More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_0857 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_0857  tyrosyl-tRNA synthetase  100 
 
 
403 aa  818    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.16761  hitchhiker  0.00258196 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0445  tyrosyl-tRNA synthetase  69.62 
 
 
405 aa  583  1.0000000000000001e-165  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3195  tyrosyl-tRNA synthetase  67.59 
 
 
407 aa  556  1e-157  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.135805  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2901  tyrosyl-tRNA synthetase  67.59 
 
 
407 aa  556  1e-157  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1292  tyrosyl-tRNA synthetase  67.93 
 
 
406 aa  546  1e-154  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0925  tyrosyl-tRNA synthetase  64.66 
 
 
398 aa  529  1e-149  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2570  tyrosyl-tRNA synthetase  67.25 
 
 
402 aa  530  1e-149  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.56306  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2067  tyrosyl-tRNA synthetase  62.81 
 
 
418 aa  517  1.0000000000000001e-145  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0567  tyrosyl-tRNA synthetase  57.42 
 
 
415 aa  453  1.0000000000000001e-126  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2102  tyrosyl-tRNA synthetase  57.35 
 
 
415 aa  452  1.0000000000000001e-126  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13831  tyrosyl-tRNA synthetase  54.5 
 
 
415 aa  444  1.0000000000000001e-124  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05611  tyrosyl-tRNA synthetase  58.62 
 
 
408 aa  443  1e-123  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.91787 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17561  tyrosyl-tRNA synthetase  55.83 
 
 
415 aa  443  1e-123  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15151  tyrosyl-tRNA synthetase  54.43 
 
 
412 aa  438  9.999999999999999e-123  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0900  tyrosyl-tRNA synthetase  55.09 
 
 
415 aa  441  9.999999999999999e-123  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15291  tyrosyl-tRNA synthetase  54.43 
 
 
412 aa  437  1e-121  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14901  tyrosyl-tRNA synthetase  54.81 
 
 
412 aa  433  1e-120  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1427  tyrosyl-tRNA synthetase  53.45 
 
 
412 aa  415  9.999999999999999e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.265915  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1709  tyrosyl-tRNA synthetase  46.17 
 
 
413 aa  357  1.9999999999999998e-97  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000941896  normal  0.172619 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2388  tyrosyl-tRNA synthetase  44.55 
 
 
406 aa  346  3e-94  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.262104  normal  0.700315 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05700  Tyrosyl-tRNA synthetase  43.87 
 
 
407 aa  345  1e-93  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1034  tyrosyl-tRNA synthetase  45.48 
 
 
413 aa  333  3e-90  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1695  tyrosyl-tRNA synthetase  44.98 
 
 
405 aa  333  4e-90  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00574764  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1647  tyrosyl-tRNA synthetase  42.2 
 
 
407 aa  330  3e-89  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00531566  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2123  tyrosyl-tRNA synthetase  43.6 
 
 
413 aa  327  3e-88  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1110  tyrosine--tRNA ligase  44.36 
 
 
438 aa  327  3e-88  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000317082  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2405  tyrosyl-tRNA synthetase  45.6 
 
 
400 aa  324  2e-87  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.00000233958  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1811  tyrosyl-tRNA synthetase  41.87 
 
 
412 aa  322  7e-87  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000303004  normal  0.076359 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1490  tyrosyl-tRNA synthetase  42.96 
 
 
404 aa  321  9.999999999999999e-87  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3822  tyrosyl-tRNA synthetase  41.52 
 
 
404 aa  320  1.9999999999999998e-86  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1368  tyrosyl-tRNA synthetase  42.93 
 
 
432 aa  319  5e-86  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0107166  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1139  tyrosyl-tRNA synthetase  42.12 
 
 
403 aa  319  7e-86  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.147435  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0761  tyrosyl-tRNA synthetase  41.26 
 
 
402 aa  318  1e-85  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000977983  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002596  tyrosyl-tRNA synthetase  43.92 
 
