46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_5431 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_5431  outer membrane lipoprotein LolB  100 
 
 		 182 aa  352  1e-96  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3608  putative lipoprotein  56.36 
 
 		 174 aa  159  2e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.341689 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0826  putative lipoprotein  52.66 
 
 		 171 aa  155  4e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.106802  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0897  putative lipoprotein  51.48 
 
 		 171 aa  148  3e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1295  putative lipoprotein  45.98 
 
 		 170 aa  136  2e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.204249 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0901  putative lipoprotein  45.78 
 
 		 170 aa  134  9.999999999999999e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.795029  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4343  putative lipoprotein  45.7 
 
 		 174 aa  133  1.9999999999999998e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.22582  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1658  putative outer membrane lipoprotein  42.35 
 
 		 169 aa  128  4.0000000000000003e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0953  putative outer membrane lipoprotein  54.05 
 
 		 174 aa  110  1.0000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3496  hypothetical protein  38.96 
 
 		 198 aa  99.4  3e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000457128 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3231  hypothetical protein  40.58 
 
 		 174 aa  85.5  4e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.279191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1918  outer membrane lipoprotein LolB  31.85 
 
 		 494 aa  62  0.000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1623  outer membrane lipoprotein LolB  34.26 
 
 		 495 aa  60.1  0.00000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.84859  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0317  outer membrane lipoprotein LolB  32.43 
 
 		 210 aa  48.9  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0182895  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2462  outer membrane lipoprotein LolB  26.53 
 
 		 207 aa  48.9  0.00004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00307032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2068  outer membrane lipoprotein LolB  29.51 
 
 		 207 aa  48.9  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000433771  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0788  outer membrane lipoprotein LolB  33.33 
 
 		 203 aa  47.8  0.00008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0229958  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0291  outer membrane lipoprotein LolB  31.39 
 
 		 204 aa  46.6  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2181  outer membrane lipoprotein LolB  25.85 
 
 		 207 aa  46.6  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.865932  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0344  outer membrane lipoprotein LolB  30.33 
 
 		 207 aa  46.2  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0391337  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3625  outer membrane lipoprotein LolB  29.73 
 
 		 200 aa  45.1  0.0006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2763  outer membrane lipoprotein LolB, putative  39.74 
 
 		 218 aa  43.9  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2383  outer membrane lipoprotein LolB  39.74 
 
 		 218 aa  43.9  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.571518 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1933  outer membrane lipoprotein LolB  36.14 
 
 		 207 aa  44.3  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000607555  normal  0.239463 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1910  outer membrane lipoprotein LolB  33.66 
 
 		 207 aa  43.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0427332  normal  0.728098 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1373  outer membrane lipoprotein LolB  34.94 
 
 		 207 aa  42.7  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  3.52349e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1974  outer membrane lipoprotein LolB  33.66 
 
 		 207 aa  43.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.356364  normal  0.962813 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1916  outer membrane lipoprotein LolB  33.66 
 
 		 207 aa  43.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00275751  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1360  outer membrane lipoprotein LolB  33.66 
 
 		 207 aa  43.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000530906  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1544  outer membrane lipoprotein LolB  33.66 
 
 		 207 aa  43.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0381388  normal  0.080998 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3128  outer membrane lipoprotein LolB  30.41 
 
 		 219 aa  43.5  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000000339408  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0680  outer membrane lipoprotein LolB  30.77 
 
 		 200 aa  43.5  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1854  outer membrane lipoprotein LolB  32.94 
 
 		 206 aa  42.7  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.233451  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3728  Outer membrane lipoprotein LolB  30.34 
 
 		 190 aa  43.5  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.19888 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1690  outer membrane lipoprotein LolB  34.94 
 
 		 207 aa  42.7  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000307213  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01184  outer membrane lipoprotein LolB precursor  34.94 
 
 		 207 aa  42.7  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.21984  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01194  hypothetical protein  34.94 
 
 		 207 aa  42.7  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.148307  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2417  outer membrane lipoprotein LolB  34.94 
 
 		 207 aa  42.7  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00771642  hitchhiker  0.000457793 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1357  outer membrane lipoprotein LolB  34.94 
 
 		 207 aa  42.7  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000990201  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1314  outer membrane lipoprotein LolB  34.94 
 
 		 207 aa  42.7  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000110519  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2339  outer membrane lipoprotein LolB  28.19 
 
 		 203 aa  42.7  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2438  outer membrane lipoprotein LolB  34.94 
 
 		 207 aa  42.7  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000243213  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4131  outer membrane lipoprotein LolB  27.27 
 
 		 211 aa  41.6  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.184636  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0587  outer membrane lipoprotein LolB  26.17 
 
 		 247 aa  41.6  0.006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1988  outer membrane lipoprotein LolB  29 
 
 		 207 aa  41.2  0.008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.253229  hitchhiker  0.00995537 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0587  outer membrane lipoprotein LolB  34.07 
 
 		 210 aa  41.2  0.009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.178798  hitchhiker  0.00290914 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>