More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2637 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009012  Cthe_2637  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
345 aa  709    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  35.61 
 
 
378 aa  162  1e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0155  glycosyl transferase, group 1  28.61 
 
 
361 aa  154  2e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2807  glycosyl transferase group 1  26.67 
 
 
393 aa  140  3e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3084  glycosyl transferase group 1  27.14 
 
 
379 aa  139  7e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2105  glycosyl transferase group 1  27.15 
 
 
371 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.352856  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2357  Glycosyltransferase-like protein  31.35 
 
 
408 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.61542  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2765  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.62 
 
 
365 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.367187  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2752  glycosyl transferase, group 1  28.43 
 
 
401 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2383  glycosyl transferase group 1  31.49 
 
 
398 aa  130  2.0000000000000002e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.501705  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0792  glycosyl transferase group 1  32.63 
 
 
375 aa  130  3e-29  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  26.73 
 
 
377 aa  130  3e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2152  glycosyl transferase family protein  26.37 
 
 
371 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.540294  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2883  polysaccharide pyruvyl transferase  28.44 
 
 
745 aa  127  3e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2692  glycosyl transferase, group 1  29.94 
 
 
367 aa  127  3e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000235502  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0673  glycosyl transferase group 1  29.04 
 
 
371 aa  127  4.0000000000000003e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1780  glycosyl transferase group 1  26.19 
 
 
412 aa  127  4.0000000000000003e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0668  glycosyl transferase, group 1  32.29 
 
 
378 aa  126  5e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000385091 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2372  glycosyl transferase, group 1  28.45 
 
 
383 aa  126  5e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.732911  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2467  glycosyl transferase group 1  26.17 
 
 
412 aa  125  9e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1847  glycosyl transferase group 1  27.52 
 
 
385 aa  124  3e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  26.33 
 
 
377 aa  123  4e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5000  glycosyl transferase group 1  27.38 
 
 
389 aa  121  1.9999999999999998e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.704682 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4438  glycosyl transferase, group 1  28.08 
 
 
370 aa  120  3e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.356751  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1426  glycosyl transferase group 1  29.46 
 
 
536 aa  120  3e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2702  polysaccharide pyruvyl transferase  27.53 
 
 
745 aa  119  7.999999999999999e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000746297  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2202  glycosyl transferase, group 1  29.29 
 
 
394 aa  119  7.999999999999999e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3711  glycosyl transferase group 1  27.83 
 
 
376 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.202497  normal  0.0584888 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1977  glycosyl transferase, group 1  27.78 
 
 
403 aa  117  3e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2854  glycosyl transferase group 1  30.06 
 
 
390 aa  117  3.9999999999999997e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2283  glycosyl transferase, group 1  28.57 
 
 
373 aa  116  6e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0825  glycosyl transferase group 1  26.71 
 
 
382 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.761905  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3098  glycosyl transferase group 1  29.82 
 
 
363 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1346  glycosyl transferase group 1  27.51 
 
 
399 aa  115  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1500  glycosyl transferase, group 1  26.32 
 
 
383 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3034  glycosyl transferase, group 1  25 
 
 
360 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1629  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.52 
 
 
381 aa  114  3e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.170146 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1445  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.52 
 
 
381 aa  114  3e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1417  glycosyltransferase  26.52 
 
 
381 aa  114  3e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1418  glycosyltransferase  26.52 
 
 
381 aa  114  3e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1558  group 1 family glycosyl transferase  26.52 
 
 
381 aa  114  3e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1461  glycosyl transferase group 1  26.52 
 
 
381 aa  114  3e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.244211  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3803  glycosyl transferase group 1  26.23 
 
 
390 aa  114  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.395317 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2066  glycosyl transferase group 1  29.75 
 
 
375 aa  113  4.0000000000000004e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.033296  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1702  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.52 
 
 
381 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0208519  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0321  glycosyl transferase group 1  28.08 
 
 
388 aa  113  5e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2607  glycosyl transferase group 1  26.12 
 
 
387 aa  113  5e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0762323  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1591  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.24 
 
 
381 aa  113  6e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1502  glycosyltransferase  29.31 
 
 
379 aa  112  8.000000000000001e-24  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3754  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.97 
 
 
381 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3097  glycosyl transferase group 1  30.93 
 
 
390 aa  112  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.367624  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3402  glycosyl transferase group 1  25.33 
 