 
395 aa  318  1e-85  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000034927  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1919  tyrosyl-tRNA synthetase  41.98 
 
 
399 aa  317  2e-85  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.0000583253  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0271  tyrosyl-tRNA synthetase  41.98 
 
 
399 aa  317  3e-85  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000653604  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3310  tyrosyl-tRNA synthetase  42.4 
 
 
404 aa  317  3e-85  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0899529  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3502  tyrosyl-tRNA synthetase  40.93 
 
 
401 aa  315  9.999999999999999e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00208085  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0886  tyrosyl-tRNA synthetase  43.46 
 
 
396 aa  314  9.999999999999999e-85  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000451813  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0442  tyrosyl-tRNA synthetase  45.7 
 
 
401 aa  314  1.9999999999999998e-84  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000185644  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0459  tyrosyl-tRNA synthetase  45.24 
 
 
396 aa  314  1.9999999999999998e-84  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000000135795  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0697  tyrosyl-tRNA synthetase  42.48 
 
 
400 aa  313  2.9999999999999996e-84  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.00000250226  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0708  tyrosyl-tRNA synthetase  42.86 
 
 
402 aa  313  4.999999999999999e-84  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1307  tyrosyl-tRNA synthetase  40.05 
 
 
395 aa  312  5.999999999999999e-84  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00344765  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0438  tyrosyl-tRNA synthetase  43.98 
 
 
399 aa  312  6.999999999999999e-84  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000725763  normal  0.0537593 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0496  tyrosyl-tRNA synthetase  41.87 
 
 
392 aa  311  1e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.182891  normal  0.219144 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1949  tyrosyl-tRNA synthetase  42.34 
 
 
398 aa  311  1e-83  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000101397  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3050  tyrosyl-tRNA synthetase  40.99 
 
 
398 aa  310  2.9999999999999997e-83  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000057737  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0476  tyrosyl-tRNA synthetase  43.83 
 
 
413 aa  308  8e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.209364  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0457  tyrosyl-tRNA synthetase  45.16 
 
 
401 aa  308  8e-83  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000997958  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1102  tyrosyl-tRNA synthetase  41.13 
 
 
403 aa  308  9e-83  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0362281  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03412  tyrosyl-tRNA synthetase  42.67 
 
 
395 aa  307  2.0000000000000002e-82  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0502  tyrosyl-tRNA synthetase  42.52 
 
 
403 aa  306  3e-82  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0017509  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1585  tyrosyl-tRNA synthetase  42.18 
 
 
410 aa  306  4.0000000000000004e-82  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0249853  normal  0.548234 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0809  tyrosyl-tRNA synthetase  42.51 
 
 
399 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.00020616  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0372  tyrosyl-tRNA synthetase  42.48 
 
 
421 aa  305  1.0000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0970  tyrosyl-tRNA synthetase  41.52 
 
 
403 aa  305  1.0000000000000001e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000274252  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4727  tyrosyl-tRNA synthetase  41.53 
 
 
399 aa  303  2.0000000000000002e-81  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.964495  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0425  tyrosyl-tRNA synthetase  41.81 
 
 
390 aa  304  2.0000000000000002e-81  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3291  tyrosyl-tRNA synthetase  41.91 
 
 
403 aa  304  2.0000000000000002e-81  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0469  tyrosyl-tRNA synthetase  42.08 
 
 
399 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  unclonable  0.000000000169724  decreased coverage  0.000126716 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0387  tyrosyl-tRNA synthetase  42.22 
 
 
421 aa  304  2.0000000000000002e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.523433  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0876  tyrosyl-tRNA synthetase  41.85 
 
 
400 aa  303  3.0000000000000004e-81  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  unclonable  0.00000000281136  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5098  tyrosyl-tRNA synthetase  41.03 
 
 
399 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000121242  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4767  tyrosyl-tRNA synthetase  42.57 
 
 
399 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00000195797  normal  0.701844 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0160  tyrosyl-tRNA synthetase  42.86 
 
 
395 aa  303  4.0000000000000003e-81  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000006248  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1881  tyrosyl-tRNA synthetase  41.63 
 
