More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_3847 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_3847  transcriptional regulator, LacI family  100 
 
 		 337 aa  654    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.150933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0989  transcriptional regulator, LacI family  42.99 
 
 		 342 aa  229  6e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0809  transcriptional regulator, LacI family  42.51 
 
 		 349 aa  223  4.9999999999999996e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.914138 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4733  transcriptional regulator, LacI family  39.22 
 
 		 341 aa  183  4.0000000000000006e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.396374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4547  transcriptional regulator, LacI family  41.14 
 
 		 342 aa  179  4.999999999999999e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6174  transcriptional regulator, LacI-family  37.05 
 
 		 349 aa  178  1e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.345814 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2555  transcriptional regulator, LacI family  39.58 
 
 		 369 aa  172  1e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.679604  normal  0.216267 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2322  transcriptional regulator, LacI family  36.56 
 
 		 357 aa  157  3e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.131448  normal  0.0414369 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1554  LacI family transcriptional regulator  39.23 
 
 		 344 aa  157  3e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0673  regulatory protein, LacI  35.76 
 
 		 341 aa  141  1.9999999999999998e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.371597  normal  0.192843 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3841  regulatory protein LacI  34.94 
 
 		 332 aa  139  4.999999999999999e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.627459 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4528  LacI family transcription regulator  34.17 
 
 		 360 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3954  regulatory protein LacI  30.36 
 
 		 335 aa  131  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.226118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3832  regulatory protein LacI:Periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.54 
 
 		 335 aa  131  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0370934  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4014  regulatory protein LacI:Periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.36 
 
 		 335 aa  131  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0637146  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3910  regulatory protein LacI:Periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.36 
 
 		 335 aa  131  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.83437  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3845  transcriptional regulator, LacI-family  30.06 
 
 		 335 aa  130  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.587178  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3601  transcriptional regulator, LacI family  33.12 
 
 		 358 aa  127  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0229751  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4925  transcriptional regulator, LacI family  32.65 
 
 		 358 aa  126  5e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.344925  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14510  transcriptional regulator, LacI family  27.11 
 
 		 333 aa  120  4.9999999999999996e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000207214  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0302  sugar-binding protein, putative  30.55 
 
 		 338 aa  119  6e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.110668  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0278  putative sugar-binding protein  30.55 
 
 		 338 aa  119  6e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.396781  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0582  alanine racemase  28.7 
 
 		 337 aa  119  7.999999999999999e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000548778  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15580  transcriptional regulator, LacI family  26.02 
 
 		 336 aa  117  3e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2870  transcriptional regulator, LacI family  29.43 
 
 		 342 aa  116  5e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1072  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.98 
 
 		 330 aa  116  6e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2939  alanine racemase  30.66 
 
 		 340 aa  116  6e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0081  transcriptional regulator, LacI family  29.09 
 
 		 327 aa  116  6.9999999999999995e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1732  transcriptional regulator, LacI family  29.88 
 
 		 340 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0521835  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6588  LacI family transcription regulator  32 
 
 		 342 aa  114  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3585  LacI family transcription regulator  27.1 
 
 		 340 aa  113  4.0000000000000004e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000546261  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1481  transcriptional regulator, LacI family  28.78 
 
 		 342 aa  112  6e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.510371  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1333  transcriptional regulator, LacI family  31.62 
 
 		 347 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.00834702  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4199  LacI family transcription regulator  29.79 
 
 		 353 aa  111  1.0000000000000001e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4506  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  27.22 
 
 		 332 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0038285  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2268  transcriptional regulator, LacI family  27.54 
 
 		 339 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.580288  hitchhiker  0.000512159 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1242  LacI family transcription regulator  29.53 
 
 		 340 aa  111  1.0000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4410  catabolite control protein A  26.93 
 
 		 332 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23020  transcriptional regulator, LacI family  26.07 
 
 		 336 aa  111  2.0000000000000002e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000406909  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4427  catabolite control protein A  26.93 
 
 		 332 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4811  catabolite control protein A  26.93 
 
 		 332 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4790  catabolite control protein A  26.65 
 
 		 332 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4795  catabolite control protein A  26.93 
 
 		 332 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4575  catabolite control protein A  26.93 
 
 		 332 aa  110  3e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4929  catabolite control protein A  26.93 
 
 		 332 aa  110  3e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1744  transcriptional regulator, LacI family  26.44 
 
 		 336 aa  110  3e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3342  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  26.65 
 
 		 332 aa  110  3e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000152618  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3394  transcriptional regulator  32.44 
 
 		 361 aa  110  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.330741 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4813  catabolite control protein A  26.93 
 
 		 332 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0449  catabolite control protein A  26.44 
 
 		 332 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.486602 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4888  LacI family transcription regulator  32.17 
 
 		 336 aa  110  5e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.630665  normal  0.338127 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4515  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  31.64 
 
