192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_3251 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_3251  Radical SAM domain protein  100 
 
 
698 aa  1407    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.226433 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2697  Hedgehog/intein hint domain protein  52.92 
 
 
715 aa  640    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.585756  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1725  radical SAM domain-containing protein  53.74 
 
 
349 aa  241  2.9999999999999997e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1963  radical SAM domain-containing protein  52.97 
 
 
389 aa  239  1e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.003672  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3183  Radical SAM domain protein  52.81 
 
 
370 aa  237  7e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00177318 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6097  Radical SAM domain-containing protein  49.57 
 
 
338 aa  233  8.000000000000001e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1488  Radical SAM domain protein  49.35 
 
 
368 aa  225  2e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000243834 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2599  radical SAM domain-containing protein  51.74 
 
 
338 aa  224  4e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3344  Radical SAM domain protein  48.92 
 
 
362 aa  221  5e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000768449  normal  0.0781434 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0729  radical SAM domain-containing protein  51.27 
 
 
345 aa  218  4e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.321296 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1485  radical SAM domain-containing protein  48.48 
 
 
373 aa  213  1e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1220  radical SAM domain-containing protein  47.66 
 
 
329 aa  212  2e-53  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0539702  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14520  DNA repair photolyase  48.9 
 
 
357 aa  208  4e-52  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12598  hypothetical protein  46.46 
 
 
340 aa  204  3e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3795  radical SAM domain-containing protein  46.08 
 
 
339 aa  204  4e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.18338  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1808  Radical SAM domain protein  48.76 
 
 
345 aa  196  1e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0645523  normal  0.369217 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1745  Radical SAM domain protein  47.06 
 
 
342 aa  194  4e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2335  radical SAM domain-containing protein  50 
 
 
358 aa  194  6e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.799816  hitchhiker  0.00678012 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2296  radical SAM family protein  50 
 
 
341 aa  194  7e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2343  radical SAM domain-containing protein  50 
 
 
341 aa  194  7e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.513503 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2004  Radical SAM domain protein  49.57 
 
 
368 aa  192  2e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.121365  normal  0.180359 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1952  Radical SAM domain protein  43.59 
 
 
344 aa  182  2e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28900  DNA repair photolyase  47.88 
 
 
350 aa  181  4.999999999999999e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.614391  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1761  radical SAM domain-containing protein  46.35 
 
 
360 aa  177  8e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0707  radical SAM domain-containing protein  42.18 
 
 
421 aa  170  1e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0399019  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1707  hypothetical protein  34.11 
 
 
294 aa  165  3e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0398  radical SAM domain-containing protein  41.38 
 
 
372 aa  164  6e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0452  radical SAM domain-containing protein  41.87 
 
 
385 aa  162  2e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.290609 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4362  radical SAM family protein  40.09 
 
 
387 aa  161  4e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.16102  normal  0.0230577 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0870  Radical SAM domain protein  38.78 
 
 
374 aa  161  4e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0400323  normal  0.723126 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0399  hypothetical protein  41.87 
 
 
390 aa  160  5e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0387  hypothetical protein  41.87 
 
 
390 aa  160  6e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.595283  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0704  radical SAM family protein  40.89 
 
 
384 aa  160  7e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.503182  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0799  Radical SAM domain protein  38.78 
 
 
374 aa  159  1e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.737474  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0620  radical SAM family Fe-S protein  39.66 
 
 
350 aa  159  2e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.88573 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0289  radical SAM family protein  40.39 
 
 
352 aa  158  4e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0015  Radical SAM domain protein  39.41 
 
 
363 aa  158  4e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.811476  hitchhiker  0.00130653 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3222  radical SAM family protein  38.97 
 
 
387 aa  157  5.0000000000000005e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0517  Radical SAM domain protein  42.36 
 
 
385 aa  157  6e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.619466 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2341  hypothetical protein  39.15 
 
 
377 aa  157  7e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.2896 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1225  Radical SAM domain protein  39.62 
 
 
386 aa  157  7e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.931656  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1080  radical SAM family protein  38.68 
 
 
386 aa  157  9e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.981176  normal  0.301506 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5254  radical SAM domain protein  40.1 
 
 
352 aa  156  1e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2545  radical SAM family protein  43.84 
 
 
417 aa  156  1e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0561  Radical SAM domain protein  42.86 
 
 
385 aa  156  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0508  radical SAM domain-containing protein  40.89 
 
 
390 aa  156  1e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.233922  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2600  DNA repair photolyase  39.15 
 
 
386 aa  155  2e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.64054  normal  0.361396 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05793  radical SAM domain protein  41.87 
 
 
375 aa  155  2.9999999999999998e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4466  radical SAM domain-containing protein  38.4 
 