 
385 aa  110  3e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.838483  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2004  glycosyl transferase, group 1  27.72 
 
 
403 aa  110  3e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1664  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.24 
 
 
381 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1259  glycosyl transferase group 1  26.27 
 
 
381 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.509892  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3106  glycosyl transferase group 1  27.09 
 
 
382 aa  110  4.0000000000000004e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277853  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  28.94 
 
 
360 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2206  glycosyl transferase group 1  27.49 
 
 
371 aa  109  5e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2520  glycosyl transferase, group 1  29.13 
 
 
401 aa  109  6e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.303259  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4004  glycosyl transferase group 1  26.28 
 
 
398 aa  109  6e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4263  glycosyl transferase, group 1  25.95 
 
 
396 aa  109  7.000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2121  glycosyl transferase group 1  26.81 
 
 
375 aa  109  7.000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2001  glycosyl transferase, group 1  29.41 
 
 
380 aa  108  1e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0143  glycosyltransferase-like protein  24.74 
 
 
371 aa  108  1e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02220  hypothetical protein  30.94 
 
 
370 aa  108  1e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1513  glycosyl transferase, group 1  26.67 
 
 
399 aa  108  1e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0232535  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2152  glycosyl transferase, group 1  27.4 
 
 
387 aa  107  3e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5246  glycosyl transferase, group 1  26.63 
 
 
382 aa  107  3e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0657  glycosyltransferase  28.82 
 
 
358 aa  107  4e-22  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.326106  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0504  glycosyl transferase group 1  26.05 
 
 
391 aa  107  4e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2126  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.86 
 
 
366 aa  106  5e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2460  glycosyl transferase group 1  25.41 
 
 
381 aa  106  5e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2339  glycosyl transferase, group 1  27.59 
 
 
373 aa  106  5e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2739  glycosyl transferase group 1  29.03 
 
 
377 aa  106  5e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.363262  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1027  glycosyl transferase group 1  27.82 
 
 
377 aa  106  6e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3111  group 1 glycosyl transferase  29.66 
 
 
383 aa  106  7e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0624  glycosyl transferase group 1  26.89 
 
 
379 aa  105  8e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.225322 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5001  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.18 
 
 
365 aa  105  1e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3176  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.26 
 
 
373 aa  105  1e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1793  glycosyl transferase group 1  26.07 
 
 
388 aa  105  1e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.488843  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3344  glycosyl transferase, group 1  26.98 
 
 
384 aa  105  1e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.224872  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1082  glycosyl transferase, group 1  31.34 
 
 
389 aa  105  2e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0865164  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3573  glycosyl transferase, group 1  29.69 
 
 
378 aa  104  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.823094  normal  0.0285529 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1942  glycosyl transferase group 1  26.84 
 
 
410 aa  105  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000293265 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1197  glycosyl transferase, group 1  23.01 
 
 
374 aa  104  2e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0791  glycosyl transferase, group 1  27.89 
 
 
364 aa  105  2e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3953  glycosyl transferase group 1  24.93 
 
 
374 aa  104  3e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.32029  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13811  hypothetical protein  32.76 
 
 
374 aa  104  3e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.47971  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14251  hypothetical protein  28.53 
 
 
384 aa  103  4e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0241071  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2463  glycosyl transferase, group 1  25.61 
 
 
385 aa  103  5e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3055  glycosyl transferase, group 1  26.35 
 
 
439 aa  103  5e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2591  glycosyl transferase, group 1  29.79 
 
 
373 aa  102  7e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2958  glycosyl transferase, group 1  27.33 
 
 
404 aa  102  9e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0431  glycosyl transferase group 1  30.77 
 
 
380 aa  102  1e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.16111  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0112  glycosyl transferase, group 1  24.78 
 
 
367 aa  101  2e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1197  glycosyl transferase group 1  27.11 
 
 
367 aa  101  2e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.788986  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0812  UDP-N-acetylglucosamine--N-acetylmuramyl- (pentapeptide) pyrophosphoryl-undecaprenol  24.24 
 
 
381 aa  101  2e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0838  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.44 
 
 
419 aa  101  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3273  sugar transferase, PEP-CTERM/EpsH1 system associated  26.4 
 
 
388 aa  101  2e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.949918  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3114  glycosyl transferase group 1  24.29 
 
 
369 aa  100  3e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000549793  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>