 
 
 		 242 aa  63.5  0.000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.023746 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5228  two component transcriptional regulator  33.6 
 
 		 229 aa  63.5  0.000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.661336  normal  0.450139 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0154  two component transcriptional regulator  34.15 
 
 		 229 aa  63.9  0.000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.596099 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1053  two component transcriptional regulator  33.33 
 
 		 229 aa  63.9  0.000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5367  two component transcriptional regulator  33.6 
 
 		 229 aa  63.5  0.000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.400776 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1527  two component transcriptional regulator  22.69 
 
 		 230 aa  63.5  0.000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.255733  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1288  two component transcriptional regulator  31.71 
 
 		 228 aa  63.5  0.000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000000128008  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0867  transcriptional regulator PhoB  31.71 
 
 		 229 aa  63.5  0.000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.437737  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1030  response regulator receiver protein  38.14 
 
 		 117 aa  63.2  0.000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2868  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  30.89 
 
 		 227 aa  63.2  0.000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0808147  normal  0.133304 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5606  two component transcriptional regulator  34.15 
 
 		 229 aa  63.2  0.000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13280  two component transcriptional regulator, winged helix family  26.88 
 
 		 227 aa  63.2  0.000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000536961  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1456  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.03 
 
 		 223 aa  63.2  0.00000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000183373  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0967  response regulator receiver  33.05 
 
 		 229 aa  62.8  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.359698  normal  0.873584 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1714  two component transcriptional regulator, winged helix family  28.21 
 
 		 234 aa  62.8  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.233786  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1453  two component transcriptional regulator  29.92 
 
 		 244 aa  62.8  0.00000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.952418  normal  0.0249242 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4207  two component transcriptional regulator, winged helix family  29.92 
 
 		 247 aa  62.4  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4156  two component transcriptional regulator  33.33 
 
 		 232 aa  62.8  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000307056  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4321  two component transcriptional regulator, winged helix family  29.11 
 
 		 219 aa  62.8  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0131168 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4211  two component transcriptional regulator, winged helix family  29.11 
 
 		 219 aa  62.8  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1378  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  27.05 
 
 		 348 aa  62.8  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00581699  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0761  two component transcriptional regulator  29.27 
 
 		 229 aa  63.2  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.179681 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>