 
353 aa  155  4e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1206  radical SAM family protein  38.68 
 
 
393 aa  153  8.999999999999999e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.649327 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2980  Radical SAM domain protein  38.13 
 
 
381 aa  152  1e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0187919 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4095  radical SAM domain-containing protein  36.02 
 
 
362 aa  152  1e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.138855  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4479  DNA repair photolyase-like protein  42.2 
 
 
320 aa  152  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.123605  normal  0.831003 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1480  hypothetical protein  37.44 
 
 
356 aa  152  2e-35  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000411506  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0117  radical SAM domain-containing protein  39.9 
 
 
352 aa  152  3e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.190485 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0928  hypothetical protein  40.19 
 
 
375 aa  150  5e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.125101 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0547  radical SAM domain-containing protein  40.89 
 
 
362 aa  150  7e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03695  radical SAM domain protein  35.47 
 
 
356 aa  150  8e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1003  hypothetical protein  37.31 
 
 
381 aa  150  1.0000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.850299 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3325  radical SAM family protein  43.07 
 
 
368 aa  149  2.0000000000000003e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  unclonable  0.000000113455 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0937  hypothetical protein  38.92 
 
 
385 aa  148  3e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.388526  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0113  radical SAM domain-containing protein  39.9 
 
 
352 aa  147  5e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000412834 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1433  Radical SAM domain protein  39.51 
 
 
395 aa  147  5e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.908326 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1060  Radical SAM domain protein  42.57 
 
 
361 aa  147  6e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0114  radical SAM domain-containing protein  40.39 
 
 
352 aa  147  6e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0099  radical SAM domain protein  40.39 
 
 
352 aa  147  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0290614 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4818  Radical SAM domain protein  37.93 
 
 
350 aa  147  9e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.66643  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1137  Radical SAM domain protein  33.47 
 
 
357 aa  146  1e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.712968  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2814  Radical SAM domain protein  44.55 
 
 
343 aa  145  3e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2719  Radical SAM domain protein  44.55 
 
 
343 aa  145  3e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3675  radical SAM domain-containing protein  41.1 
 
 
371 aa  144  7e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.852388 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1658  radical SAM domain-containing protein  40.19 
 
 
376 aa  144  7e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0923  radical SAM domain-containing protein  40.19 
 
 
385 aa  143  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0224  radical SAM domain-containing protein  40.19 
 
 
385 aa  143  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.687698  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2972  radical SAM domain-containing protein  40.19 
 
 
385 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2549  radical SAM domain-containing protein  40.19 
 
 
385 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.22398  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2862  radical SAM domain-containing protein  40.19 
 
 
383 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.22952  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2923  radical SAM domain-containing protein  40.19 
 
 
385 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0767  radical SAM domain-containing protein  40.39 
 
 
386 aa  141  3e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.338567 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1769  Radical SAM domain protein  39.11 
 
 
352 aa  142  3e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0742  radical SAM family protein  38.12 
 
 
361 aa  141  3.9999999999999997e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.669971  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1768  radical SAM domain-containing protein  37.56 
 
 
374 aa  140  6e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.938086 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0406  radical SAM domain-containing protein  39.72 
 
 
374 aa  140  7e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2803  radical SAM domain-containing protein  41.59 
 
 
402 aa  140  7e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.246146 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2293  Radical SAM domain protein  41.59 
 
 
385 aa  140  7.999999999999999e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.972622  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2212  hypothetical protein  40.59 
 
 
325 aa  139  1e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1419  radical SAM domain-containing protein  41.87 
 
 
359 aa  139  1e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2104  Radical SAM domain protein  37.56 
 
 
380 aa  139  1e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.124136  normal  0.781731 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1946  radical SAM domain-containing protein  40.89 
 
 
437 aa  140  1e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0041965 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0083  radical SAM family protein  38.42 
 
 
352 aa  139  2e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1617  radical SAM family protein  40.89 
 
 
415 aa  138  3.0000000000000003e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1773  radical SAM family protein  38.92 
 
 
378 aa  138  3.0000000000000003e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.680102  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3138  radical SAM family protein  42.86 
 
 
355 aa  138  3.0000000000000003e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4284  Radical SAM domain protein  35.96 
 
 
352 aa  138  4e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.948479 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4180  radical SAM family protein  35.91 
 
 
391 aa  137  5e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1266  radical SAM family protein  38.37 
 
 
360 aa  137  5e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.249898 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2237  radical SAM domain-containing protein  40.39 
 
 
392 aa  137  5e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1500  radical SAM family protein  38.12 
 
 
358 aa  137  6.0000000000000005e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0946  radical SAM domain-containing protein  36.18 
 
 
392 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0942  radical SAM domain-containing protein  36.18 
 
 
392 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.672209  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>