28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_2470 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_2470  ABC-2 type transporter  100 
 
 
247 aa  459  9.999999999999999e-129  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.218035  hitchhiker  0.00397591 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4746  ABC-type multidrug transport system permease component-like protein  32.18 
 
 
232 aa  82  0.000000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.495874 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3151  ABC-2 type transporter  29.21 
 
 
247 aa  81.6  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3543  ABC-2 type transporter  32.68 
 
 
246 aa  76.3  0.0000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.187999  normal  0.524655 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0275  ABC-2 type transporter  32.09 
 
 
231 aa  70.9  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0196  ABC-2 type transporter  30.36 
 
 
247 aa  69.3  0.00000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.168445  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3548  ABC transporter protein  32.21 
 
 
251 aa  68.9  0.00000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.705683  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0481  ABC-2 type transporter  30.85 
 
 
267 aa  63.9  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9333  hypothetical protein  29.41 
 
 
244 aa  59.3  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.312033 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3106  ABC-2 type transporter  29.69 
 
 
278 aa  59.3  0.00000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.708923  hitchhiker  0.000220198 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0613  ABC-2 type transporter  31.09 
 
 
247 aa  57  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0825  ABC-type multidrug transport system permease component-like protein  31.5 
 
 
261 aa  55.8  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.951149  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3574  ABC-2 type transporter  26.97 
 
 
443 aa  53.5  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.473143  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0173  ABC-2 type transporter  28.45 
 
 
262 aa  53.5  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3319  ABC-2 type transporter  25.62 
 
 
267 aa  51.6  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1028  ABC-2 type transporter  31.18 
 
 
275 aa  50.4  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.321996  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0909  ABC transporter protein  25.57 
 
 
276 aa  50.4  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.982909  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0926  ABC-2 type transporter  29.89 
 
 
236 aa  48.5  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.348687  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3801  ABC-2 type transporter  30.69 
 
 
267 aa  47  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_701  ABC transporter, permease protein  25.15 
 
 
360 aa  45.8  0.0006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.222918  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0795  ABC transporter, permease protein  25.15 
 
 
339 aa  45.8  0.0006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0125503  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0721  ABC-2 type transporter  25.35 
 
 
360 aa  44.7  0.001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00179914  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0531  ABC transporter permease  22.56 
 
 
241 aa  44.3  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0511  ABC-2 type transporter  26.88 
 
 
266 aa  43.5  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2429  ABC-2 type transporter  27.18 
 
 
251 aa  43.5  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0140653  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2584  ABC-2 type transporter  27.18 
 
 
251 aa  43.1  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.369437  normal  0.0868823 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0671  ABC-2 type transporter  29.76 
 
 
278 aa  43.1  0.004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.000519244  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4920  ABC-2 type transporter  28.66 
 
 
249 aa  42.7  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.13049  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>