 		 351 aa  109  5e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0276  LacI family transcription regulator  31.46 
 
 		 347 aa  109  8.000000000000001e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1515  transcriptional regulator, LacI family  24.48 
 
 		 339 aa  108  1e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2600  LacI family transcription regulator  30.92 
 
 		 349 aa  108  1e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.383865  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6278  transcriptional regulator, LacI family  30.95 
 
 		 338 aa  108  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02195  transcription regulator transcription regulator protein  31.4 
 
 		 355 aa  107  2e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.479594  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5637  LacI family transcription regulator  31.66 
 
 		 338 aa  107  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.339737  normal  0.425271 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3513  LacI family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 337 aa  108  2e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.390726  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1685  transcriptional regulator, LacI family  29.46 
 
 		 337 aa  107  2e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2024  LacI family transcription regulator  28.99 
 
 		 348 aa  107  3e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3513  LacI family transcription regulator  32.72 
 
 		 338 aa  107  4e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.98216  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0413  transcriptional regulator, LacI family  30.2 
 
 		 358 aa  106  5e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2898  transcriptional regulator, LacI family  32.83 
 
 		 350 aa  106  6e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2854  LacI family transcription regulator  28.66 
 
 		 391 aa  106  7e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0559  transcriptional regulator, LacI family  32.15 
 
 		 337 aa  105  8e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2203  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.1 
 
 		 336 aa  105  1e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000348221  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0352  transcriptional regulator, LacI family  31.37 
 
 		 347 aa  105  1e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.00162695  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8999  transcriptional regulator  32.26 
 
 		 361 aa  105  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.450526  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3594  transcriptional regulator, LacI family  30.65 
 
 		 339 aa  105  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2385  transcriptional regulator, LacI family  31.67 
 
 		 346 aa  105  1e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.171577  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0275  transcriptional regulator, LacI family  33.53 
 
 		 339 aa  104  2e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.555598 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0945  LacI family transcription regulator  31.78 
 
 		 348 aa  104  2e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.0000657853  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4438  transcriptional regulator, LacI family  32.76 
 
 		 342 aa  104  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0401839 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0736  transcriptional regulator, LacI family  32.33 
 
 		 354 aa  105  2e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.585027  normal  0.948547 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0459  LacI family transcription regulator  28.44 
 
 		 340 aa  104  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0402  transcriptional regulator, LacI family  27.11 
 
 		 339 aa  104  3e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000159796  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0698  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  26.47 
 
 		 330 aa  104  3e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00410  transcriptional regulator, LacI family  27.33 
 
 		 337 aa  103  4e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3227  LacI family transcription regulator  31.36 
 
 		 362 aa  103  4e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1398  ribose operon repressor RbsR  30.29 
 
 		 334 aa  103  5e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.222506 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0416  LacI family transcription regulator  29.39 
 
 		 349 aa  103  6e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.339437  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0457  transcriptional regulator, LacI family  29.57 
 
 		 353 aa  103  6e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.532528  normal  0.622739 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5490  transcriptional regulator, LacI family  27.33 
 
 		 337 aa  102  6e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.932078  normal  0.122051 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0831  LacI family transcription regulator  30.75 
 
 		 326 aa  102  7e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0569804  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7709  LacI family transcription regulator  26.9 
 
 		 337 aa  102  7e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1637  LacI family transcription regulator  29.67 
 
 		 337 aa  102  8e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.455476 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01629  DNA-binding transcriptional repressor, hypoxanthine-binding  26.9 
 
 		 341 aa  102  9e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.847977  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1982  transcriptional regulator, LacI family  26.9 
 
 		 341 aa  102  9e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0168569  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3423  transcriptional regulator, LacI family  30.37 
 
 		 366 aa  102  9e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0558625 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1971  DNA-binding transcriptional repressor PurR  26.9 
 
 		 341 aa  102  9e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000994316 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2372  DNA-binding transcriptional repressor PurR  26.9 
 
 		 341 aa  102  9e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000002203  normal  0.181026 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0632  LacI family transcription regulator  28.01 
 
 		 344 aa  102  9e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4613  LacI family transcription regulator  28.78 
 
 		 335 aa  102  9e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.406396 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01618  hypothetical protein  26.9 
 
 		 341 aa  102  9e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.850711  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1538  DNA-binding transcriptional repressor PurR  26.9 
 
 		 341 aa  102  9e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0686294  normal  0.0781462 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1738  DNA-binding transcriptional repressor PurR  26.9 
 
 		 341 aa  102  9e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.20958e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1857  DNA-binding transcriptional repressor PurR  26.9 
 
 		 341 aa  102  9e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000046163  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6195  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  33.14 
 
 		 337 aa  102  9e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.193526  normal  0.910118 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2822  LacI family transcription regulator  32.63 
 
 		 352 aa  101  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.531617  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>