More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_3346 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_3346  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  100 
 
 
389 aa  785    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0244453 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3855  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  36.65 
 
 
370 aa  191  2e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.552694  normal  0.795222 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3858  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  33.51 
 
 
373 aa  189  7e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0581351  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3246  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  31.59 
 
 
384 aa  187  2e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2518  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  32.81 
 
 
372 aa  166  6.9999999999999995e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0286824  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2214  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  31.57 
 
 
378 aa  140  3e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4435  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.73 
 
 
377 aa  140  4.999999999999999e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0118641  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1946  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  32.75 
 
 
378 aa  139  6e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3874  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.23 
 
 
401 aa  134  1.9999999999999998e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0228827  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6032  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  31.46 
 
 
395 aa  127  2.0000000000000002e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.159313  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4982  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.24 
 
 
390 aa  127  2.0000000000000002e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.601828  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2836  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  28.38 
 
 
390 aa  127  4.0000000000000003e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.182529  normal  0.329907 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3211  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.21 
 
 
390 aa  126  6e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.514043  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0032  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.71 
 
 
375 aa  126  6e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0174  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.53 
 
 
398 aa  126  7e-28  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.348827 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4374  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.21 
 
 
390 aa  126  8.000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5055  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  30.21 
 
 
390 aa  125  9e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.902489  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5805  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.21 
 
 
390 aa  125  9e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.598482  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5071  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.21 
 
 
390 aa  125  1e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.435068  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3074  hypothetical protein  28.41 
 
 
391 aa  125  2e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.315148  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3056  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.95 
 
 
390 aa  124  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5182  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.57 
 
 
403 aa  124  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.028896  normal  0.168371 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0897  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  30.39 
 
 
387 aa  123  5e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.129101  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2394  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.75 
 
 
390 aa  123  6e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.7542  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5451  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.78 
 
 
403 aa  123  7e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.911825  normal  0.0412246 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36070  hypothetical protein  27.93 
 
 
391 aa  122  8e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000846029 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4678  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  31.25 
 
 
387 aa  122  9.999999999999999e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.194789  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0038  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.71 
 
 
375 aa  122  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2476  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  30.48 
 
 
378 aa  120  3e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2709  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.35 
 
 
398 aa  120  3.9999999999999996e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0606445  normal  0.111519 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4042  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  31.3 
 
 
379 aa  119  6e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2447  putative mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.1 
 
 
391 aa  119  7.999999999999999e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.549803  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3195  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  28.11 
 
 
390 aa  118  9.999999999999999e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2597  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.81 
 
 
388 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.598556  normal  0.375027 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4533  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  28.19 
 
 
384 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00790465  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5118  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  30.48 
 
 
382 aa  117  3e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.808237  normal  0.197598 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0822  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.86 
 
 
370 aa  117  3e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5070  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.77 
 
 
377 aa  117  3e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.356872  normal  0.166182 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1050  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.92 
 
 
381 aa  116  6e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.140519 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1303  gluconate dehydratase / galactonate dehydratase  27.3 
 
 
393 aa  116  7.999999999999999e-25  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3433  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.46 
 
 
381 aa  116  7.999999999999999e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.428257  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1162  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.05 
 
 
404 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.233578  normal  0.767056 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6746  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.92 
 
 
368 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4358  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  27.96 
 
 
386 aa  114  3e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.370383  normal  0.442664 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5897  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.57 
 
 
382 aa  113  5e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.335458  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3370  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  31.2 
 
 
389 aa  113  5e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.90513  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4132  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.57 
 
 
407 aa  113  7.000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0168136  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2128  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.87 
 
 
402 aa  113  7.000000000000001e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2580  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.68 
 
 
369 aa  112  1.0000000000000001e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6193  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  25.56 
 
 
425 aa  110  5e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.281448  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1862  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  31.12 
 
 
370 aa  109  7.000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.324326  normal  0.225568 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4981  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.45 
 
 
389 aa  108  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.713473  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01410  D-mannonate dehydratase  28.26 
 
 
412 aa  108  1e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0154  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  26.11 
 
 
398 aa  108  1e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.434953  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3592  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.56 
 
 
389 aa  108  1e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.2088  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3598  galactonate dehydratase  29.65 
 
 
382 aa  108  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.729698  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4412  galactonate dehydratase  29.47 
 
 
375 aa  107  4e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.737612  normal  0.426328 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0552  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  28.57 
 
 
390 aa  106  7e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.133728  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3887  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  26.53 
 
 
393 aa  106  7e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4153  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.16 
 
 
393 aa  106  7e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0864  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  26.98 
 
 
373 aa  105  9e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3915  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  26.46 
 
 
398 aa  105  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4083  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  26.46 
 
 
398 aa  105  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.386649  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2811  galactonate dehydratase  29.23 
 
 
382 aa  105  1e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.275596  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3977  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  26.46 
 
 
398 aa  105  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.618282 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4022  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  26.46 
 
 
398 aa  105  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1207  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.09 
 
 
392 aa  105  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02420  D-mannonate dehydratase  29.06 
 
 
402 aa  105  2e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.296933  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2179  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  30.35 
 
 
382 aa  105  2e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0507727  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1989  galactonate dehydratase  30.62 
 
 
401 aa  105  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.217877  normal  0.0214185 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5408  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.53 
 
 
396 aa  105  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00119776 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0918  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.38 
 
 
398 aa  105  2e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.908418  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1354  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.35 
 
 
392 aa  104  2e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.977572  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0028  putative mandelate racemase/muconate lactonizing family protein  29.08 
 
 
362 aa  104  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.370595  normal  0.102793 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5132  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.92 
 
 
402 aa  104  3e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4537  galactonate dehydratase  27.69 
 
 
385 aa  104  3e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0313  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.51 
 
 
371 aa  103  4e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0504  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.18 
 
 
409 aa  103  4e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3767  galactonate dehydratase  28.84 
 
 
382 aa  103  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.854343  normal  0.799766 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0291  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.54 
 
 
403 aa  103  5e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4975  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.16 
 
 
370 aa  103  6e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0890752 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0510  starvation sensing protein RspA  28.64 
 
 
402 aa  103  7e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.631035  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4123  galactonate dehydratase  30.65 
 
 
382 aa  103  7e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0234002  normal  0.927238 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4441  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.03 
 
 
391 aa  103  7e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0607658  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1377  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  24.74 
 
 
438 aa  103  7e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.488669 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2096  starvation sensing protein RspA  28.64 
 
 
402 aa  103  7e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2001  starvation sensing protein RspA  28.64 
 
 
402 aa  103  7e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3479  galactonate dehydratase  28.57 
 
 
382 aa  102  8e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.412363  normal  0.814852 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2476  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  26.98 
 
 
398 aa  102  8e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5741  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.15 
 
 
386 aa  102  8e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.190223 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3386  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.09 
 
 
398 aa  102  1e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07140  D-mannonate dehydratase  29.22 
 
 
402 aa  102  1e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.537507  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3392  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.86 
 
 
398 aa  102  1e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0131029  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1022  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.51 
 
 
379 aa  102  1e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.203995 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0821  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.57 
 
 
405 aa  102  1e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3561  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.38 
 
 
396 aa  102  1e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3278  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.92 
 
 
403 aa  102  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2405  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.93 
 
 
374 aa  102  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.44174  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3318  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.66 
 
 
411 aa  101  2e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0708913 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0994  putative mandelate racemase / muconatelactonizing enzyme  28.57 
 
 
392 aa  102  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0973014  normal  0.486209 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>