More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0538 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_0538  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 338 aa  689    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.331453  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2077  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  51.06 
 
 		 335 aa  340  2e-92  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.197055  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1537  histidine kinase  47.16 
 
 		 334 aa  273  4.0000000000000004e-72  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.496885  normal  0.0588586 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1154  histidine kinase  36.18 
 
 		 414 aa  189  5.999999999999999e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0560  histidine kinase  30.95 
 
 		 341 aa  148  1.0000000000000001e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0919197  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1242  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.67 
 
 		 331 aa  129  8.000000000000001e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0742  histidine kinase  31.44 
 
 		 286 aa  128  1.0000000000000001e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1713  histidine kinase  29.37 
 
 		 464 aa  120  3e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.529234  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1156  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.93 
 
 		 451 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00188627  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0767  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.51 
 
 		 451 aa  116  5e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2674  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.22 
 
 		 585 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.239294  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1846  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.17 
 
 		 463 aa  115  1.0000000000000001e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000887504  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2147  histidine kinase  30.42 
 
 		 320 aa  113  5e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2332  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.91 
 
 		 600 aa  112  9e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0645  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.23 
 
 		 467 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2331  sensor histidine kinase  30.09 
 
 		 466 aa  108  2e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0112  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.03 
 
 		 615 aa  107  4e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0786  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.79 
 
 		 582 aa  105  8e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2991  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  30.36 
 
 		 894 aa  105  1e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0792  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  27.96 
 
 		 476 aa  104  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0106036 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2621  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.15 
 
 		 610 aa  104  2e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.272408  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0032  histidine kinase  28.01 
 
 		 423 aa  105  2e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18370  signal transduction histidine kinase  25.82 
 
 		 389 aa  103  3e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0577  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.26 
 
 		 476 aa  104  3e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.763592  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3251  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.06 
 
 		 578 aa  103  4e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.542862  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1741  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  28.23 
 
 		 461 aa  103  4e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.300317  normal  0.393073 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5332  histidine kinase sensor  30.8 
 
 		 471 aa  103  4e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0668535  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3365  sensor histidine kinase  26.9 
 
 		 357 aa  103  5e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.17571  hitchhiker  0.0000000000000135665 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1237  ATPase domain-containing protein  28.57 
 
 		 616 aa  102  8e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1006  histidine kinase  27.73 
 
 		 503 aa  102  8e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.553516  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1399  histidine kinase  28.57 
 
 		 616 aa  102  8e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.216663  normal  0.406832 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4295  histidine kinase  27.88 
 
 		 596 aa  102  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.436681  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1963  sensor histidine kinase  25.87 
 
 		 357 aa  102  1e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.553892  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1825  histidine kinase  26.04 
 
 		 357 aa  102  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3968  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.08 
 
 		 596 aa  101  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.948253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1507  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.24 
 
 		 488 aa  101  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5673  two-component regulatory system sensory histidine kinase  27.16 
 
 		 462 aa  101  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.897664 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3088  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.04 
 
 		 601 aa  101  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.774704 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2843  Osmosensitive K channel His kinase sensor  28.04 
 
 		 926 aa  101  2e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0045  two-component sensor histidine kinase protein  28.04 
 
 		 590 aa  101  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1178  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.79 
 
 		 616 aa  101  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.375911  normal  0.307553 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2063  sensor histidine kinase  28.08 
 
 		 357 aa  100  4e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000411382  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1229  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.67 
 
 		 396 aa  99.8  5e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.177188 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31950  putative two-component sensor  30.73 
 
 		 472 aa  100  5e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.578717  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2218  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.28 
 
 		 597 aa  100  5e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0940  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.19 
 
 		 530 aa  99.8  6e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.104669  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04930  signal transduction histidine kinase  25.49 
 
 		 389 aa  99.8  6e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4648  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  26.06 
 
 		 900 aa  99.8  6e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2657  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.47 
 
 		 829 aa  99.4  7e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2095  histidine kinase  27.01 
 
 		 539 aa  99  9e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2042  sensor histidine kinase  26.27 
 
 		 351 aa  98.6  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.711965  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0623  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.37 
 
 		 369 aa  99  1e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.779976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4664  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.82 
 
 		 413 aa  98.6  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1796  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.72 
 