 
410 aa  303  4.0000000000000003e-81  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00141012  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0405  tyrosyl-tRNA synthetase  42.44 
 
 
401 aa  303  4.0000000000000003e-81  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  unclonable  0.000000345962  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08560  tyrosyl-tRNA synthetase  41.77 
 
 
399 aa  303  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0100825  decreased coverage  0.000000000888942 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0417  tyrosyl-tRNA synthetase  41.87 
 
 
413 aa  303  5.000000000000001e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.117344 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0436  tyrosyl-tRNA synthetase  41.83 
 
 
399 aa  302  7.000000000000001e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00177319  normal  0.0465602 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0064  tyrosyl-tRNA synthetase  40.63 
 
 
399 aa  302  8.000000000000001e-81  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.00000000240526  normal  0.291627 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0352  tyrosyl-tRNA synthetase  39.86 
 
 
398 aa  302  8.000000000000001e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2197  tyrosyl-tRNA synthetase  40.34 
 
 
414 aa  302  9e-81  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0747984  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2348  tyrosyl-tRNA synthetase  40.44 
 
 
408 aa  301  1e-80  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000140569  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0611  tyrosyl-tRNA synthetase  41.09 
 
 
416 aa  301  1e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.706339  normal  0.345444 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3085  tyrosyl-tRNA synthetase  43.19 
 
 
407 aa  301  1e-80  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.188908  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2700  tyrosyl-tRNA synthetase  41.83 
 
 
454 aa  301  2e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.62079 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3373  tyrosyl-tRNA synthetase  43.32 
 
 
398 aa  301  2e-80  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3769  tyrosyl-tRNA synthetase  41.98 
 
 
413 aa  301  2e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2686  tyrosyl-tRNA synthetase  43.19 
 
 
405 aa  301  2e-80  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0000803186  normal  0.260014 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3406  tyrosyl-tRNA synthetase  41.91 
 
 
413 aa  301  2e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3350  tyrosyl-tRNA synthetase  41.34 
 
 
416 aa  300  3e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0699695  hitchhiker  0.0000481251 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0466  tyrosyl-tRNA synthetase  41.58 
 
 
399 aa  300  3e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000141551  normal  0.218715 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0528  tyrosyl-tRNA synthetase  42.78 
 
 
405 aa  300  3e-80  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.445418  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2645  tyrosyl-tRNA synthetase  41.19 
 
 
410 aa  299  4e-80  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0210517  normal  0.766307 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1546  tyrosyl-tRNA synthetase  41.94 
 
 
410 aa  299  5e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.211898  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5905  tyrosyl-tRNA synthetase  40.94 
 
 
410 aa  299  6e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3412  tyrosyl-tRNA synthetase  41.91 
 
 
435 aa  299  6e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.899029  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45990  tyrosyl-tRNA synthetase  41.52 
 
 
399 aa  299  7e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.000021558  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1182  tyrosyl-tRNA synthetase  42.71 
 
 
403 aa  298  1e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000828541  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1237  tyrosyl-tRNA synthetase  40.8 
 
 
399 aa  298  1e-79  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2348  tyrosyl-tRNA synthetase  41.67 
 
 
413 aa  298  2e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2527  tyrosyl-tRNA synthetase  41.67 
 
 
413 aa  298  2e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1311  tyrosyl-tRNA synthetase  42.89 
 
 
388 aa  297  2e-79  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.0000763452  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1123  tyrosyl-tRNA synthetase  41.67 
 
 
413 aa  298  2e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0261  tyrosyl-tRNA synthetase  41.67 
 
 
413 aa  298  2e-79  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.668867  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2560  tyrosyl-tRNA synthetase  41.58 
 
 
432 aa  296  3e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.181889  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1240  tyrosyl-tRNA synthetase  41.98 
 
 
413 aa  297  3e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0307967  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3927  tyrosyl-tRNA synthetase  40.05 
 
 
399 aa  297  3e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000017019  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>