31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_1520 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_1520  anti-ECFsigma factor, ChrR  100 
 
 
255 aa  494  1e-139  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.173535 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0341  hypothetical protein  26.1 
 
 
259 aa  84.7  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0227  putative transmembrane anti-sigma factor  27.04 
 
 
277 aa  66.6  0.0000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4536  hypothetical protein  30.86 
 
 
250 aa  65.9  0.0000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.369604  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5092  hypothetical protein  30.56 
 
 
262 aa  65.1  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3291  hypothetical protein  30.53 
 
 
248 aa  62.4  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5361  Anti-sigma K factor RskA  32.53 
 
 
246 aa  59.7  0.00000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.655522  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3980  hypothetical protein  27.84 
 
 
246 aa  57.8  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.24724  normal  0.367091 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1668  hypothetical protein  30.5 
 
 
240 aa  56.6  0.0000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0134215  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2017  hypothetical protein  41.03 
 
 
267 aa  54.7  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2037  putative transmembrane anti-sigma factor  35.79 
 
 
313 aa  55.1  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0245  putative transmembrane anti-sigma factor  26.18 
 
 
237 aa  54.3  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4208  hypothetical protein  41.94 
 
 
292 aa  53.5  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.943502 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0544  hypothetical protein  39.19 
 
 
255 aa  51.2  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0977193 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1598  hypothetical protein  25.95 
 
 
258 aa  50.1  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.240945  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0889  putative transmembrane anti-sigma factor  22.76 
 
 
329 aa  49.7  0.00005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4263  hypothetical protein  28.51 
 
 
246 aa  48.5  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.579541  normal  0.123734 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0351  putative transmembrane anti-sigma factor  34.07 
 
 
267 aa  47.4  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0304335 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0899  putative transmembrane anti-sigma factor  40.91 
 
 
258 aa  47.4  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1582  hypothetical protein  26.77 
 
 
244 aa  47.4  0.0002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0100  putative transmembrane anti-sigma factor  39.24 
 
 
371 aa  47.8  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.314506  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0607  putative anti-sigmaE protein  30.83 
 
 
210 aa  47  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.116214 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3193  putative transmembrane anti-sigma factor  34.78 
 
 
295 aa  47  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1761  putative transmembrane anti-sigma factor  33.83 
 
 
318 aa  46.6  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.446242 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0897  putative transmembrane anti-sigma factor  42.47 
 
 
291 aa  45.8  0.0007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0263954  unclonable  0.0000000174741 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3435  putative transmembrane anti-sigma factor  29.46 
 
 
265 aa  42.7  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5953  putative transmembrane anti-sigma factor  43.33 
 
 
270 aa  42.4  0.007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3433  hypothetical protein  33.62 
 
 
267 aa  42.4  0.007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5902  hypothetical protein  25.51 
 
 
242 aa  42.4  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.617501 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3713  putative transmembrane anti-sigma factor  50 
 
 
62 aa  42  0.009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.181585  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1269  hypothetical protein  35.14 
 
 
331 aa  42  0.01  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000022202  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>