 		 1965 aa  99  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1864  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.07 
 
 		 460 aa  98.6  1e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.793429  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0943  histidine kinase  28.18 
 
 		 530 aa  98.2  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.215183  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02380  two-component sensor histidine kinase transcription regulator protein  31.08 
 
 		 466 aa  98.6  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.197859 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0436  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.14 
 
 		 595 aa  98.2  2e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.437679  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3071  histidine kinase  25.94 
 
 		 369 aa  98.6  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000550678 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2823  histidine kinase  26.94 
 
 		 501 aa  98.2  2e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5434  histidine kinase  28.13 
 
 		 605 aa  97.8  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.212441  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0827  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.67 
 
 		 605 aa  97.8  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.12841  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2011  putative sensor histidine kinase BvrS  28.22 
 
 		 589 aa  97.8  2e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.128135  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0540  sensory box histidine kinase PhoR  29.79 
 
 		 587 aa  97.4  3e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000110325 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4698  sensory box histidine kinase PhoR  29.79 
 
 		 587 aa  97.1  3e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.92933  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2091  sensor histidine kinase BvrS, putative  28.22 
 
 		 601 aa  97.4  3e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19410  histidine kinase with HAMP domain  25.99 
 
 		 363 aa  97.4  3e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.241582  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2868  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.58 
 
 		 593 aa  97.8  3e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0226  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.49 
 
 		 597 aa  97.4  3e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0134346 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0429  ATP-binding region ATPase domain protein  28.69 
 
 		 568 aa  97.4  3e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.796172  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11101  two-component sensor histidine kinase, phosphate sensing  28.12 
 
 		 361 aa  97.4  3e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.330721 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4318  phosphate regulon sensor protein  29.36 
 
 		 587 aa  97.1  4e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4418  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.36 
 
 		 587 aa  97.1  4e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0868  phosphate regulon sensor protein  25.72 
 
 		 431 aa  96.7  5e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.655854  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2483  sensor histidine kinase KdpD  27.04 
 
 		 885 aa  96.7  5e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4483  sensory box histidine kinase PhoR  29.36 
 
 		 587 aa  96.7  5e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4329  phosphate regulon sensor protein  29.36 
 
 		 587 aa  96.7  5e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4713  sensory box histidine kinase PhoR  29.36 
 
 		 587 aa  96.7  5e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2436  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  27.47 
 
 		 888 aa  96.7  5e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.747553 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4832  sensory box histidine kinase PhoR  29.36 
 
 		 587 aa  96.7  5e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.714625  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4703  sensory box histidine kinase PhoR  29.36 
 
 		 587 aa  96.7  5e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.53621e-18 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1915  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.57 
 
 		 463 aa  96.7  5e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000195525  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0417  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.29 
 
 		 495 aa  96.3  6e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000648211  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4294  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.82 
 
 		 469 aa  96.3  7e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000408474  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1348  histidine kinase  29.72 
 
 		 501 aa  95.9  8e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.515384 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1191  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  27.71 
 
 		 697 aa  95.9  8e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.604254  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0227  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.56 
 
 		 482 aa  95.9  8e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.60128 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3856  heavy metal sensor Signal transduction histidine Kinases (STHK)  29.91 
 
 		 446 aa  95.9  9e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.228266  normal  0.918767 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3423  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  27.69 
 
 		 564 aa  95.9  9e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0561308  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2486  histidine kinase  27.45 
 
 		 347 aa  95.5  1e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15520  heavy metal sensor histidine protein kinase, two-component  29.22 
 
 		 431 aa  95.1  1e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0703  sensor histidine kinase  27.19 
 
 		 392 aa  95.5  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0748  GAF sensor signal transduction histidine kinase  27.02 
 
 		 815 aa  95.9  1e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4730  Two component system histidine kinase  27.19 
 
 		 416 aa  95.5  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2347  putative two-component sensor  28.52 
 
 		 443 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.508121  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2326  sensor protein yycg  24.36 
 
 		 473 aa  95.1  1e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1883  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.2 
 
 		 549 aa  95.5  1e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2713  putative two-component sensor  29.76 
 
 		 471 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0538735  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1236  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.18 
 
 		 350 aa  95.9  1e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1842  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  28.46 
 
 		 456 aa  95.5  1e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000009553 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>